More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2423 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2423  peptidase M23B  100 
 
 
306 aa  630  1e-179  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2290  peptidase M23B  96.08 
 
 
306 aa  588  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0178936  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2214  peptidase M23B  97 
 
 
301 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.558528 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2180  M24/M37 family peptidase  84.62 
 
 
311 aa  528  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2531  peptidase M23B  87.1 
 
 
312 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2646  peptidase M23B  87.1 
 
 
287 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2524  peptidase M23B  88.24 
 
 
287 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1820  Peptidase M23  86.74 
 
 
312 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0518424  normal  0.297584 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2285  peptidase M23B  81.91 
 
 
313 aa  500  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00385492  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1812  peptidase M23B  77.22 
 
 
282 aa  425  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0863419  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1474  peptidase M23B  72.59 
 
 
287 aa  422  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00227423  normal  0.920527 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2378  peptidase M23B  74.26 
 
 
282 aa  424  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.235139  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2783  peptidase M23B  72.22 
 
 
286 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392125  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1575  peptidase M23B  67.13 
 
 
302 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.745708  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1560  M24/M37 family peptidase  69.29 
 
 
282 aa  413  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.275823  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1767  peptidase M23B  71.85 
 
 
280 aa  409  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287118  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2615  M24/M37 family peptidase  51.87 
 
 
288 aa  281  7.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144035  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3376  peptidase M23B  52.94 
 
 
269 aa  276  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1296  M24/M37 family peptidase  48.52 
 
 
276 aa  258  9e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.492814  decreased coverage  0.0068339 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2436  peptidase M23B  46.64 
 
 
278 aa  258  1e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01913  metalloendopeptidase-like membrane protein  46.99 
 
 
305 aa  246  4e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0631175  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00362  peptidase  45.08 
 
 
279 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0922306  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0622  peptidase M23B  45.1 
 
 
280 aa  231  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  43.55 
 
 
285 aa  225  8e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0304  hypothetical protein  43.55 
 
 
272 aa  223  3e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2737  Peptidase M23  44.72 
 
 
281 aa  223  3e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.225501  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3146  peptidase M23B  41.27 
 
 
299 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3107  peptidase M23B  42.86 
 
 
303 aa  177  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0169  peptidase M23B  37.45 
 
 
284 aa  167  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0630  peptidase M23B  38.4 
 
 
312 aa  167  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0558086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1224  peptidase M23B  39.11 
 
 
232 aa  160  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0694814 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  37.07 
 
 
300 aa  136  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  37.07 
 
 
300 aa  136  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  37.78 
 
 
271 aa  129  9.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1051  peptidase M23B  33.03 
 
 
282 aa  126  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  36.87 
 
 
274 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2044  Peptidase M23  33.85 
 
 
272 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4198  peptidase M23B  36.46 
 
 
275 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663221  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1026  M24/M37 family peptidase  35.36 
 
 
275 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1024  peptidase M23B  35.36 
 
 
275 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1066  peptidase M23B  35.36 
 
 
275 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0830638  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  38.25 
 
 
290 aa  119  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  33.52 
 
 
328 aa  119  9e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  35.75 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2485  peptidase M23B  36.76 
 
 
316 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.927906 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  35.2 
 
 
282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  35.71 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0940  Peptidase M23  32.95 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252904  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4593  peptidase M23B  35 
 
 
273 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1445  peptidase, M23/M37 family  35 
 
 
274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.813249  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  40.4 
 
 
285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3491  peptidase M23B  34.64 
 
 
280 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.172269  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3617  Peptidase M23  34.44 
 
 
322 aa  112  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2496  peptidase M23B  34.08 
 
 
296 aa  112  9e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0441433  normal  0.0477862 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  30.98 
 
 
268 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1258  peptidase M23B  33.52 
 
 
274 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1364  Peptidase M23  34.08 
 
 
263 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000583534  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  32 
 
 
336 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  30 
 
 
273 aa  107  2e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  28.95 
 
 
244 aa  107  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2288  peptidase M23B  42.74 
 
 
141 aa  108  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  hitchhiker  0.000223736 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  29.47 
 
 
266 aa  106  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  36.22 
 
 
285 aa  106  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  26.45 
 
 
285 aa  103  3e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1342  peptidase M23B  34.66 
 
 
296 aa  103  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.339231 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  35.23 
 
 
312 aa  102  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  35.06 
 
 
293 aa  102  7e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4779  peptidase M23B  32.26 
 
 
289 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  28.57 
 
 
255 aa  101  2e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  32.13 
 
 
306 aa  99.4  7e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  34.71 
 
 
309 aa  99  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  32.32 
 
 
318 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  32.32 
 
 
321 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  32.32 
 
 
319 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  26.8 
 
 
269 aa  98.2  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0123  Peptidase M23  30.39 
 
 
336 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.246102 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  37.6 
 
 
395 aa  98.6  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  32.34 
 
 
277 aa  95.9  8e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  32.98 
 
 
286 aa  93.6  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1721  peptidase M23B  31.21 
 
 
317 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216708  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  39.52 
 
 
320 aa  89.7  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2455  peptidase M23B  37.14 
 
 
418 aa  89.7  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186992  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2448  peptidase M23B  36.62 
 
 
431 aa  89.7  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.093884  hitchhiker  0.000000000665253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2518  peptidase M23B  36.62 
 
 
431 aa  89.7  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0290484  unclonable  0.0000200771 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2610  peptidase M23B  36.62 
 
 
431 aa  89.7  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.326466  hitchhiker  0.000000038042 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  32.39 
 
 
305 aa  89.4  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  28.57 
 
 
308 aa  89.4  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2702  Peptidase M23  36.62 
 
 
433 aa  89.4  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000811311  hitchhiker  0.0000822209 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1641  peptidase M23B  36.62 
 
 
433 aa  89.4  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000435092  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1656  peptidase M23B  36.62 
 
 
433 aa  89.4  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000516182  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00995  hypothetical protein  30.53 
 
 
333 aa  89  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1678  peptidase M23B  36.62 
 
 
433 aa  89.4  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411923  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2842  M24/M37 family peptidase  36.62 
 
 
434 aa  87.8  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1170  peptidase M23B  42.64 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00174403 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1533  peptidase M23B  35.92 
 
 
431 aa  87.4  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00239746  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  31.69 
 
 
305 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  31.69 
 
 
305 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  28.97 
 
 
305 aa  87  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1077  Peptidase M23  34.51 
 
 
507 aa  87  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.391765  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3011  peptidase M23B  35.81 
 
 
482 aa  86.3  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.698295 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>