More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1499 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1499  peptidase M23B  100 
 
 
456 aa  928    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2224  peptidase M23B  56.37 
 
 
456 aa  527  1e-148  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000268272  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1296  tyrosyl-tRNA synthetase  56.74 
 
 
456 aa  523  1e-147  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000911619  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1684  peptidase M23B  52.43 
 
 
453 aa  500  1e-140  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.653091  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0242  Peptidase M23  52.13 
 
 
456 aa  491  1e-137  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0671  peptidase M23B  50.7 
 
 
431 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0143037  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0144  M24/M37 family peptidase  49.89 
 
 
457 aa  454  1.0000000000000001e-126  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000389658  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0126  M24/M37 family peptidase  51.75 
 
 
457 aa  450  1e-125  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0166  M24/M37 family peptidase  51.75 
 
 
457 aa  451  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000141414  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0217  peptidase, M23/M37 family  47.58 
 
 
459 aa  445  1.0000000000000001e-124  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000191836  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2965  putative peptidase  33.64 
 
 
433 aa  232  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000753312  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1311  peptidase M23B  33.33 
 
 
440 aa  229  6e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000378808  hitchhiker  0.00124242 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2079  M24/M37 family peptidase  31.91 
 
 
435 aa  216  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000207856  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1189  Peptidase M23  31.66 
 
 
441 aa  208  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000449419  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3569  Peptidase M23  31.94 
 
 
448 aa  204  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0414  Peptidase M23  32.99 
 
 
436 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0487693 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3500  peptidase M23B  32.13 
 
 
448 aa  199  7e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0209241  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0762  Peptidase M23  30.95 
 
 
435 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.788774  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1778  Peptidase M23  31.67 
 
 
448 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000277073  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0954  peptidase M23B  30.41 
 
 
433 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000982445  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1776  Peptidase M23  32.55 
 
 
434 aa  176  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0512  peptidase M23B  28.06 
 
 
453 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0024686  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  34.38 
 
 
268 aa  92.4  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  31.87 
 
 
318 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  31.32 
 
 
319 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  31.32 
 
 
321 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  40 
 
 
309 aa  87.8  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  27.57 
 
 
273 aa  83.2  0.000000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  25.82 
 
 
313 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  30.57 
 
 
244 aa  82.4  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  33.11 
 
 
375 aa  82  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  28.41 
 
 
300 aa  82  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  28.39 
 
 
269 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  30.99 
 
 
303 aa  80.9  0.00000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  41 
 
 
346 aa  80.5  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  32.12 
 
 
285 aa  80.5  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  31.21 
 
 
266 aa  80.5  0.00000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  38.38 
 
 
303 aa  79.7  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  29.09 
 
 
375 aa  79.7  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1868  Peptidase M23  41.84 
 
 
398 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0529967  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  35.58 
 
 
379 aa  79  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  37.07 
 
 
328 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  25.88 
 
 
306 aa  79  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  30.27 
 
 
430 aa  79  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  32 
 
 
313 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  29.94 
 
 
255 aa  77.4  0.0000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  39.36 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  36.73 
 
 
373 aa  77  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  32.28 
 
 
295 aa  77  0.0000000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2044  Peptidase M23  36.52 
 
 
272 aa  76.6  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2318  LysM/M23/M37 peptidase  36.07 
 
 
307 aa  75.9  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.234924  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  40.78 
 
 
417 aa  76.3  0.000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  34.62 
 
 
441 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  33.33 
 
 
431 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2495  Peptidase M23  28.57 
 
 
331 aa  76.3  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  37.37 
 
 
400 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0192  Peptidase M23  26.9 
 
 
312 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1516  peptidase M23B  32.85 
 
 
367 aa  75.5  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  36.07 
 
 
316 aa  74.7  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  31.55 
 
 
285 aa  74.7  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0940  Peptidase M23  28.28 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252904  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  41.11 
 
 
375 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  34.45 
 
 
448 aa  73.6  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  35.92 
 
 
320 aa  73.6  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  37.37 
 
 
404 aa  73.2  0.000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  31.93 
 
 
285 aa  73.2  0.000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  34.21 
 
 
517 aa  73.2  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  37.61 
 
 
328 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  33.33 
 
 
314 aa  73.2  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  28.66 
 
 
399 aa  73.2  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  41.49 
 
 
404 aa  72.8  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  35.64 
 
 
414 aa  72.4  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  29.66 
 
 
248 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  37.76 
 
 
379 aa  72.8  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  38.46 
 
 
231 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10968  hypothetical protein  40.2 
 
 
332 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.292549 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0261  M23 peptidase domain protein  30.43 
 
 
314 aa  72.4  0.00000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0566048  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  39 
 
 
332 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  35.71 
 
 
305 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  28.03 
 
 
399 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  35.71 
 
 
305 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  36.63 
 
 
454 aa  71.2  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2410  peptidoglycan-binding LysM  36.52 
 
 
295 aa  71.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000688679  unclonable  0.000000112748 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  28.57 
 
 
293 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  35.71 
 
 
305 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  26.26 
 
 
414 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  35.96 
 
 
372 aa  71.6  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  35.35 
 
 
402 aa  71.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2472  peptidase M23B  40.45 
 
 
446 aa  70.9  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000997494  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  31.21 
 
 
363 aa  70.9  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  33.06 
 
 
541 aa  70.9  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  41.11 
 
 
388 aa  70.9  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  35.19 
 
 
446 aa  70.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0123  Peptidase M23  33.9 
 
 
336 aa  70.9  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.246102 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  37 
 
 
394 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  30.61 
 
 
223 aa  70.5  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  36 
 
 
340 aa  70.5  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1051  peptidase M23B  33.63 
 
 
282 aa  70.5  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  30.61 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  36.97 
 
 
524 aa  70.1  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>