49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1742 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1742  restriction endonuclease  100 
 
 
189 aa  386  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11011  hypothetical protein  40 
 
 
145 aa  62.4  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  35.45 
 
 
305 aa  62  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4420  restriction endonuclease  37.25 
 
 
249 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432554  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11061  hypothetical protein  36.96 
 
 
289 aa  57.4  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4155  restriction endonuclease  36.27 
 
 
247 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4576  restriction endonuclease  30.77 
 
 
169 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000197116  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11051  hypothetical protein  35.56 
 
 
289 aa  54.7  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.117412  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  37.89 
 
 
421 aa  54.7  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  31.03 
 
 
359 aa  53.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2603  restriction endonuclease  32.67 
 
 
342 aa  53.1  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  33.33 
 
 
182 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  35.63 
 
 
182 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5241  restriction endonuclease  33.33 
 
 
260 aa  52  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.944294 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1408  restriction endonuclease  36.61 
 
 
358 aa  52  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0487902  normal  0.0918777 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1622  hypothetical protein  43.42 
 
 
207 aa  52  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.792875  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2767  restriction endonuclease  36.36 
 
 
520 aa  52  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4774  restriction endonuclease  35.29 
 
 
260 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  30.91 
 
 
171 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  35 
 
 
493 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52400  restriction endonuclease  31.68 
 
 
271 aa  50.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3360  restriction endonuclease  31.68 
 
 
330 aa  49.7  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271395  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3352  restriction endonuclease  40 
 
 
201 aa  48.9  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  30.52 
 
 
310 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  33.61 
 
 
349 aa  47.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3913  restriction endonuclease  36.36 
 
 
249 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.102865 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  30.52 
 
 
310 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  29.45 
 
 
302 aa  45.4  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  28.57 
 
 
333 aa  45.1  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  30.18 
 
 
374 aa  45.1  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6871  restriction endonuclease  30.17 
 
 
200 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1406  restriction endonuclease  33.68 
 
 
328 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000555478  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  30.97 
 
 
296 aa  43.1  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1559  restriction endonuclease  27.35 
 
 
193 aa  42.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000151262 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4933  Mrr restriction system protein  35.44 
 
 
304 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0711  restriction endonuclease  37.8 
 
 
168 aa  42.4  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000595924  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0304  endonuclease  33.33 
 
 
320 aa  42.4  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3295  restriction endonuclease  28.1 
 
 
346 aa  42.4  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.978849  normal  0.622246 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1302  restriction endonuclease  32.14 
 
 
233 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126864  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0004  restriction endonuclease  30.85 
 
 
346 aa  41.6  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.689033  hitchhiker  0.00578502 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1273  restriction endonuclease  32.14 
 
 
233 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1290  restriction endonuclease  32.14 
 
 
233 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708132  normal  0.357779 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  29.22 
 
 
305 aa  41.6  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  31.68 
 
 
302 aa  41.6  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3416  hypothetical protein  30.84 
 
 
281 aa  41.6  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  33.33 
 
 
291 aa  41.2  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1431  restriction endonuclease  30.21 
 
 
208 aa  41.2  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.45825  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  39.06 
 
 
297 aa  41.2  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5316  restriction endonuclease  33.64 
 
 
260 aa  41.2  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.493703  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>