More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0414 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0414  Peptidase M23  100 
 
 		 436 aa  892    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0487693 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1311  peptidase M23B  65.6 
 
 		 440 aa  625  1e-178  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000378808  hitchhiker  0.00124242 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2079  M24/M37 family peptidase  53.58 
 
 		 435 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000207856  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1189  Peptidase M23  50.93 
 
 		 441 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000449419  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0762  Peptidase M23  48.14 
 
 		 435 aa  402  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.788774  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2965  putative peptidase  44.11 
 
 		 433 aa  375  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000753312  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0954  peptidase M23B  44.76 
 
 		 433 aa  365  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000982445  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3569  Peptidase M23  42.11 
 
 		 448 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3500  peptidase M23B  42.11 
 
 		 448 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0209241  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1778  Peptidase M23  43.55 
 
 		 448 aa  355  1e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000277073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0512  peptidase M23B  40.31 
 
 		 453 aa  273  3e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0024686  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1776  Peptidase M23  34.41 
 
 		 434 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0144  M24/M37 family peptidase  30.37 
 
 		 457 aa  214  3.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000389658  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0126  M24/M37 family peptidase  31.23 
 
 		 457 aa  210  4e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0671  peptidase M23B  31.85 
 
 		 431 aa  210  5e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0143037  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0242  Peptidase M23  31.59 
 
 		 456 aa  209  6e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0166  M24/M37 family peptidase  30.99 
 
 		 457 aa  208  1e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000141414  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1296  tyrosyl-tRNA synthetase  32.09 
 
 		 456 aa  208  2e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000911619  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2224  peptidase M23B  30.94 
 
 		 456 aa  208  2e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000268272  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1684  peptidase M23B  30.77 
 
 		 453 aa  204  2e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.653091  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1499  peptidase M23B  32.99 
 
 		 456 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0217  peptidase, M23/M37 family  32.49 
 
 		 459 aa  199  1.0000000000000001e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000191836  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  28.09 
 
 		 306 aa  105  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  47.96 
 
 		 375 aa  103  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  38.61 
 
 		 273 aa  103  8e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  37.97 
 
 		 244 aa  102  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  37.97 
 
 		 266 aa  101  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  50.52 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  47.96 
 
 		 301 aa  100  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  45.92 
 
 		 268 aa  97.8  3e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  36.99 
 
 		 375 aa  97.8  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  50 
 
 		 453 aa  96.3  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  39.22 
 
 		 269 aa  96.3  9e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1516  peptidase M23B  34.32 
 
 		 367 aa  96.3  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  47.52 
 
 		 379 aa  95.5  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  31.69 
 
 		 286 aa  94.7  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  37.62 
 
 		 309 aa  95.5  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  37.04 
 
 		 312 aa  94.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  44.9 
 
 		 404 aa  94.7  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  45.28 
 
 		 284 aa  93.6  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  47 
 
 		 377 aa  93.6  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  47 
 
 		 303 aa  93.6  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1868  Peptidase M23  48 
 
 		 398 aa  93.6  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0529967  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  47.96 
 
 		 448 aa  93.2  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  38.6 
 
 		 262 aa  92.4  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  45.54 
 
 		 468 aa  92.8  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  46.94 
 
 		 402 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  47.96 
 
 		 372 aa  91.3  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  45.92 
 
 		 411 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  44.44 
 
 		 300 aa  90.9  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  41 
 
 		 399 aa  90.9  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  32.98 
 
 		 285 aa  90.9  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  46.94 
 
 		 455 aa  90.5  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  47.96 
 
 		 459 aa  90.5  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  45.92 
 
 		 376 aa  90.1  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  45.92 
 
 		 400 aa  90.1  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  43 
 
 		 373 aa  90.1  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  37.96 
 
 		 470 aa  89.7  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  32.73 
 
 		 255 aa  89.7  9e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  47.96 
 
 		 456 aa  89.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  43.43 
 
 		 431 aa  89.7  9e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0795  peptidase M23B  50 
 
 		 253 aa  89.7  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  46.94 
 
 		 404 aa  89.7  9e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  44.9 
 
 		 229 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  41.53 
 
 		 321 aa  89.4  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  40.2 
 
 		 305 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  43.93 
 
 		 320 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  42.16 
 
 		 305 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  40 
 
 		 399 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  43.88 
 
 		 441 aa  89.4  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1170  peptidase M23B  37.14 
 
 		 294 aa  89  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174403 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  40.2 
 
 		 305 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  40.2 
 
 		 305 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  46.23 
 
 		 231 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  48.98 
 
 		 457 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  42.86 
 
 		 377 aa  88.2  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  44.9 
 
 		 454 aa  88.2  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  30.19 
 
 		 447 aa  87.8  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  31.75 
 
 		 285 aa  88.2  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  30.19 
 
 		 447 aa  87.8  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  31.13 
 
 		 446 aa  87.4  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4198  peptidase M23B  37.86 
 
 		 275 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1925  peptidase  34.04 
 
 		 283 aa  87.4  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  41.84 
 
 		 301 aa  87.4  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  44.9 
 
 		 374 aa  87  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  39.06 
 
 		 464 aa  87  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  34.24 
 
 		 541 aa  87  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  45.92 
 
 		 379 aa  87  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  31.43 
 
 		 445 aa  86.7  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  43.43 
 
 		 417 aa  86.7  7e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  41.41 
 
 		 517 aa  86.7  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  41.84 
 
 		 314 aa  86.7  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4435  Peptidase M23  42.42 
 
 		 308 aa  86.7  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  38.64 
 
 		 480 aa  86.3  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  38.24 
 
 		 293 aa  86.3  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  48.98 
 
 		 445 aa  85.9  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  43.88 
 
 		 460 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  43.88 
 
 		 455 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  39.81 
 
 		 282 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  43.62 
 
 		 379 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>