50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1302 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1302  restriction endonuclease  100 
 
 
233 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126864  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1273  restriction endonuclease  98.71 
 
 
233 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1290  restriction endonuclease  98.71 
 
 
233 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708132  normal  0.357779 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1653  restriction endonuclease  66.67 
 
 
178 aa  228  5e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.447964  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4795  restriction endonuclease  63.59 
 
 
197 aa  207  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1622  hypothetical protein  44.83 
 
 
207 aa  103  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.792875  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  38.6 
 
 
171 aa  92  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  38.6 
 
 
182 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11051  hypothetical protein  32.35 
 
 
289 aa  88.6  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.117412  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  38.6 
 
 
182 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11011  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  87.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11061  hypothetical protein  31.62 
 
 
289 aa  86.3  4e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6871  restriction endonuclease  39.47 
 
 
200 aa  85.9  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2767  restriction endonuclease  41.38 
 
 
520 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4576  restriction endonuclease  34.26 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000197116  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4420  restriction endonuclease  37.5 
 
 
249 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432554  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4155  restriction endonuclease  39.64 
 
 
247 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5241  restriction endonuclease  40.91 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.944294 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4774  restriction endonuclease  40.87 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  33.93 
 
 
421 aa  65.1  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3352  restriction endonuclease  37.89 
 
 
201 aa  61.2  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0711  restriction endonuclease  39.13 
 
 
168 aa  59.7  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000595924  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2800  hypothetical protein  30.09 
 
 
313 aa  58.9  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0352822  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  33.57 
 
 
271 aa  58.5  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3913  restriction endonuclease  40.74 
 
 
249 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.102865 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5316  restriction endonuclease  41.23 
 
 
260 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.493703  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  33.68 
 
 
359 aa  56.2  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  33.8 
 
 
285 aa  55.5  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  29.7 
 
 
368 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  38.05 
 
 
222 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  31.33 
 
 
305 aa  52.4  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  28.14 
 
 
289 aa  49.3  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  32.58 
 
 
250 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3380  restriction endonuclease  35.96 
 
 
453 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4585  SNF2-related protein  30.17 
 
 
1291 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1446  restriction endonuclease  26.21 
 
 
328 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0714463  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  26.97 
 
 
287 aa  47  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  30.39 
 
 
252 aa  47  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1848  restriction endonuclease  29.55 
 
 
152 aa  45.4  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  30.89 
 
 
355 aa  45.4  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2430  putative signal transduction protein with Nacht domain  30.36 
 
 
911 aa  45.1  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1431  restriction endonuclease  38.74 
 
 
208 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.45825  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0304  endonuclease  34.02 
 
 
320 aa  43.1  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1810  restriction endonuclease  28.41 
 
 
144 aa  43.1  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  27.35 
 
 
262 aa  42.4  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  23.36 
 
 
326 aa  42.4  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3258  restriction endonuclease  29.13 
 
 
454 aa  42  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  31.08 
 
 
345 aa  42  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  29.92 
 
 
291 aa  41.6  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1742  restriction endonuclease  32.14 
 
 
189 aa  41.6  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.49953 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>