21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1810 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1810  restriction endonuclease  100 
 
 		 144 aa  286  5.0000000000000004e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1848  restriction endonuclease  96.27 
 
 		 152 aa  258  2e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3352  restriction endonuclease  38.46 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1622  hypothetical protein  36.7 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.792875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  26.67 
 
 		 182 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  27.5 
 
 		 182 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4420  restriction endonuclease  32.14 
 
 		 249 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432554  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  35 
 
 		 171 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4155  restriction endonuclease  32.14 
 
 		 247 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4576  restriction endonuclease  30.93 
 
 		 169 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000197116  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  29.67 
 
 		 493 aa  47.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1542  restriction endonuclease  38.2 
 
 		 184 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  28.57 
 
 		 305 aa  47  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4795  restriction endonuclease  27.08 
 
 		 197 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1302  restriction endonuclease  28.41 
 
 		 233 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126864  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1290  restriction endonuclease  28.41 
 
 		 233 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708132  normal  0.357779 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1273  restriction endonuclease  28.41 
 
 		 233 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1431  restriction endonuclease  29.87 
 
 		 208 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.45825  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1653  restriction endonuclease  28.12 
 
 		 178 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.447964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  31.33 
 
 		 359 aa  41.2  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  31.76 
 
 		 368 aa  40.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>