52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1290 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_1290  restriction endonuclease  100 
 
 		 233 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708132  normal  0.357779 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1273  restriction endonuclease  100 
 
 		 233 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1302  restriction endonuclease  98.71 
 
 		 233 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126864  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1653  restriction endonuclease  67.8 
 
 		 178 aa  231  5e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.447964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4795  restriction endonuclease  64.13 
 
 		 197 aa  209  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1622  hypothetical protein  44.83 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.792875  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  39.47 
 
 		 171 aa  94  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  38.6 
 
 		 182 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  38.6 
 
 		 182 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11051  hypothetical protein  31.62 
 
 		 289 aa  86.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.117412  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11011  hypothetical protein  32.58 
 
 		 145 aa  85.9  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6871  restriction endonuclease  39.47 
 
 		 200 aa  85.5  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11061  hypothetical protein  30.88 
 
 		 289 aa  84.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2767  restriction endonuclease  41.38 
 
 		 520 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4576  restriction endonuclease  34.26 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000197116  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4420  restriction endonuclease  37.5 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4155  restriction endonuclease  39.64 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4774  restriction endonuclease  35.95 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5241  restriction endonuclease  40.91 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.944294 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  33.04 
 
 		 421 aa  63.2  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3352  restriction endonuclease  37.89 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2800  hypothetical protein  30.09 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0352822  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3913  restriction endonuclease  41.67 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.102865 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0711  restriction endonuclease  39.13 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000595924  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  33.68 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  32.86 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5316  restriction endonuclease  37.75 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.493703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  30.05 
 
 		 368 aa  55.5  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  33.8 
 
 		 285 aa  55.1  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  37.5 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  33.15 
 
 		 250 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  30.12 
 
 		 305 aa  50.4  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  28.14 
 
 		 289 aa  48.5  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3380  restriction endonuclease  35.96 
 
 		 453 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4585  SNF2-related protein  30.17 
 
 		 1291 aa  47  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  26.97 
 
 		 287 aa  46.6  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1446  restriction endonuclease  25.52 
 
 		 328 aa  45.4  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0714463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  30.89 
 
 		 355 aa  45.4  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1848  restriction endonuclease  29.55 
 
 		 152 aa  45.1  0.0009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  29.13 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2430  putative signal transduction protein with Nacht domain  29.82 
 
 		 911 aa  45.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1431  restriction endonuclease  38.74 
 
 		 208 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.45825  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1810  restriction endonuclease  28.41 
 
 		 144 aa  43.1  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  28.16 
 
 		 125 aa  42.7  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0304  endonuclease  34.02 
 
 		 320 aa  42.7  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  27.36 
 
 		 154 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  28.89 
 
 		 345 aa  42.4  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  27.35 
 
 		 262 aa  42.4  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  27.36 
 
 		 154 aa  42  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  23.36 
 
 		 326 aa  42  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  27.36 
 
 		 154 aa  42  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1742  restriction endonuclease  32.14 
 
 		 189 aa  41.6  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.49953 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>