More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0558 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0558  peptidase M23B  100 
 
 
445 aa  872    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.926866  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0696  Peptidase M23  57.64 
 
 
487 aa  244  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0795  peptidase M23B  52.33 
 
 
253 aa  178  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0912  Peptidase M23  51.16 
 
 
276 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.677753 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4454  peptidase M23B  47.67 
 
 
254 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.329906  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4531  Peptidase M23  53.91 
 
 
137 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.45926 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2398  Peptidase M23  48.59 
 
 
474 aa  114  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0487248 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  46.71 
 
 
402 aa  113  6e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  50.86 
 
 
455 aa  111  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  47.01 
 
 
695 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  37.93 
 
 
457 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  46.09 
 
 
324 aa  108  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  50 
 
 
455 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  43.45 
 
 
456 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4435  Peptidase M23  44.2 
 
 
308 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2912  peptidase M23B  41.21 
 
 
330 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  52.59 
 
 
316 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0192  Peptidase M23  44.06 
 
 
312 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19390  metalloendopeptidase-like membrane protein  50.43 
 
 
287 aa  107  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  41.67 
 
 
328 aa  107  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  38.38 
 
 
459 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  49.14 
 
 
453 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  45.67 
 
 
665 aa  105  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  46.34 
 
 
288 aa  104  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0866  Peptidase M23  45 
 
 
489 aa  103  5e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.329722  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  38.89 
 
 
674 aa  103  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3272  peptidase M23B  44.44 
 
 
459 aa  103  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.790257 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3929  peptidase M23B  49.57 
 
 
319 aa  103  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  48.74 
 
 
454 aa  103  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  49.57 
 
 
332 aa  103  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  45 
 
 
375 aa  103  9e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  50.86 
 
 
442 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  40.69 
 
 
697 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  45.16 
 
 
319 aa  102  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  49.14 
 
 
340 aa  102  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03251  peptidase, M23/M37 family protein  46.49 
 
 
292 aa  102  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  32.66 
 
 
699 aa  102  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  46.9 
 
 
423 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  46.21 
 
 
399 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  40.69 
 
 
697 aa  102  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2498  peptidase M23B  47.9 
 
 
646 aa  101  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.13296 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  45.16 
 
 
369 aa  101  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  47.83 
 
 
327 aa  101  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  46.21 
 
 
399 aa  101  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  42.52 
 
 
676 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  33.5 
 
 
681 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  45.31 
 
 
450 aa  100  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  38.89 
 
 
290 aa  100  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3520  Peptidase M23  47.06 
 
 
640 aa  99.8  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259567  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0177  peptidase M23  49.14 
 
 
298 aa  99.8  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3812  Peptidase M23  46.22 
 
 
640 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  44.53 
 
 
303 aa  99  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  37.43 
 
 
286 aa  99.4  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  43.55 
 
 
229 aa  98.6  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1905  peptidase M23B  37.97 
 
 
683 aa  98.6  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0809274  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  43.48 
 
 
325 aa  99  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  46.09 
 
 
469 aa  98.6  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  45.59 
 
 
411 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  36.36 
 
 
491 aa  97.8  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  38.25 
 
 
375 aa  98.2  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  46.81 
 
 
243 aa  98.2  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  42.24 
 
 
268 aa  97.8  3e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  53.1 
 
 
376 aa  97.4  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2663  peptidase M23B  48.78 
 
 
464 aa  97.8  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0453096  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  50.43 
 
 
394 aa  97.1  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  36.46 
 
 
392 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  41.3 
 
 
462 aa  97.1  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  44.62 
 
 
440 aa  96.7  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  44.96 
 
 
288 aa  96.7  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  44.62 
 
 
440 aa  96.7  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  44.62 
 
 
437 aa  97.1  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  44.19 
 
 
414 aa  96.7  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20310  metalloendopeptidase-like membrane protein  49.17 
 
 
446 aa  95.9  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25170  metalloendopeptidase-like membrane protein  44.17 
 
 
462 aa  96.3  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  46.81 
 
 
238 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  44.44 
 
 
387 aa  95.9  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  43.44 
 
 
233 aa  95.9  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  42.42 
 
 
274 aa  95.9  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  45.76 
 
 
318 aa  95.9  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  46.1 
 
 
238 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  38.41 
 
 
692 aa  95.1  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  47.41 
 
 
297 aa  95.1  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  45.97 
 
 
460 aa  95.1  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  39.88 
 
 
316 aa  95.5  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  43.7 
 
 
443 aa  95.5  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  44.27 
 
 
569 aa  95.1  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  45.13 
 
 
304 aa  95.5  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  37.78 
 
 
295 aa  95.1  2e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  49.15 
 
 
313 aa  94.7  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  46.67 
 
 
392 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3949  hypothetical protein  43.7 
 
 
648 aa  94.7  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2268  Peptidase M23  34.95 
 
 
344 aa  94.7  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177888  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  39.16 
 
 
475 aa  94  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  46.28 
 
 
656 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  48.28 
 
 
452 aa  94  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  49.09 
 
 
400 aa  94  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  39.86 
 
 
305 aa  94  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  49.14 
 
 
332 aa  94  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  39.44 
 
 
527 aa  94  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  44.35 
 
 
373 aa  93.6  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>