More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0762 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0762  Peptidase M23  100 
 
 
435 aa  897    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.788774  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1778  Peptidase M23  46.36 
 
 
448 aa  402  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000277073  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0414  Peptidase M23  48.14 
 
 
436 aa  402  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0487693 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0954  peptidase M23B  46.24 
 
 
433 aa  402  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000982445  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1311  peptidase M23B  45.01 
 
 
440 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000378808  hitchhiker  0.00124242 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2965  putative peptidase  45.29 
 
 
433 aa  389  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000753312  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3500  peptidase M23B  43.93 
 
 
448 aa  386  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0209241  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2079  M24/M37 family peptidase  44.27 
 
 
435 aa  385  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000207856  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3569  Peptidase M23  43.65 
 
 
448 aa  383  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1189  Peptidase M23  39.13 
 
 
441 aa  322  6e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000449419  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0512  peptidase M23B  40.92 
 
 
453 aa  301  2e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0024686  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1776  Peptidase M23  33.73 
 
 
434 aa  238  2e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2224  peptidase M23B  33.19 
 
 
456 aa  225  1e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000268272  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1296  tyrosyl-tRNA synthetase  33.84 
 
 
456 aa  221  3e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000911619  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0144  M24/M37 family peptidase  28.82 
 
 
457 aa  213  4.9999999999999996e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000389658  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1684  peptidase M23B  30.54 
 
 
453 aa  210  3e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.653091  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0166  M24/M37 family peptidase  30 
 
 
457 aa  210  4e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000141414  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0126  M24/M37 family peptidase  29.79 
 
 
457 aa  209  8e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0242  Peptidase M23  29.95 
 
 
456 aa  207  4e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0217  peptidase, M23/M37 family  30.45 
 
 
459 aa  206  5e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000191836  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0671  peptidase M23B  31.95 
 
 
431 aa  204  2e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0143037  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1499  peptidase M23B  30.95 
 
 
456 aa  196  5.000000000000001e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  31.2 
 
 
306 aa  113  6e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1170  peptidase M23B  31.85 
 
 
294 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00174403 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  39.86 
 
 
312 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  28.22 
 
 
266 aa  100  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1516  peptidase M23B  36.69 
 
 
367 aa  98.6  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  42.86 
 
 
375 aa  98.2  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  28.22 
 
 
273 aa  97.8  4e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  35.85 
 
 
285 aa  96.7  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  46.39 
 
 
448 aa  95.5  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  37.68 
 
 
286 aa  95.1  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  33.76 
 
 
244 aa  94.7  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  36.8 
 
 
303 aa  92.8  9e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  41.24 
 
 
375 aa  93.2  9e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  42.27 
 
 
301 aa  93.2  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  40.59 
 
 
468 aa  91.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  43.56 
 
 
377 aa  92.4  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3351  peptidase M23B  47.67 
 
 
687 aa  91.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0955739  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  40.21 
 
 
268 aa  90.9  4e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  40.21 
 
 
411 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  34.95 
 
 
309 aa  90.1  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  39.39 
 
 
399 aa  90.5  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  40 
 
 
404 aa  89.4  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  40.21 
 
 
441 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  37.98 
 
 
415 aa  89  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  41.05 
 
 
413 aa  89  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  33.08 
 
 
375 aa  88.6  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  38.38 
 
 
399 aa  88.6  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  40.21 
 
 
431 aa  88.6  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  35.94 
 
 
229 aa  88.6  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  32.9 
 
 
216 aa  87.8  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  45.36 
 
 
394 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  40.2 
 
 
313 aa  87.8  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  31.52 
 
 
255 aa  87.4  4e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  41.24 
 
 
379 aa  87.8  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0123  Peptidase M23  39.42 
 
 
336 aa  87.4  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.246102 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  32.7 
 
 
285 aa  87  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  38.68 
 
 
469 aa  87  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  40 
 
 
446 aa  87  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  40 
 
 
447 aa  87  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2912  peptidase M23B  43.62 
 
 
330 aa  86.7  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  41.58 
 
 
482 aa  86.7  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  40 
 
 
447 aa  87  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  41.49 
 
 
400 aa  86.7  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  38.1 
 
 
305 aa  86.3  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  37.37 
 
 
373 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  40 
 
 
379 aa  86.3  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  41.41 
 
 
300 aa  86.3  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  36.89 
 
 
321 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1721  peptidase M23B  38.85 
 
 
317 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216708  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  36.89 
 
 
319 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  39.18 
 
 
414 aa  85.1  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  32.9 
 
 
336 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1925  peptidase  35.25 
 
 
283 aa  85.1  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  36.89 
 
 
318 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  39.8 
 
 
417 aa  85.1  0.000000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  42.27 
 
 
402 aa  85.5  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  36.19 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  35.71 
 
 
314 aa  84.7  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1868  Peptidase M23  39.39 
 
 
398 aa  84.7  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0529967  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  36.19 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  38.78 
 
 
377 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2189  M23/M37 peptidase domain-containing protein  35.65 
 
 
316 aa  84.3  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  39.58 
 
 
498 aa  84.3  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  42.27 
 
 
392 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  28.72 
 
 
293 aa  84.3  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  36.19 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  33.96 
 
 
392 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  41.49 
 
 
379 aa  84  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  42.27 
 
 
376 aa  84  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  32.7 
 
 
391 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  41.49 
 
 
328 aa  83.6  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  39.18 
 
 
340 aa  83.2  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  32.43 
 
 
303 aa  82.4  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  41.49 
 
 
445 aa  82.8  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  33.59 
 
 
238 aa  82.8  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  40.21 
 
 
455 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  40.21 
 
 
541 aa  82.4  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  36 
 
 
282 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>