More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_19390 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_19390  metalloendopeptidase-like membrane protein  100 
 
 
287 aa  568  1e-161  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20310  metalloendopeptidase-like membrane protein  52 
 
 
446 aa  132  9e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  53.85 
 
 
399 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  53.85 
 
 
399 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1270  peptidase M23B  47.66 
 
 
419 aa  122  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  46.9 
 
 
441 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1037  Peptidase M23  46.46 
 
 
477 aa  119  7.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501943  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0866  Peptidase M23  46.28 
 
 
489 aa  118  9e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.329722  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  48.36 
 
 
411 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  46.4 
 
 
676 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  46.4 
 
 
681 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25170  metalloendopeptidase-like membrane protein  47.24 
 
 
462 aa  116  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  44.8 
 
 
697 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  43.66 
 
 
527 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  49.21 
 
 
431 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  44.8 
 
 
697 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  44.8 
 
 
699 aa  113  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  46.4 
 
 
674 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  49.14 
 
 
429 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  42.62 
 
 
665 aa  110  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  52.83 
 
 
314 aa  110  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0558  peptidase M23B  50.43 
 
 
445 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.926866  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  41.84 
 
 
524 aa  108  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  44.27 
 
 
440 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  47.58 
 
 
569 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  44.8 
 
 
287 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  44.27 
 
 
440 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  44.92 
 
 
695 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  44.27 
 
 
437 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  44.29 
 
 
375 aa  107  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  34.45 
 
 
376 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0074  peptidase M23B  47.11 
 
 
513 aa  107  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5408  Peptidase M23  43.94 
 
 
538 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252675  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  41.6 
 
 
615 aa  106  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  44.19 
 
 
392 aa  105  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  44.44 
 
 
490 aa  105  8e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1246  Peptidase M23  43.8 
 
 
446 aa  105  9e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  43.57 
 
 
454 aa  104  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3043  peptidase M23B  41.6 
 
 
621 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1905  peptidase M23B  41.6 
 
 
683 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0809274  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  42.42 
 
 
377 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  43.41 
 
 
392 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  44.96 
 
 
453 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3929  peptidase M23B  46.34 
 
 
319 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  42.14 
 
 
455 aa  103  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2398  Peptidase M23  45.45 
 
 
474 aa  103  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0487248 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  45 
 
 
656 aa  102  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  43.8 
 
 
692 aa  102  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  38.26 
 
 
465 aa  102  6e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0912  Peptidase M23  48.7 
 
 
276 aa  102  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.677753 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  41.46 
 
 
375 aa  102  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  45.9 
 
 
340 aa  101  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  42.96 
 
 
430 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  42.4 
 
 
690 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  36.72 
 
 
375 aa  100  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  43.17 
 
 
459 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  43.41 
 
 
455 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  41.6 
 
 
695 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  44.96 
 
 
456 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  33.49 
 
 
379 aa  99.4  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  43.55 
 
 
423 aa  99  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  45 
 
 
460 aa  99  7e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2835  putative transmembrane protein  51.38 
 
 
321 aa  99  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.499363  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  44.26 
 
 
533 aa  99  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  46.15 
 
 
402 aa  98.6  9e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2715  Peptidase M23  50.46 
 
 
320 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.795153  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  43.1 
 
 
288 aa  98.6  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  40 
 
 
680 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  41.61 
 
 
472 aa  98.6  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3080  Peptidase M23  50.46 
 
 
321 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.387864  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  34.92 
 
 
271 aa  97.4  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  29.8 
 
 
400 aa  97.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  43.41 
 
 
457 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0696  Peptidase M23  37.23 
 
 
487 aa  97.4  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  39.2 
 
 
681 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  41.6 
 
 
687 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  41.73 
 
 
491 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  41.73 
 
 
468 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  41.73 
 
 
468 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  41.78 
 
 
448 aa  97.1  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  39.44 
 
 
468 aa  97.1  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  48.11 
 
 
332 aa  96.7  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  33.8 
 
 
374 aa  96.7  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  43.1 
 
 
465 aa  96.7  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  39.44 
 
 
468 aa  96.7  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0795  peptidase M23B  48.7 
 
 
253 aa  96.7  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  41.73 
 
 
468 aa  96.7  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  42.52 
 
 
417 aa  96.3  5e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  32.8 
 
 
404 aa  96.3  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  33.57 
 
 
391 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  39.42 
 
 
498 aa  95.9  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  41.73 
 
 
466 aa  95.9  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  41.18 
 
 
439 aa  95.5  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  47.66 
 
 
328 aa  95.5  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  40 
 
 
676 aa  95.9  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  42.97 
 
 
377 aa  95.5  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  42.4 
 
 
445 aa  95.5  8e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4531  Peptidase M23  45.16 
 
 
137 aa  95.5  9e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.45926 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  40.62 
 
 
313 aa  95.5  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1795  M24/M37 family peptidase  43.8 
 
 
651 aa  95.1  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000763008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>