More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1006 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1006  Peptidase M23  100 
 
 		 270 aa  543  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  44.88 
 
 		 300 aa  102  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  41.86 
 
 		 430 aa  96.3  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  38.52 
 
 		 273 aa  96.3  5e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  32.07 
 
 		 285 aa  96.3  5e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  38.52 
 
 		 244 aa  95.9  6e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2895  Peptidase M23  39.85 
 
 		 199 aa  95.5  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351071  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  47.96 
 
 		 349 aa  95.1  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  38.06 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  44.35 
 
 		 452 aa  93.2  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  40.48 
 
 		 358 aa  91.7  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  38.36 
 
 		 282 aa  91.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  38.89 
 
 		 336 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  38.58 
 
 		 301 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  37.5 
 
 		 450 aa  90.5  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  38.19 
 
 		 439 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  44 
 
 		 456 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  40.62 
 
 		 491 aa  90.1  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  48.11 
 
 		 448 aa  89.7  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  44.26 
 
 		 459 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  43.2 
 
 		 457 aa  89.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  36.73 
 
 		 440 aa  89  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  39.06 
 
 		 447 aa  88.6  9e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  39.86 
 
 		 391 aa  89  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  39.06 
 
 		 447 aa  88.6  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  38.36 
 
 		 318 aa  89  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  41.09 
 
 		 316 aa  88.6  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  40.62 
 
 		 446 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  37.43 
 
 		 392 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  42.31 
 
 		 727 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  40.74 
 
 		 475 aa  88.2  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  39.53 
 
 		 442 aa  88.2  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  43.14 
 
 		 751 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  42.31 
 
 		 727 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  40.74 
 
 		 491 aa  87.4  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14641  LysM motif-containing protein  37.01 
 
 		 360 aa  87.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.318084 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  39.81 
 
 		 475 aa  87.8  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  34.42 
 
 		 229 aa  87.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4508  Peptidase M23  39.82 
 
 		 392 aa  85.9  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.487012 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  40.58 
 
 		 392 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  39.37 
 
 		 333 aa  85.5  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  37.82 
 
 		 440 aa  85.9  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  35.86 
 
 		 468 aa  85.9  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  35.86 
 
 		 468 aa  85.5  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  35.86 
 
 		 468 aa  85.5  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4435  Peptidase M23  40.5 
 
 		 308 aa  85.5  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  40.74 
 
 		 470 aa  85.5  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  35.86 
 
 		 468 aa  85.5  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  35.19 
 
 		 300 aa  85.5  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  39.26 
 
 		 288 aa  85.5  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  41.67 
 
 		 482 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  38.89 
 
 		 248 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2250  hypothetical protein  36.54 
 
 		 470 aa  85.1  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0038093  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  41.46 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  39.84 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  39.02 
 
 		 441 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  35.86 
 
 		 466 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  33.7 
 
 		 195 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  35.86 
 
 		 466 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1888  Peptidase M23  40.58 
 
 		 511 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000847553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  41.6 
 
 		 453 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  36.76 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  40.44 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  40.74 
 
 		 468 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  45.54 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  42.52 
 
 		 411 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2112  hypothetical protein  41.03 
 
 		 441 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000011239  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  42.62 
 
 		 414 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  45.54 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1828  hypothetical protein  40.17 
 
 		 440 aa  83.6  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000168261  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  45.54 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0898  peptidase M23B  39.68 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.206308 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  38.58 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  40.2 
 
 		 754 aa  83.2  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  29.95 
 
 		 326 aa  83.2  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  37.21 
 
 		 445 aa  82.8  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3063  peptidase M23B  35.43 
 
 		 377 aa  82.8  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000502081  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  39.1 
 
 		 412 aa  82.8  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  38.21 
 
 		 431 aa  82.8  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  39.81 
 
 		 491 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  28.11 
 
 		 269 aa  82.8  0.000000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  40.19 
 
 		 462 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  42.42 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2026  hypothetical protein  41.74 
 
 		 438 aa  82.4  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148125  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2139  hypothetical protein  41.74 
 
 		 438 aa  82.4  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000192356  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  37.65 
 
 		 340 aa  82.4  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2416  hypothetical protein  41.74 
 
 		 410 aa  82.4  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000144361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19390  metalloendopeptidase-like membrane protein  37.98 
 
 		 287 aa  82.4  0.000000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  40 
 
 		 455 aa  82.4  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1051  peptidase M23B  35.29 
 
 		 282 aa  82  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  42.62 
 
 		 379 aa  82  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  30.97 
 
 		 288 aa  82  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  37.04 
 
 		 512 aa  82  0.000000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2141  hypothetical protein  36.75 
 
 		 486 aa  81.6  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000028881  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  40.16 
 
 		 440 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01815  hypothetical protein  40.16 
 
 		 440 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1358  hypothetical protein  39.34 
 
 		 439 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370523 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1234  hypothetical protein  39.34 
 
 		 439 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00307381  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2049  hypothetical protein  39.34 
 
 		 439 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245619  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  33.33 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>