23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1848 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1848  restriction endonuclease  100 
 
 		 152 aa  301  2.0000000000000002e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1810  restriction endonuclease  95.83 
 
 		 144 aa  276  6e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3352  restriction endonuclease  39.74 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4420  restriction endonuclease  29.2 
 
 		 249 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1622  hypothetical protein  38.18 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.792875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  27.27 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  25.6 
 
 		 182 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  34.09 
 
 		 171 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4155  restriction endonuclease  32.14 
 
 		 247 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  30.77 
 
 		 493 aa  48.9  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4576  restriction endonuclease  28.18 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000197116  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1542  restriction endonuclease  38.96 
 
 		 184 aa  47  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1302  restriction endonuclease  29.55 
 
 		 233 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126864  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  27.38 
 
 		 305 aa  45.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1290  restriction endonuclease  29.55 
 
 		 233 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708132  normal  0.357779 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1273  restriction endonuclease  29.55 
 
 		 233 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4795  restriction endonuclease  25.93 
 
 		 197 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1431  restriction endonuclease  29.87 
 
 		 208 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.45825  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  32.98 
 
 		 291 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  30.93 
 
 		 301 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 359 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1653  restriction endonuclease  27.84 
 
 		 178 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.447964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  34.52 
 
 		 493 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>