More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2288 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2288  peptidase M23B  100 
 
 
141 aa  287  4e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  hitchhiker  0.000223736 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1364  Peptidase M23  87.23 
 
 
263 aa  253  7e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000583534  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2496  peptidase M23B  87.23 
 
 
296 aa  251  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0441433  normal  0.0477862 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2485  peptidase M23B  82.98 
 
 
316 aa  244  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.927906 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1342  peptidase M23B  80.85 
 
 
296 aa  238  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.339231 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3617  Peptidase M23  81.56 
 
 
322 aa  234  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4779  peptidase M23B  76.22 
 
 
289 aa  211  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  74.29 
 
 
290 aa  205  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3491  peptidase M23B  62.32 
 
 
280 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.172269  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1445  peptidase, M23/M37 family  58.46 
 
 
274 aa  163  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.813249  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1026  M24/M37 family peptidase  55.4 
 
 
275 aa  163  8e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1024  peptidase M23B  55.4 
 
 
275 aa  163  8e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1066  peptidase M23B  55.4 
 
 
275 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0830638  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  58.09 
 
 
282 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1258  peptidase M23B  57.69 
 
 
274 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  61.98 
 
 
271 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  58.09 
 
 
282 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4593  peptidase M23B  55.4 
 
 
273 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4198  peptidase M23B  54.68 
 
 
275 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663221  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  57.69 
 
 
274 aa  159  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  57.48 
 
 
277 aa  154  5.0000000000000005e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2044  Peptidase M23  57.55 
 
 
272 aa  153  9e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  57.38 
 
 
300 aa  148  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  56.56 
 
 
300 aa  147  5e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  50.41 
 
 
313 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1051  peptidase M23B  52.89 
 
 
282 aa  130  6e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1812  peptidase M23B  48.39 
 
 
282 aa  124  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0863419  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0940  Peptidase M23  47.15 
 
 
291 aa  124  6e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252904  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0123  Peptidase M23  49.21 
 
 
336 aa  123  7e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.246102 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  54.47 
 
 
285 aa  123  8.000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0304  hypothetical protein  54.47 
 
 
272 aa  122  1e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1296  M24/M37 family peptidase  50.41 
 
 
276 aa  122  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.492814  decreased coverage  0.0068339 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2783  peptidase M23B  48.39 
 
 
286 aa  122  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392125  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  49.21 
 
 
336 aa  121  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1721  peptidase M23B  46.72 
 
 
317 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216708  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00362  peptidase  53.28 
 
 
279 aa  117  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0922306  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2265  Peptidase M23  47.54 
 
 
299 aa  116  7.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.617569  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1474  peptidase M23B  44.68 
 
 
287 aa  116  9e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00227423  normal  0.920527 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  48.41 
 
 
285 aa  115  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0622  peptidase M23B  46.34 
 
 
280 aa  114  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  46.83 
 
 
285 aa  113  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1224  peptidase M23B  49.58 
 
 
232 aa  113  8.999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0694814 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2378  peptidase M23B  44.72 
 
 
282 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.235139  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2737  Peptidase M23  55.74 
 
 
281 aa  110  6e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.225501  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  46.03 
 
 
286 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2436  peptidase M23B  48.78 
 
 
278 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1560  M24/M37 family peptidase  45.16 
 
 
282 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.275823  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2285  peptidase M23B  44.72 
 
 
313 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00385492  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2214  peptidase M23B  43.55 
 
 
301 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.558528 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2423  peptidase M23B  42.74 
 
 
306 aa  108  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  41.01 
 
 
273 aa  107  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2290  peptidase M23B  42.74 
 
 
306 aa  107  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0178936  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2180  M24/M37 family peptidase  43.9 
 
 
311 aa  107  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2531  peptidase M23B  43.09 
 
 
312 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  45.22 
 
 
266 aa  107  8.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  41.01 
 
 
244 aa  107  8.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1767  peptidase M23B  42.74 
 
 
280 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287118  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2524  peptidase M23B  43.09 
 
 
287 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2615  M24/M37 family peptidase  44.26 
 
 
288 aa  106  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144035  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  42.74 
 
 
306 aa  106  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1575  peptidase M23B  44.72 
 
 
302 aa  106  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.745708  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0169  peptidase M23B  42.06 
 
 
284 aa  105  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  39.67 
 
 
268 aa  105  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3376  peptidase M23B  44.72 
 
 
269 aa  105  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1820  Peptidase M23  42.28 
 
 
312 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0518424  normal  0.297584 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2646  peptidase M23B  42.28 
 
 
287 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  40.98 
 
 
255 aa  104  5e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01913  metalloendopeptidase-like membrane protein  39.67 
 
 
305 aa  102  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0631175  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  46.03 
 
 
243 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  43.55 
 
 
312 aa  100  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3146  peptidase M23B  42.86 
 
 
299 aa  100  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1641  Peptidase M23  38.41 
 
 
286 aa  100  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0361826  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  42.15 
 
 
269 aa  100  9e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  42.06 
 
 
469 aa  100  9e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3107  peptidase M23B  43.9 
 
 
303 aa  100  9e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  41.32 
 
 
328 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  40.98 
 
 
319 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  34.51 
 
 
285 aa  99.8  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  40.15 
 
 
318 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  40.98 
 
 
321 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  45.24 
 
 
238 aa  97.8  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  46.46 
 
 
375 aa  97.1  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  44.36 
 
 
238 aa  97.1  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  46.62 
 
 
455 aa  96.7  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  40.16 
 
 
431 aa  96.7  9e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  43.09 
 
 
304 aa  96.7  9e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  45.3 
 
 
303 aa  96.7  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  44.09 
 
 
293 aa  95.5  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  51.24 
 
 
372 aa  95.5  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  39.34 
 
 
441 aa  95.5  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1925  peptidase  40.77 
 
 
283 aa  94.7  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  42.34 
 
 
375 aa  94.7  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  45.08 
 
 
445 aa  93.6  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1170  peptidase M23B  41.13 
 
 
294 aa  93.6  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00174403 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  49.51 
 
 
454 aa  92  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  45.16 
 
 
394 aa  92  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  42.06 
 
 
388 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  47.79 
 
 
377 aa  92.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  48 
 
 
455 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  45 
 
 
413 aa  92  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>