More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1170 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1170  peptidase M23B  100 
 
 
294 aa  595  1e-169  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00174403 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  58.65 
 
 
306 aa  327  1.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  56.55 
 
 
312 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1925  peptidase  56.18 
 
 
283 aa  311  7.999999999999999e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  42.36 
 
 
285 aa  186  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  42.22 
 
 
293 aa  185  7e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  38.81 
 
 
286 aa  176  5e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  37.04 
 
 
285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3491  peptidase M23B  37.13 
 
 
280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.172269  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4593  peptidase M23B  35.32 
 
 
273 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0123  Peptidase M23  35.25 
 
 
336 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.246102 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  38.59 
 
 
336 aa  123  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1445  peptidase, M23/M37 family  36.76 
 
 
274 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.813249  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1258  peptidase M23B  38.46 
 
 
274 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0622  peptidase M23B  37.68 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2265  Peptidase M23  32.54 
 
 
299 aa  120  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.617569  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1721  peptidase M23B  42.68 
 
 
317 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216708  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  35.18 
 
 
282 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  39.23 
 
 
313 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0940  Peptidase M23  36.64 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252904  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2495  Peptidase M23  36.07 
 
 
331 aa  117  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1066  peptidase M23B  34.92 
 
 
275 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0830638  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  34.67 
 
 
282 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1026  M24/M37 family peptidase  34.39 
 
 
275 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1024  peptidase M23B  34.92 
 
 
275 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  38.2 
 
 
274 aa  115  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  35.47 
 
 
271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3146  peptidase M23B  36.47 
 
 
299 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0762  Peptidase M23  31.85 
 
 
435 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.788774  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4198  peptidase M23B  34.22 
 
 
275 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663221  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1051  peptidase M23B  39.56 
 
 
282 aa  110  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  29.43 
 
 
300 aa  109  5e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00362  peptidase  35.64 
 
 
279 aa  107  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0922306  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  28.37 
 
 
300 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  33.47 
 
 
285 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4779  peptidase M23B  33.68 
 
 
289 aa  106  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2470  Peptidase M23  33.19 
 
 
332 aa  106  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0304  hypothetical protein  33.47 
 
 
272 aa  106  5e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3569  Peptidase M23  35.21 
 
 
448 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3500  peptidase M23B  34.74 
 
 
448 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0209241  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2044  Peptidase M23  34.27 
 
 
272 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0169  peptidase M23B  39.69 
 
 
284 aa  103  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  37.79 
 
 
290 aa  102  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  38.97 
 
 
395 aa  102  5e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1767  peptidase M23B  36.11 
 
 
280 aa  102  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287118  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1776  Peptidase M23  39.13 
 
 
434 aa  100  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3107  peptidase M23B  40.77 
 
 
303 aa  101  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  29.92 
 
 
321 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0954  peptidase M23B  33.86 
 
 
433 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000982445  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1474  peptidase M23B  37.89 
 
 
287 aa  99.8  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00227423  normal  0.920527 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2783  peptidase M23B  36.65 
 
 
286 aa  99.4  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392125  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  41.73 
 
 
318 aa  99.4  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  41.73 
 
 
319 aa  99  9e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1342  peptidase M23B  40.65 
 
 
296 aa  99  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.339231 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  32.97 
 
 
273 aa  98.6  1e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  32.42 
 
 
266 aa  98.6  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0512  peptidase M23B  40.74 
 
 
453 aa  97.8  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0024686  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  26.61 
 
 
285 aa  98.2  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2496  peptidase M23B  34.54 
 
 
296 aa  97.1  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0441433  normal  0.0477862 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1812  peptidase M23B  38.61 
 
 
282 aa  96.7  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0863419  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  31.87 
 
 
244 aa  96.7  4e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3617  Peptidase M23  34.3 
 
 
322 aa  95.9  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1364  Peptidase M23  34.02 
 
 
263 aa  95.5  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000583534  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2737  Peptidase M23  35.15 
 
 
281 aa  95.5  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.225501  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2615  M24/M37 family peptidase  31 
 
 
288 aa  94.4  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144035  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  32.39 
 
 
268 aa  94.4  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1296  M24/M37 family peptidase  39.62 
 
 
276 aa  94.7  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.492814  decreased coverage  0.0068339 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2378  peptidase M23B  33.7 
 
 
282 aa  94.4  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.235139  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0630  peptidase M23B  42.64 
 
 
312 aa  94  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0558086 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2141  peptidase M23B  40 
 
 
649 aa  94  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.506727 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2288  peptidase M23B  41.13 
 
 
141 aa  93.6  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  hitchhiker  0.000223736 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2965  putative peptidase  38.3 
 
 
433 aa  93.2  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000753312  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0261  M23 peptidase domain protein  30.18 
 
 
314 aa  92.8  5e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0566048  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  40.31 
 
 
524 aa  92.4  8e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1296  tyrosyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 
456 aa  92.4  9e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000911619  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  35.08 
 
 
482 aa  92.4  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  38.32 
 
 
374 aa  91.7  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1311  peptidase M23B  38.24 
 
 
440 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000378808  hitchhiker  0.00124242 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2180  M24/M37 family peptidase  34.43 
 
 
311 aa  90.9  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  39.68 
 
 
379 aa  91.3  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  30.11 
 
 
255 aa  91.3  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2485  peptidase M23B  30.5 
 
 
316 aa  90.9  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.927906 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  42.74 
 
 
316 aa  90.9  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  40.68 
 
 
277 aa  91.3  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  40 
 
 
384 aa  90.9  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  40 
 
 
309 aa  90.5  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5408  Peptidase M23  40.31 
 
 
538 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252675  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1516  peptidase M23B  43.07 
 
 
367 aa  90.5  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2285  peptidase M23B  34.43 
 
 
313 aa  90.1  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00385492  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01913  metalloendopeptidase-like membrane protein  39.68 
 
 
305 aa  90.1  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0631175  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1820  Peptidase M23  34.43 
 
 
312 aa  89.7  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0518424  normal  0.297584 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1778  Peptidase M23  37.76 
 
 
448 aa  89.7  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000277073  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  42.86 
 
 
402 aa  89.4  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1575  peptidase M23B  38.82 
 
 
302 aa  89.7  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.745708  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0177  peptidase M23  40.94 
 
 
298 aa  89.4  7e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  38.85 
 
 
269 aa  89.4  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2189  M23/M37 peptidase domain-containing protein  38.06 
 
 
316 aa  89  8e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0414  Peptidase M23  37.41 
 
 
436 aa  89  8e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0487693 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  38.52 
 
 
375 aa  89  9e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  46.53 
 
 
402 aa  89  9e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>