74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3319 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3319  SH3 type 3 domain-containing protein  100 
 
 
321 aa  629  1e-179  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0159  SH3 type 3 domain protein  37.79 
 
 
350 aa  197  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.333454  normal  0.0117135 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1562  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.83 
 
 
370 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.544381  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3413  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.89 
 
 
369 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0728578  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  47.73 
 
 
214 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.12 
 
 
221 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3626  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  47.62 
 
 
476 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000133632  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.84 
 
 
232 aa  57.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  55.07 
 
 
192 aa  57  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1669  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.29 
 
 
173 aa  57  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  46.27 
 
 
208 aa  56.6  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  45.16 
 
 
510 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  27.88 
 
 
1094 aa  53.9  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  41.46 
 
 
493 aa  53.5  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.96 
 
 
313 aa  53.1  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.96 
 
 
200 aa  52.8  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  49.12 
 
 
501 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  45.21 
 
 
524 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.29 
 
 
1343 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.11 
 
 
180 aa  50.4  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  34.02 
 
 
958 aa  50.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  50 
 
 
1438 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  47.54 
 
 
395 aa  49.3  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0001  bacteriocin  40 
 
 
879 aa  48.9  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  37.5 
 
 
644 aa  49.3  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.5 
 
 
907 aa  48.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  30.38 
 
 
536 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  41.46 
 
 
959 aa  47.4  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  43.01 
 
 
1139 aa  47.4  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.79 
 
 
323 aa  47  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0285  hypothetical protein  35.59 
 
 
446 aa  47.4  0.0004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0121761  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  43.66 
 
 
490 aa  46.6  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3316  putative lipoprotein  38.46 
 
 
148 aa  47  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  48.65 
 
 
666 aa  47  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2929  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.16 
 
 
213 aa  46.6  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2744  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.63 
 
 
121 aa  46.6  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.73 
 
 
1181 aa  46.6  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2826  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.56 
 
 
157 aa  46.2  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0346  SCP-like extracellular  38.3 
 
 
261 aa  45.8  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.557826  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  36.21 
 
 
503 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0286  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.58 
 
 
545 aa  44.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933039  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  38.6 
 
 
532 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01485  peptidase  37.5 
 
 
377 aa  45.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  37.5 
 
 
1224 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.73 
 
 
399 aa  44.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2380  hypothetical protein  35.29 
 
 
163 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0610  peptidase M23B  40.68 
 
 
383 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000136568  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0577  PBS lyase HEAT domain-containing protein repeat-containing protein  35.62 
 
 
218 aa  43.9  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.166328  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0477  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.38 
 
 
377 aa  44.3  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  44.44 
 
 
431 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3369  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  35.85 
 
 
432 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000232864  unclonable  2.00404e-25 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6151  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.25 
 
 
321 aa  43.9  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  38.33 
 
 
424 aa  44.3  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  36.84 
 
 
532 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2948  Allergen V5/Tpx-1 related  38.98 
 
 
280 aa  43.9  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  52.17 
 
 
176 aa  44.3  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1769  NLP/P60 family protein  35.85 
 
 
420 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000165376  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2059  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  35.85 
 
 
426 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000850665  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1959  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  35.85 
 
 
413 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1788  SH3 type 3 domain-containing protein  39.62 
 
 
158 aa  43.9  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.292681  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1934  SH3 type 3 domain protein  39.62 
 
 
158 aa  43.9  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.890926  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2037  NLP/P60 family protein  35.85 
 
 
426 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000532667  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2463  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.28 
 
 
224 aa  43.5  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2693  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.53 
 
 
616 aa  43.5  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17431  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3187  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.94 
 
 
474 aa  43.5  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4552  peptidase, M23/M37 family  38.6 
 
 
384 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000312233  normal  0.0469454 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  33.33 
 
 
370 aa  43.1  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1627  SpoIID/LytB domain protein  32.39 
 
 
625 aa  43.1  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.637153  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2137  Peptidase M23  35.14 
 
 
466 aa  42.7  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000635965 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.59 
 
 
483 aa  42.7  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.722344  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4762  HEAT repeat-containing PBS lyase  45.59 
 
 
223 aa  42.7  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122338  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4403  SH3 type 3 domain-containing protein  34.62 
 
 
353 aa  42.4  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.522087  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0631  bacteriocin  33.33 
 
 
356 aa  42.4  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.420339  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1940  SH3 type 3 domain-containing protein  39.13 
 
 
522 aa  42.4  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>