More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1370 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  100 
 
 		 273 aa  551  1e-156  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  94.36 
 
 		 266 aa  514  1.0000000000000001e-145  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  95.49 
 
 		 244 aa  479  1e-134  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  58.67 
 
 		 268 aa  326  2.0000000000000001e-88  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  50.39 
 
 		 255 aa  246  3e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  60.11 
 
 		 269 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  44.96 
 
 		 285 aa  229  3e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  40.18 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  39.29 
 
 		 300 aa  149  4e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  43.45 
 
 		 336 aa  148  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0940  Peptidase M23  37.72 
 
 		 291 aa  142  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252904  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  35.64 
 
 		 328 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  37.84 
 
 		 313 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00362  peptidase  37.78 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0922306  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  44.94 
 
 		 395 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  33.18 
 
 		 282 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0123  Peptidase M23  36.41 
 
 		 336 aa  136  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.246102 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  33.18 
 
 		 282 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  33.82 
 
 		 318 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1066  peptidase M23B  33.8 
 
 		 275 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0830638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  33.82 
 
 		 321 aa  135  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  33.82 
 
 		 319 aa  135  8e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1026  M24/M37 family peptidase  32.87 
 
 		 275 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  30.09 
 
 		 274 aa  134  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1024  peptidase M23B  32.87 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3491  peptidase M23B  32.88 
 
 		 280 aa  129  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.172269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1721  peptidase M23B  38.1 
 
 		 317 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4198  peptidase M23B  32.43 
 
 		 275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1258  peptidase M23B  34.29 
 
 		 274 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1445  peptidase, M23/M37 family  37.93 
 
 		 274 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.813249  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  38.51 
 
 		 271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0304  hypothetical protein  40.74 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  39.05 
 
 		 277 aa  127  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  40.12 
 
 		 285 aa  125  6e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2737  Peptidase M23  36.67 
 
 		 281 aa  124  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.225501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4593  peptidase M23B  36.21 
 
 		 273 aa  123  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2265  Peptidase M23  33.15 
 
 		 299 aa  122  6e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.617569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3617  Peptidase M23  35.35 
 
 		 322 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01913  metalloendopeptidase-like membrane protein  31.98 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0631175  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2044  Peptidase M23  31.96 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1296  M24/M37 family peptidase  34.65 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.492814  decreased coverage  0.0068339 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1641  Peptidase M23  37.21 
 
 		 286 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0361826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1474  peptidase M23B  33.66 
 
 		 287 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00227423  normal  0.920527 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1812  peptidase M23B  33.69 
 
 		 282 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0863419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1364  Peptidase M23  31.43 
 
 		 263 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000583534  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0622  peptidase M23B  32 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1767  peptidase M23B  33.33 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287118  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  36.78 
 
 		 290 aa  113  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1051  peptidase M23B  36.78 
 
 		 282 aa  113  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2783  peptidase M23B  32.84 
 
 		 286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2496  peptidase M23B  30.95 
 
 		 296 aa  112  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0441433  normal  0.0477862 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2470  Peptidase M23  31.31 
 
 		 332 aa  112  9e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3146  peptidase M23B  34.46 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1575  peptidase M23B  32.04 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.745708  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  33.83 
 
 		 306 aa  110  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  47.83 
 
 		 430 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2495  Peptidase M23  41.86 
 
 		 331 aa  109  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2524  peptidase M23B  30.85 
 
 		 287 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2965  putative peptidase  37.74 
 
 		 433 aa  108  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000753312  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3107  peptidase M23B  39.02 
 
 		 303 aa  109  6e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2646  peptidase M23B  30.35 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2180  M24/M37 family peptidase  31.19 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2285  peptidase M23B  30.05 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00385492  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1342  peptidase M23B  29.52 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.339231 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2531  peptidase M23B  31.19 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2378  peptidase M23B  31.25 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.235139  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2214  peptidase M23B  30 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.558528 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2290  peptidase M23B  30 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0178936  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2423  peptidase M23B  30 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2288  peptidase M23B  41.01 
 
 		 141 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  hitchhiker  0.000223736 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2485  peptidase M23B  34.68 
 
 		 316 aa  106  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927906 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1516  peptidase M23B  42.86 
 
 		 367 aa  107  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1820  Peptidase M23  30.69 
 
 		 312 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0518424  normal  0.297584 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  44.35 
 
 		 303 aa  106  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  29.29 
 
 		 312 aa  105  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  39.42 
 
 		 399 aa  105  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  47.41 
 
 		 325 aa  105  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  31.44 
 
 		 402 aa  105  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  41.35 
 
 		 325 aa  105  8e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  39.42 
 
 		 399 aa  105  9e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2436  peptidase M23B  32.86 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  45.3 
 
 		 430 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0795  peptidase M23B  39.55 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0414  Peptidase M23  38.61 
 
 		 436 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0487693 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  42.4 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1641  peptidase M23B  50.52 
 
 		 433 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000435092  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2079  M24/M37 family peptidase  35.85 
 
 		 435 aa  102  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000207856  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2702  Peptidase M23  50.52 
 
 		 433 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000811311  hitchhiker  0.0000822209 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3376  peptidase M23B  29.41 
 
 		 269 aa  102  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1656  peptidase M23B  50.52 
 
 		 433 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000516182  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1678  peptidase M23B  50.52 
 
 		 433 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411923  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  40.4 
 
 		 375 aa  102  6e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  38.82 
 
 		 286 aa  102  8e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  38.24 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3500  peptidase M23B  28.88 
 
 		 448 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0209241  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1560  M24/M37 family peptidase  31.82 
 
 		 282 aa  102  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.275823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06306  peptidase  48.42 
 
 		 439 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  40.94 
 
 		 411 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2610  peptidase M23B  48.45 
 
 		 431 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.326466  hitchhiker  0.000000038042 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  44.64 
 
 		 324 aa  100  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>