More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0217 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0217  peptidase, M23/M37 family  100 
 
 
459 aa  936    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000191836  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0144  M24/M37 family peptidase  58.99 
 
 
457 aa  563  1.0000000000000001e-159  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000389658  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0126  M24/M37 family peptidase  61.38 
 
 
457 aa  556  1e-157  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0166  M24/M37 family peptidase  60.69 
 
 
457 aa  553  1e-156  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000141414  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1684  peptidase M23B  48.57 
 
 
453 aa  451  1.0000000000000001e-126  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.653091  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2224  peptidase M23B  48.88 
 
 
456 aa  448  1.0000000000000001e-124  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000268272  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1296  tyrosyl-tRNA synthetase  50.46 
 
 
456 aa  446  1.0000000000000001e-124  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000911619  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1499  peptidase M23B  48.27 
 
 
456 aa  438  9.999999999999999e-123  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0242  Peptidase M23  46.98 
 
 
456 aa  417  9.999999999999999e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0671  peptidase M23B  48.13 
 
 
431 aa  393  1e-108  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0143037  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2079  M24/M37 family peptidase  35 
 
 
435 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000207856  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1189  Peptidase M23  30.53 
 
 
441 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000449419  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1311  peptidase M23B  32.61 
 
 
440 aa  206  9e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000378808  hitchhiker  0.00124242 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2965  putative peptidase  31.14 
 
 
433 aa  204  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000753312  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0762  Peptidase M23  30.48 
 
 
435 aa  203  5e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.788774  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0414  Peptidase M23  35.4 
 
 
436 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0487693 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3569  Peptidase M23  30.72 
 
 
448 aa  193  5e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3500  peptidase M23B  31.08 
 
 
448 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0209241  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1776  Peptidase M23  33.85 
 
 
434 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0512  peptidase M23B  29.89 
 
 
453 aa  177  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0024686  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0954  peptidase M23B  28.31 
 
 
433 aa  177  5e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000982445  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1778  Peptidase M23  30.55 
 
 
448 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000277073  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  29.29 
 
 
285 aa  94.4  4e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0261  M23 peptidase domain protein  27.4 
 
 
314 aa  92  2e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0566048  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  43.4 
 
 
309 aa  89.4  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  36.89 
 
 
375 aa  88.6  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  39.47 
 
 
318 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  37.4 
 
 
285 aa  88.6  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  39.47 
 
 
321 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  39.47 
 
 
319 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  31.85 
 
 
273 aa  87.4  4e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  42.11 
 
 
372 aa  87  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  45.19 
 
 
231 aa  86.7  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  36.94 
 
 
303 aa  86.7  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  42.42 
 
 
346 aa  85.9  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  42.27 
 
 
268 aa  85.9  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  31.21 
 
 
266 aa  85.5  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  27.67 
 
 
300 aa  85.5  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  39.18 
 
 
244 aa  85.1  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  44.44 
 
 
375 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  37.4 
 
 
373 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  27.98 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  40.59 
 
 
321 aa  84  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  46.39 
 
 
379 aa  84  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  39.18 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  37.4 
 
 
285 aa  83.6  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  39.18 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  36.04 
 
 
313 aa  83.2  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  39.18 
 
 
305 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  40.82 
 
 
375 aa  82.8  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  41.67 
 
 
431 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  29.25 
 
 
313 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  40.4 
 
 
377 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1868  Peptidase M23  41.24 
 
 
398 aa  80.9  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0529967  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  36.92 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  41.67 
 
 
441 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  31.91 
 
 
399 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  33.33 
 
 
389 aa  80.5  0.00000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3063  peptidase M23B  38.79 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000502081  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1364  Peptidase M23  26.27 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000583534  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0177  peptidase M23  40 
 
 
298 aa  80.1  0.00000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  41.82 
 
 
229 aa  79.7  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  31.21 
 
 
399 aa  80.1  0.00000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2318  LysM/M23/M37 peptidase  33.53 
 
 
307 aa  79.7  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.234924  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  43.75 
 
 
474 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  43.75 
 
 
475 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  41.67 
 
 
479 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10968  hypothetical protein  40.91 
 
 
332 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.292549 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  37.72 
 
 
328 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  43.75 
 
 
503 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  30.41 
 
 
379 aa  79  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1843  Peptidase M23  34.15 
 
 
186 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000204635 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  42.11 
 
 
400 aa  78.2  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  40.43 
 
 
446 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  36.73 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  42.11 
 
 
439 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  40.62 
 
 
517 aa  77.8  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  41.49 
 
 
447 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  35.14 
 
 
469 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  34.23 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  41.49 
 
 
447 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  33 
 
 
303 aa  77  0.0000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  43.75 
 
 
328 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2495  Peptidase M23  28.32 
 
 
331 aa  77  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  41.67 
 
 
473 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  41.67 
 
 
472 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  41.67 
 
 
473 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  38.78 
 
 
377 aa  76.6  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  41.57 
 
 
284 aa  76.6  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  41.49 
 
 
448 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  41.67 
 
 
475 aa  76.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  36.08 
 
 
305 aa  76.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  37.11 
 
 
402 aa  76.6  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2376  peptidase M23B  34.96 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0194718  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  36.46 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  42.11 
 
 
404 aa  75.9  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  38 
 
 
301 aa  76.3  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2496  peptidase M23B  25.35 
 
 
296 aa  76.3  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0441433  normal  0.0477862 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  37.5 
 
 
413 aa  75.9  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  34.86 
 
 
316 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>