More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0512 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0512  peptidase M23B  100 
 
 		 453 aa  931    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0024686  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1778  Peptidase M23  41.47 
 
 		 448 aa  328  9e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000277073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0762  Peptidase M23  41.05 
 
 		 435 aa  307  3e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.788774  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1311  peptidase M23B  38.72 
 
 		 440 aa  293  3e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000378808  hitchhiker  0.00124242 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3569  Peptidase M23  38.13 
 
 		 448 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2965  putative peptidase  37.44 
 
 		 433 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000753312  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3500  peptidase M23B  37.95 
 
 		 448 aa  282  9e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0209241  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0414  Peptidase M23  38.44 
 
 		 436 aa  278  2e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0487693 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2079  M24/M37 family peptidase  36.49 
 
 		 435 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000207856  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1189  Peptidase M23  37.75 
 
 		 441 aa  266  4e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000449419  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0954  peptidase M23B  36.84 
 
 		 433 aa  265  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000982445  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1776  Peptidase M23  32.75 
 
 		 434 aa  222  9.999999999999999e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1296  tyrosyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 		 456 aa  215  9.999999999999999e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000911619  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2224  peptidase M23B  32.29 
 
 		 456 aa  213  4.9999999999999996e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000268272  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0144  M24/M37 family peptidase  31.79 
 
 		 457 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000389658  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1684  peptidase M23B  31.53 
 
 		 453 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.653091  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0242  Peptidase M23  29.44 
 
 		 456 aa  194  2e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0166  M24/M37 family peptidase  32.2 
 
 		 457 aa  194  3e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000141414  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0671  peptidase M23B  30.84 
 
 		 431 aa  192  1e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0143037  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0126  M24/M37 family peptidase  31.97 
 
 		 457 aa  191  2e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0217  peptidase, M23/M37 family  29.89 
 
 		 459 aa  179  1e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000191836  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1499  peptidase M23B  28.06 
 
 		 456 aa  173  5e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  49.11 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  46.94 
 
 		 448 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  45.9 
 
 		 321 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0123  Peptidase M23  38.83 
 
 		 336 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.246102 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  45.9 
 
 		 318 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  42.57 
 
 		 379 aa  98.6  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1170  peptidase M23B  40.74 
 
 		 294 aa  98.2  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174403 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  45.9 
 
 		 319 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  41.75 
 
 		 309 aa  97.1  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  41.84 
 
 		 404 aa  95.9  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  29.71 
 
 		 255 aa  95.9  1e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1516  peptidase M23B  41.6 
 
 		 367 aa  94.7  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  43 
 
 		 411 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  35.58 
 
 		 285 aa  94.4  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  33.97 
 
 		 312 aa  94  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  40 
 
 		 373 aa  93.6  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  40.82 
 
 		 375 aa  92.8  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1721  peptidase M23B  33.86 
 
 		 317 aa  92.8  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  33.17 
 
 		 285 aa  92.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  42.31 
 
 		 304 aa  92  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  41.35 
 
 		 413 aa  91.7  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  41 
 
 		 375 aa  91.3  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  42.55 
 
 		 400 aa  91.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  41.24 
 
 		 404 aa  91.3  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  34.33 
 
 		 277 aa  90.9  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  41.24 
 
 		 375 aa  90.1  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  40.78 
 
 		 431 aa  89.7  9e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  41.84 
 
 		 377 aa  89.7  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  28.15 
 
 		 268 aa  89.4  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  44.66 
 
 		 415 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  40.78 
 
 		 441 aa  89.7  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  41.12 
 
 		 266 aa  88.6  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  42 
 
 		 379 aa  87.8  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  36.36 
 
 		 287 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  46.81 
 
 		 230 aa  88.2  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000639661  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  44.21 
 
 		 314 aa  87.8  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0261  M23 peptidase domain protein  39.13 
 
 		 314 aa  87.8  4e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0566048  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  42.55 
 
 		 374 aa  87.8  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  41.24 
 
 		 301 aa  87  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  44.68 
 
 		 303 aa  87  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  37.78 
 
 		 306 aa  87  7e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  43 
 
 		 417 aa  86.7  7e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2472  peptidase M23B  39.25 
 
 		 446 aa  86.7  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000997494  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  30.65 
 
 		 269 aa  87  7e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  41.12 
 
 		 273 aa  86.3  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1868  Peptidase M23  40.4 
 
 		 398 aa  85.9  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0529967  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6051  Peptidase M23  41.46 
 
 		 382 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.72546  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  36.73 
 
 		 379 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  39.25 
 
 		 244 aa  85.1  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  27.78 
 
 		 313 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  41.67 
 
 		 460 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2265  Peptidase M23  33.15 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.617569  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  41.67 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3351  peptidase M23B  40.71 
 
 		 687 aa  85.5  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0955739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  40.4 
 
 		 300 aa  85.5  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  45.74 
 
 		 445 aa  85.1  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  33.33 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  34.29 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  36.11 
 
 		 454 aa  84.3  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  36.54 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  43.3 
 
 		 582 aa  84  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  41.41 
 
 		 430 aa  84  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  37.74 
 
 		 392 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  37.74 
 
 		 391 aa  84  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  30.17 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  35.48 
 
 		 469 aa  84  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  42.55 
 
 		 372 aa  84  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  37.19 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  36.79 
 
 		 392 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  31.11 
 
 		 293 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  39.8 
 
 		 468 aa  81.6  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  43.56 
 
 		 541 aa  82  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  35.92 
 
 		 399 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  40.59 
 
 		 491 aa  82.4  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  42.45 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  39.81 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0097  peptidase M23B  37.62 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2470  Peptidase M23  35.85 
 
 		 332 aa  80.9  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0397928 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>