38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1559 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_1559  restriction endonuclease  100 
 
 		 193 aa  394  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000151262 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  41.12 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  41.12 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  40.19 
 
 		 154 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  40.19 
 
 		 125 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3416  hypothetical protein  33.64 
 
 		 281 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  27.98 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  27.1 
 
 		 285 aa  61.2  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  36.61 
 
 		 349 aa  61.2  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  29.84 
 
 		 355 aa  57.8  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  31.53 
 
 		 262 aa  54.3  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  30.91 
 
 		 421 aa  52.4  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  26.83 
 
 		 230 aa  52  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  32.43 
 
 		 493 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  27.43 
 
 		 326 aa  50.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  26.02 
 
 		 440 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  35.8 
 
 		 289 aa  49.3  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  26.05 
 
 		 327 aa  49.7  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  35.59 
 
 		 312 aa  49.7  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  33.86 
 
 		 333 aa  48.9  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1365  Mrr restriction system protein, putative  27.69 
 
 		 348 aa  48.1  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.451451  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 305 aa  47.4  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0200  restriction endonuclease  30 
 
 		 403 aa  47.4  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3732  restriction endonuclease  35.38 
 
 		 272 aa  47  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.389352  normal  0.0107357 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  23.53 
 
 		 585 aa  47  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  29.46 
 
 		 291 aa  45.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  31.3 
 
 		 299 aa  45.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  30 
 
 		 374 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1379  restriction endonuclease  28.69 
 
 		 310 aa  45.1  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  33.06 
 
 		 305 aa  45.1  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  36.36 
 
 		 302 aa  44.3  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  34.43 
 
 		 305 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  29.36 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1996  Mrr restriction system protein-like  27.73 
 
 		 447 aa  43.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00366255  normal  0.311144 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1742  restriction endonuclease  27.35 
 
 		 189 aa  42.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  27.21 
 
 		 301 aa  43.1  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2379  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  27.74 
 
 		 300 aa  41.6  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>