More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01485 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01485  peptidase  100 
 
 		 377 aa  770    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6234  Peptidase M23  33.6 
 
 		 446 aa  226  7e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4508  Peptidase M23  34.4 
 
 		 392 aa  188  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.487012 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01987  peptidase  47.14 
 
 		 204 aa  114  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3409  Peptidase M23  48.06 
 
 		 183 aa  113  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2214  peptidase M23B  52.59 
 
 		 198 aa  108  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.250038 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1921  metallopeptidase peptidase  51.72 
 
 		 196 aa  107  5e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318807 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0146  Peptidase M23  44.78 
 
 		 230 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2227  peptidase M23B  47.01 
 
 		 172 aa  103  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2717  Peptidase M23  45.26 
 
 		 272 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000153286  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0489  peptidase M23B  46.49 
 
 		 194 aa  95.5  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1360  Peptidase M23  31.7 
 
 		 348 aa  90.9  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.119813  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3569  peptidase M23B  41.94 
 
 		 328 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0123  peptidase, M23/M37 family  41.46 
 
 		 327 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0859179  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4699  M24/M37 family peptidase  41.46 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0776348  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5077  peptidase, M23/M37 family  40.65 
 
 		 327 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5110  M24/M37 family peptidase  40.65 
 
 		 327 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4841  M24/M37 family peptidase  40.65 
 
 		 333 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.024057  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4683  M24/M37 family peptidase  40.65 
 
 		 333 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5115  peptidase, M23/M37 family  40.65 
 
 		 327 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000714252  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4797  peptidase M23B  40.65 
 
 		 327 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0231137  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5206  M23/37 family peptidase  40.65 
 
 		 327 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5117  peptidase, M23/M37 family  40.65 
 
 		 327 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00753294  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0616  peptidase M23B  38.76 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137898  hitchhiker  0.00000225062 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3584  peptidase M23B  37.61 
 
 		 174 aa  80.5  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  29.03 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1006  Peptidase M23  32.35 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3804  peptidase M23B  37.68 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.019155 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4420  M24/M37 family peptidase  44.74 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4752  Peptidase M23  36.09 
 
 		 458 aa  76.6  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.817263  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  42.99 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  36.15 
 
 		 727 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  36.15 
 
 		 727 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  36.43 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  42.48 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  36.64 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2621  M24/M37 family peptidase  42.86 
 
 		 350 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  39.47 
 
 		 754 aa  74.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  30.92 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  36.04 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3990  peptidase M23B  37.01 
 
 		 181 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73200  hypothetical protein  37.32 
 
 		 169 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  33.93 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2938  M24/M37 family peptidase  42.86 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  37.69 
 
 		 751 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  35.04 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2907  Peptidase M23  35.17 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0940  Peptidase M23  31.87 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252904  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0435  Peptidase M23  38.46 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0097  peptidase M23B  35.07 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  34.88 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0403  peptidase M23B  42.98 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00242182  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  34.85 
 
 		 590 aa  73.2  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3052  Peptidase M23  35.97 
 
 		 329 aa  72.8  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3518  Peptidase M23  33.81 
 
 		 406 aa  72.8  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  38.94 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000497391  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  38.94 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000737786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  42.98 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  34.42 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3011  Peptidase M23  34.46 
 
 		 223 aa  72.4  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0127254 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  38.94 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  36.43 
 
 		 325 aa  72.4  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  38.94 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  38.94 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  38.94 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000381632  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  42.98 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  34.62 
 
 		 824 aa  72.4  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0288  peptidase M23B  42.98 
 
 		 170 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254683  hitchhiker  0.00000000102715 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1590  Peptidase M23  40.54 
 
 		 390 aa  72.4  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0288  peptidase M23B  42.98 
 
 		 170 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00195161  decreased coverage  0.00000000176689 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  38.94 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01815  hypothetical protein  38.94 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01827  predicted peptidase  38.94 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000774309  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2044  Peptidase M23  36.92 
 
 		 272 aa  72  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2425  hypothetical protein  38.94 
 
 		 439 aa  72  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000232327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1828  hypothetical protein  38.94 
 
 		 440 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000168261  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3858  cell wall endopeptidase, family M23/M37  38.18 
 
 		 424 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000135417  hitchhiker  0.00000000000537806 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  33.09 
 
 		 320 aa  72  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  42.98 
 
 		 437 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  35.54 
 
 		 286 aa  72  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  39.82 
 
 		 440 aa  71.6  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2112  hypothetical protein  38.94 
 
 		 441 aa  72  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000011239  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2318  LysM/M23/M37 peptidase  40.68 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.234924  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  33.33 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  33.12 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1486  cell wall endopeptidase, family M23/M37  38.18 
 
 		 421 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0732  M24/M37 family peptidase  36.73 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.056304  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  28.09 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1234  hypothetical protein  37.17 
 
 		 439 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00307381  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2104  hypothetical protein  37.17 
 
 		 439 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.391602  normal  0.665324 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2044  hypothetical protein  37.17 
 
 		 439 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.713076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2049  hypothetical protein  37.17 
 
 		 439 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245619  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1358  hypothetical protein  37.17 
 
 		 439 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370523 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  37.09 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3705  peptidase M23B  30.72 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  38.69 
 
 		 425 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  34.04 
 
 		 447 aa  70.1  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  39.09 
 
 		 445 aa  70.1  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  34.04 
 
 		 447 aa  70.1  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  43.48 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>