More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0123 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0123  Peptidase M23  100 
 
 		 336 aa  663    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.246102 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  53.9 
 
 		 313 aa  282  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1721  peptidase M23B  50.51 
 
 		 317 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2265  Peptidase M23  45 
 
 		 299 aa  223  3e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.617569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  45.3 
 
 		 336 aa  222  7e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0940  Peptidase M23  42.12 
 
 		 291 aa  200  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252904  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  43.06 
 
 		 282 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  43.06 
 
 		 282 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1445  peptidase, M23/M37 family  40.55 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.813249  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1026  M24/M37 family peptidase  40.93 
 
 		 275 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  42.13 
 
 		 271 aa  159  6e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4593  peptidase M23B  39.35 
 
 		 273 aa  159  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1066  peptidase M23B  40.47 
 
 		 275 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0830638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1024  peptidase M23B  38.49 
 
 		 275 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1258  peptidase M23B  40.09 
 
 		 274 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3491  peptidase M23B  40.64 
 
 		 280 aa  158  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.172269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  42.59 
 
 		 274 aa  156  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  42.01 
 
 		 277 aa  155  8e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4198  peptidase M23B  40 
 
 		 275 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  43.32 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2485  peptidase M23B  41.04 
 
 		 316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927906 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1364  Peptidase M23  43.33 
 
 		 263 aa  147  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000583534  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2496  peptidase M23B  42.38 
 
 		 296 aa  145  9e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0441433  normal  0.0477862 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  39.23 
 
 		 255 aa  142  9e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  43.68 
 
 		 293 aa  139  7e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4779  peptidase M23B  42.53 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  42.65 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  36.41 
 
 		 273 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  32.07 
 
 		 286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2044  Peptidase M23  37.67 
 
 		 272 aa  136  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3617  Peptidase M23  39.81 
 
 		 322 aa  136  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  35.44 
 
 		 266 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  35.44 
 
 		 244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1342  peptidase M23B  38.68 
 
 		 296 aa  134  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.339231 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  34.29 
 
 		 268 aa  133  3.9999999999999996e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1051  peptidase M23B  37.27 
 
 		 282 aa  132  6e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  36.96 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  35.04 
 
 		 300 aa  129  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  43.43 
 
 		 319 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1925  peptidase  36.01 
 
 		 283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  42.86 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  43.43 
 
 		 321 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  34.84 
 
 		 285 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  42.22 
 
 		 306 aa  125  8.000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1641  Peptidase M23  37.33 
 
 		 286 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0361826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1170  peptidase M23B  35.25 
 
 		 294 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174403 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  38.81 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2288  peptidase M23B  49.21 
 
 		 141 aa  124  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  hitchhiker  0.000223736 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00362  peptidase  40.98 
 
 		 279 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0922306  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  35.09 
 
 		 269 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0622  peptidase M23B  40.33 
 
 		 280 aa  119  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1296  M24/M37 family peptidase  40 
 
 		 276 aa  119  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.492814  decreased coverage  0.0068339 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  31.73 
 
 		 285 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  37.21 
 
 		 285 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2436  peptidase M23B  36.46 
 
 		 278 aa  113  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2737  Peptidase M23  40.44 
 
 		 281 aa  110  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.225501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1812  peptidase M23B  33.9 
 
 		 282 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0863419  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2615  M24/M37 family peptidase  31.55 
 
 		 288 aa  109  9.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144035  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1474  peptidase M23B  36.31 
 
 		 287 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00227423  normal  0.920527 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  52.71 
 
 		 415 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0304  hypothetical protein  39.88 
 
 		 272 aa  108  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  39.88 
 
 		 285 aa  108  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01913  metalloendopeptidase-like membrane protein  32.97 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0631175  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1224  peptidase M23B  43.48 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0694814 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2783  peptidase M23B  34.15 
 
 		 286 aa  106  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  44.1 
 
 		 455 aa  106  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3146  peptidase M23B  33.81 
 
 		 299 aa  106  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0169  peptidase M23B  37.56 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  47.97 
 
 		 414 aa  104  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1767  peptidase M23B  34.76 
 
 		 280 aa  103  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287118  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6051  Peptidase M23  48.44 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.72546  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  46.51 
 
 		 392 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2378  peptidase M23B  30.8 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.235139  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1820  Peptidase M23  32.78 
 
 		 312 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0518424  normal  0.297584 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2180  M24/M37 family peptidase  32.32 
 
 		 311 aa  100  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  42.41 
 
 		 457 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  42.41 
 
 		 456 aa  99.4  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2214  peptidase M23B  30.39 
 
 		 301 aa  99.4  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.558528 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2423  peptidase M23B  30.39 
 
 		 306 aa  99.4  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2285  peptidase M23B  33.54 
 
 		 313 aa  99.4  8e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00385492  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2531  peptidase M23B  32.22 
 
 		 312 aa  99  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  45.74 
 
 		 391 aa  99.4  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2524  peptidase M23B  32.22 
 
 		 287 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0512  peptidase M23B  38.83 
 
 		 453 aa  98.6  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0024686  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  42.41 
 
 		 459 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2290  peptidase M23B  30.39 
 
 		 306 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0178936  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1575  peptidase M23B  34.52 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.745708  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  44.19 
 
 		 392 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2646  peptidase M23B  32.22 
 
 		 287 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  44.16 
 
 		 332 aa  97.8  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1560  M24/M37 family peptidase  35.37 
 
 		 282 aa  97.1  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.275823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0630  peptidase M23B  37.34 
 
 		 312 aa  96.3  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0558086 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  40.24 
 
 		 453 aa  95.9  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  36.36 
 
 		 469 aa  95.9  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3376  peptidase M23B  33.7 
 
 		 269 aa  95.9  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  40.85 
 
 		 454 aa  95.5  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  35.76 
 
 		 375 aa  95.5  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2495  Peptidase M23  32.5 
 
 		 331 aa  95.1  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  45.11 
 
 		 450 aa  95.5  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  40 
 
 		 455 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>