49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4420 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4420  restriction endonuclease  100 
 
 		 249 aa  478  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4155  restriction endonuclease  84.43 
 
 		 247 aa  368  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4774  restriction endonuclease  59.18 
 
 		 260 aa  267  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5241  restriction endonuclease  58.78 
 
 		 260 aa  265  7e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.944294 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5316  restriction endonuclease  60.68 
 
 		 260 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.493703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3913  restriction endonuclease  58.63 
 
 		 249 aa  217  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.102865 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11011  hypothetical protein  42.31 
 
 		 145 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11061  hypothetical protein  40 
 
 		 289 aa  98.2  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11051  hypothetical protein  39.05 
 
 		 289 aa  95.5  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.117412  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3352  restriction endonuclease  47.17 
 
 		 201 aa  95.5  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2767  restriction endonuclease  45.83 
 
 		 520 aa  92.4  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  43.81 
 
 		 171 aa  92  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  40.38 
 
 		 182 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  39.42 
 
 		 182 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1622  hypothetical protein  39.25 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.792875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6871  restriction endonuclease  43.56 
 
 		 200 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4795  restriction endonuclease  41.18 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4576  restriction endonuclease  40 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000197116  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1302  restriction endonuclease  37.5 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126864  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1290  restriction endonuclease  40.38 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708132  normal  0.357779 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1273  restriction endonuclease  40.38 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  43.37 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1653  restriction endonuclease  41.18 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.447964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  41.12 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  35.71 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1742  restriction endonuclease  37.25 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2800  hypothetical protein  34.48 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0352822  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  29.76 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  40.24 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  28.71 
 
 		 421 aa  55.5  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1848  restriction endonuclease  29.2 
 
 		 152 aa  54.3  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1810  restriction endonuclease  32.14 
 
 		 144 aa  52.8  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  34 
 
 		 364 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  32.38 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3295  restriction endonuclease  33.61 
 
 		 346 aa  47.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.978849  normal  0.622246 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2939  SNF2-related protein  33.63 
 
 		 1131 aa  47  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1010  SNF2-related protein  29.41 
 
 		 1248 aa  47  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4585  SNF2-related protein  31.62 
 
 		 1291 aa  45.8  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1446  restriction endonuclease  29.46 
 
 		 328 aa  45.8  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0714463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  33.68 
 
 		 291 aa  45.4  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  31 
 
 		 285 aa  44.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  29.73 
 
 		 345 aa  44.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  27.37 
 
 		 440 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  26 
 
 		 327 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  30.63 
 
 		 493 aa  43.5  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0488  restriction endonuclease  30.56 
 
 		 317 aa  43.1  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  24.17 
 
 		 326 aa  42.7  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0041  hypothetical protein  26.67 
 
 		 338 aa  42  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.777357  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  28.71 
 
 		 585 aa  42  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>