80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2498 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  100 
 
 		 493 aa  991    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7063  restriction endonuclease  35.31 
 
 		 664 aa  159  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  35.86 
 
 		 585 aa  153  5e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2349  hypothetical protein  33.33 
 
 		 292 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.261771 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  34.07 
 
 		 421 aa  77.8  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0156  hypothetical protein  29.69 
 
 		 363 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  35.48 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  35.04 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  32.17 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  30.94 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  33.62 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  35.07 
 
 		 154 aa  64.7  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  35.07 
 
 		 154 aa  64.7  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  30.22 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  35.9 
 
 		 125 aa  64.3  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  35.07 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  30.83 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  33.05 
 
 		 182 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  36.29 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  29.66 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  30.23 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0538  restriction endonuclease  36.94 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  35.23 
 
 		 374 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1542  restriction endonuclease  34.88 
 
 		 184 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  30.23 
 
 		 310 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  34.71 
 
 		 493 aa  58.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  28.57 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  32.23 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  30.51 
 
 		 305 aa  57  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  36.89 
 
 		 310 aa  57  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  32.79 
 
 		 312 aa  56.2  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3416  hypothetical protein  33.04 
 
 		 281 aa  56.6  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  36.43 
 
 		 287 aa  56.6  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1502  restriction endonuclease  33.59 
 
 		 307 aa  55.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677027  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01945  hypothetical protein  35.29 
 
 		 386 aa  55.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  32.79 
 
 		 293 aa  54.7  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  34.43 
 
 		 374 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  30.7 
 
 		 302 aa  53.5  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  34.71 
 
 		 291 aa  53.5  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1365  Mrr restriction system protein, putative  33.04 
 
 		 348 aa  53.5  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.451451  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  32.17 
 
 		 299 aa  53.5  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3985  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  33.33 
 
 		 323 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3871  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  33.33 
 
 		 323 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  30.95 
 
 		 302 aa  52.8  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  33.9 
 
 		 327 aa  52.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6246  hypothetical protein  29.55 
 
 		 384 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243326  normal  0.363078 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  35.83 
 
 		 289 aa  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  33.9 
 
 		 440 aa  52.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0200  restriction endonuclease  32.67 
 
 		 403 aa  52.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  32.31 
 
 		 349 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  26.72 
 
 		 303 aa  51.6  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04183  hypothetical protein  33.58 
 
 		 304 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3646  restriction endonuclease  33.58 
 
 		 304 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04217  methylated adenine and cytosine restriction protein  33.58 
 
 		 304 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1559  restriction endonuclease  32.43 
 
 		 193 aa  50.4  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000151262 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  32.48 
 
 		 355 aa  50.1  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4933  Mrr restriction system protein  37.31 
 
 		 304 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  30.77 
 
 		 262 aa  49.7  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5580  hypothetical protein  24.81 
 
 		 352 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7364  putative Mrr restriction system protein  31.86 
 
 		 400 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00238713  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1742  restriction endonuclease  35 
 
 		 189 aa  49.3  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2785  restriction endonuclease  32.26 
 
 		 305 aa  49.3  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  33.91 
 
 		 271 aa  48.9  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4209  restriction endonuclease  31.09 
 
 		 311 aa  48.9  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000116308 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3186  Mrr restriction system protein  32.26 
 
 		 305 aa  49.3  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3295  restriction endonuclease  34.45 
 
 		 346 aa  47.4  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.978849  normal  0.622246 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  27.9 
 
 		 285 aa  46.6  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  23.74 
 
 		 305 aa  45.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  35.71 
 
 		 368 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3899  restriction endonuclease  36.67 
 
 		 313 aa  46.2  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  0.0281314 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2767  restriction endonuclease  32.35 
 
 		 520 aa  45.8  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1622  hypothetical protein  28.47 
 
 		 207 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.792875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0488  restriction endonuclease  34.31 
 
 		 317 aa  45.8  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1379  restriction endonuclease  32.79 
 
 		 310 aa  44.7  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  35.48 
 
 		 359 aa  44.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  26.79 
 
 		 333 aa  44.7  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3913  restriction endonuclease  33.02 
 
 		 249 aa  43.9  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.102865 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2379  hypothetical protein  31.52 
 
 		 196 aa  43.9  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1132  restriction endonuclease  34.13 
 
 		 454 aa  43.5  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>