88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4245 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  100 
 
 		 368 aa  735    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  59.4 
 
 		 364 aa  376  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  48.16 
 
 		 359 aa  283  5.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0391  SH3 type 3 domain-containing protein  49.52 
 
 		 510 aa  99.4  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744307 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1153  SH3 type 3 domain-containing protein  57.75 
 
 		 509 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3956  SH3 type 3 domain-containing protein  42.11 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  29.44 
 
 		 250 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  29.63 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  36.07 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  31.11 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3630  SH3 type 3 domain-containing protein  44.93 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  40 
 
 		 421 aa  62  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  35.09 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  28.87 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2767  restriction endonuclease  33.04 
 
 		 520 aa  60.1  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3597  SH3 type 3 domain-containing protein  43.66 
 
 		 406 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.400184  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1255  restriction endonuclease  30.36 
 
 		 498 aa  59.3  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.185862  normal  0.543832 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  41.41 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  31.75 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4576  restriction endonuclease  31.62 
 
 		 169 aa  57.4  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000197116  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  26.9 
 
 		 182 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4420  restriction endonuclease  40.24 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  34.09 
 
 		 349 aa  56.6  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  32.06 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  31.76 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  36.73 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1431  restriction endonuclease  41.11 
 
 		 208 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.45825  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1873  restriction endonuclease  34.58 
 
 		 297 aa  55.5  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  28.32 
 
 		 289 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2515  restriction endonuclease  37 
 
 		 237 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  33.88 
 
 		 306 aa  55.1  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 312 aa  54.7  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11051  hypothetical protein  31.58 
 
 		 289 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.117412  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4155  restriction endonuclease  40.24 
 
 		 247 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1290  restriction endonuclease  30.05 
 
 		 233 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708132  normal  0.357779 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1273  restriction endonuclease  30.05 
 
 		 233 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1502  restriction endonuclease  40.4 
 
 		 307 aa  53.5  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677027  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11011  hypothetical protein  31.58 
 
 		 145 aa  53.5  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  28.95 
 
 		 349 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1615  restriction endonuclease  37.61 
 
 		 288 aa  53.1  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3744  restriction endonuclease  35.9 
 
 		 291 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.208515 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5241  restriction endonuclease  37.8 
 
 		 260 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.944294 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3690  restriction endonuclease  35.9 
 
 		 291 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4774  restriction endonuclease  37.8 
 
 		 260 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5168  restriction endonuclease  34.51 
 
 		 799 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.440558 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0977  SH3 type 3 domain protein  34.94 
 
 		 413 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00363101  normal  0.0377328 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1503  restriction endonuclease  34.51 
 
 		 799 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.307536  normal  0.0187368 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  37.97 
 
 		 252 aa  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11061  hypothetical protein  31.58 
 
 		 289 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3416  hypothetical protein  37.36 
 
 		 281 aa  51.2  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1412  type III restriction protein res subunit  38.55 
 
 		 556 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00105152  normal  0.0540272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1302  restriction endonuclease  31.93 
 
 		 233 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126864  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4639  restriction endonuclease  34.65 
 
 		 286 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000167857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1653  restriction endonuclease  29.65 
 
 		 178 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.447964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  30.33 
 
 		 287 aa  49.7  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  34.34 
 
 		 171 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1132  restriction endonuclease  40.16 
 
 		 454 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3319  SH3 type 3 domain-containing protein  38 
 
 		 321 aa  47.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3899  restriction endonuclease  35.78 
 
 		 313 aa  47  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  0.0281314 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  30.23 
 
 		 305 aa  46.6  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4795  restriction endonuclease  31.03 
 
 		 197 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  29.7 
 
 		 302 aa  46.6  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  31.93 
 
 		 296 aa  46.2  0.0008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0159  SH3 type 3 domain protein  30.43 
 
 		 350 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.333454  normal  0.0117135 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  30.12 
 
 		 230 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  29.55 
 
 		 293 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2861  SH3 type 3 domain protein  33.94 
 
 		 147 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000301098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  29.63 
 
 		 297 aa  46.2  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0680  restriction endonuclease  28.83 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  34.17 
 
 		 493 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  30.58 
 
 		 305 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  39.71 
 
 		 585 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  27.03 
 
 		 262 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1379  restriction endonuclease  31.97 
 
 		 310 aa  45.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3352  restriction endonuclease  32.61 
 
 		 201 aa  45.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3186  Mrr restriction system protein  43.48 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2785  restriction endonuclease  43.48 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  31.11 
 
 		 493 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  31.78 
 
 		 285 aa  43.9  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1565  restriction endonuclease  30.43 
 
 		 290 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.380893 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1446  restriction endonuclease  28.57 
 
 		 328 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0714463  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  29.85 
 
 		 305 aa  43.5  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  30.77 
 
 		 302 aa  43.5  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1542  restriction endonuclease  28.06 
 
 		 184 aa  43.5  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0036  restriction endonuclease  39.66 
 
 		 325 aa  43.1  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3007  restriction endonuclease  31.78 
 
 		 454 aa  43.1  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  38.98 
 
 		 1281 aa  42.7  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5316  restriction endonuclease  39.02 
 
 		 260 aa  42.7  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.493703  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>