More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1516 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1516  peptidase M23B  100 
 
 		 367 aa  729    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2495  Peptidase M23  36.77 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2470  Peptidase M23  36.09 
 
 		 332 aa  157  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  32.17 
 
 		 430 aa  119  9e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  47.48 
 
 		 372 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  43.15 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  55.1 
 
 		 411 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  44.83 
 
 		 375 aa  114  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  44.83 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  44.83 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2112  hypothetical protein  51.79 
 
 		 441 aa  109  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000011239  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2250  hypothetical protein  49.11 
 
 		 470 aa  110  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0038093  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  38.37 
 
 		 285 aa  109  7.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  41.29 
 
 		 285 aa  109  9.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1828  hypothetical protein  50.89 
 
 		 440 aa  109  9.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000168261  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  40.13 
 
 		 395 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  42.86 
 
 		 273 aa  107  3e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  47.58 
 
 		 288 aa  106  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3146  peptidase M23B  36.65 
 
 		 299 aa  106  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  52.04 
 
 		 377 aa  106  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001428  cell wall endopeptidase family M23/M37  28.61 
 
 		 404 aa  106  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0015397  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1311  peptidase M23B  27.7 
 
 		 440 aa  106  7e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000378808  hitchhiker  0.00124242 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  38.14 
 
 		 336 aa  106  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  48.98 
 
 		 375 aa  106  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  41.5 
 
 		 244 aa  105  9e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06306  peptidase  51.46 
 
 		 439 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  37.44 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  37.5 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1778  Peptidase M23  43.2 
 
 		 448 aa  105  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000277073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  44.83 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2141  hypothetical protein  47.32 
 
 		 486 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000028881  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  39.11 
 
 		 286 aa  105  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  48.21 
 
 		 440 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  40.97 
 
 		 266 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  29.81 
 
 		 402 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  48.98 
 
 		 377 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  35.21 
 
 		 328 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  47.32 
 
 		 527 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  44.83 
 
 		 321 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  50 
 
 		 379 aa  103  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  44.83 
 
 		 319 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3569  Peptidase M23  34.07 
 
 		 448 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  43.97 
 
 		 404 aa  103  4e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1776  Peptidase M23  39.53 
 
 		 434 aa  103  6e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0954  peptidase M23B  37.65 
 
 		 433 aa  103  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000982445  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  34.04 
 
 		 255 aa  103  6e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3500  peptidase M23B  34.07 
 
 		 448 aa  102  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0209241  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  46.49 
 
 		 431 aa  102  9e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2189  M23/M37 peptidase domain-containing protein  40.54 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1868  Peptidase M23  50 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0529967  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  47.79 
 
 		 524 aa  102  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  46.9 
 
 		 441 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01827  predicted peptidase  48.21 
 
 		 419 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000774309  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  48.21 
 
 		 440 aa  101  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000497391  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1641  Peptidase M23  38.3 
 
 		 286 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0361826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2026  hypothetical protein  47.32 
 
 		 438 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148125  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  48.21 
 
 		 440 aa  101  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  48.21 
 
 		 440 aa  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000737786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2416  hypothetical protein  47.32 
 
 		 410 aa  101  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000144361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  48.21 
 
 		 440 aa  101  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2139  hypothetical protein  47.32 
 
 		 438 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000192356  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01815  hypothetical protein  48.21 
 
 		 440 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  49.11 
 
 		 229 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  48.21 
 
 		 440 aa  101  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000381632  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  32.86 
 
 		 277 aa  101  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  48.21 
 
 		 440 aa  101  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  48.21 
 
 		 440 aa  101  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0242  Peptidase M23  40.74 
 
 		 456 aa  100  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  41.33 
 
 		 233 aa  101  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  49.56 
 
 		 490 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  45.76 
 
 		 498 aa  100  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  39.04 
 
 		 312 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  47.96 
 
 		 379 aa  100  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  50.51 
 
 		 491 aa  100  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  46.46 
 
 		 400 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  36.11 
 
 		 306 aa  99.4  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  44.07 
 
 		 301 aa  99.8  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0795  peptidase M23B  39.87 
 
 		 253 aa  99.8  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  42.07 
 
 		 313 aa  99.4  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  48.48 
 
 		 374 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2079  M24/M37 family peptidase  33.85 
 
 		 435 aa  99  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000207856  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  46.46 
 
 		 271 aa  99  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  43.07 
 
 		 430 aa  99  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0762  Peptidase M23  36.69 
 
 		 435 aa  98.2  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.788774  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2912  peptidase M23B  44.09 
 
 		 330 aa  98.2  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.58 
 
 		 304 aa  98.6  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  47.46 
 
 		 285 aa  98.2  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0853  exported peptidase  48.65 
 
 		 446 aa  98.6  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  43.97 
 
 		 414 aa  97.8  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  43.88 
 
 		 373 aa  97.4  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  49.56 
 
 		 238 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  42.11 
 
 		 288 aa  97.8  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  47.96 
 
 		 379 aa  97.4  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  43.8 
 
 		 268 aa  97.4  3e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  45.8 
 
 		 238 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1358  hypothetical protein  45.54 
 
 		 439 aa  97.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370523 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2104  hypothetical protein  45.54 
 
 		 439 aa  97.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.391602  normal  0.665324 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1234  hypothetical protein  45.54 
 
 		 439 aa  97.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00307381  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  47.01 
 
 		 238 aa  97.1  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  50 
 
 		 446 aa  97.1  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>