More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2265 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2265  Peptidase M23  100 
 
 
299 aa  595  1e-169  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.617569  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  43.56 
 
 
313 aa  231  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0123  Peptidase M23  45 
 
 
336 aa  222  6e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.246102 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1721  peptidase M23B  40.28 
 
 
317 aa  192  5e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216708  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0940  Peptidase M23  38.32 
 
 
291 aa  192  8e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252904  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  33.69 
 
 
336 aa  159  7e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  44.72 
 
 
282 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  44.72 
 
 
282 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  47.98 
 
 
274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4593  peptidase M23B  44.31 
 
 
273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1024  peptidase M23B  45.51 
 
 
275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1026  M24/M37 family peptidase  45.51 
 
 
275 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1066  peptidase M23B  44.19 
 
 
275 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0830638  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4198  peptidase M23B  43.02 
 
 
275 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663221  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1445  peptidase, M23/M37 family  44.91 
 
 
274 aa  146  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.813249  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  44.16 
 
 
290 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1258  peptidase M23B  44.91 
 
 
274 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3491  peptidase M23B  40.2 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.172269  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1364  Peptidase M23  45.35 
 
 
263 aa  139  6e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000583534  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  34.25 
 
 
285 aa  139  7.999999999999999e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2496  peptidase M23B  44.77 
 
 
296 aa  138  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0441433  normal  0.0477862 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2485  peptidase M23B  43.27 
 
 
316 aa  136  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.927906 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  38.66 
 
 
271 aa  135  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  36.36 
 
 
277 aa  133  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1051  peptidase M23B  38.02 
 
 
282 aa  133  5e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1342  peptidase M23B  41.79 
 
 
296 aa  132  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.339231 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4779  peptidase M23B  42.94 
 
 
289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3617  Peptidase M23  38.19 
 
 
322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  36.18 
 
 
300 aa  127  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2044  Peptidase M23  48.3 
 
 
272 aa  126  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  35.03 
 
 
255 aa  124  2e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  34.67 
 
 
300 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2436  peptidase M23B  40.11 
 
 
278 aa  123  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  38.5 
 
 
286 aa  123  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  32.77 
 
 
268 aa  122  5e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  33.15 
 
 
273 aa  122  7e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  32.58 
 
 
266 aa  122  7e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  33.15 
 
 
244 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1170  peptidase M23B  32.54 
 
 
294 aa  120  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00174403 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1925  peptidase  39.46 
 
 
283 aa  119  6e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2288  peptidase M23B  47.54 
 
 
141 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  hitchhiker  0.000223736 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  32.95 
 
 
269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  37.19 
 
 
285 aa  115  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3376  peptidase M23B  33.76 
 
 
269 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1641  Peptidase M23  38.04 
 
 
286 aa  112  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0361826  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00362  peptidase  36.63 
 
 
279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0922306  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  37.07 
 
 
293 aa  107  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  37.43 
 
 
312 aa  106  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0622  peptidase M23B  37.84 
 
 
280 aa  106  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  38.55 
 
 
285 aa  105  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  35.2 
 
 
306 aa  104  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01913  metalloendopeptidase-like membrane protein  25.5 
 
 
305 aa  103  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0631175  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2737  Peptidase M23  33.18 
 
 
281 aa  103  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.225501  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  34.24 
 
 
319 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  34.44 
 
 
318 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  34.24 
 
 
321 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2615  M24/M37 family peptidase  27.16 
 
 
288 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144035  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2783  peptidase M23B  32.4 
 
 
286 aa  100  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392125  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1296  M24/M37 family peptidase  36.73 
 
 
276 aa  98.6  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.492814  decreased coverage  0.0068339 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  43.48 
 
 
328 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1641  peptidase M23B  49.48 
 
 
433 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000435092  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1678  peptidase M23B  49.48 
 
 
433 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411923  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2378  peptidase M23B  30.73 
 
 
282 aa  97.4  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.235139  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1656  peptidase M23B  49.48 
 
 
433 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000516182  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2702  Peptidase M23  49.48 
 
 
433 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000811311  hitchhiker  0.0000822209 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2455  peptidase M23B  36.88 
 
 
418 aa  97.1  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186992  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0304  hypothetical protein  32.78 
 
 
272 aa  97.4  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1590  peptidase M23B  37.74 
 
 
424 aa  96.3  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0596835  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1812  peptidase M23B  32.56 
 
 
282 aa  95.9  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0863419  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  32.22 
 
 
285 aa  95.9  8e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  36.77 
 
 
375 aa  95.5  9e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2842  M24/M37 family peptidase  45.45 
 
 
434 aa  95.1  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0192  Peptidase M23  35.15 
 
 
312 aa  95.1  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2632  peptidase M23B  37.74 
 
 
418 aa  94.4  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.252347  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  42.97 
 
 
392 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  40.14 
 
 
316 aa  94.7  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1516  peptidase M23B  32.08 
 
 
367 aa  94.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  39.74 
 
 
423 aa  94.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2448  peptidase M23B  47.42 
 
 
431 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.093884  hitchhiker  0.000000000665253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2518  peptidase M23B  47.42 
 
 
431 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0290484  unclonable  0.0000200771 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0630  peptidase M23B  35.29 
 
 
312 aa  94.4  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0558086 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2610  peptidase M23B  47.42 
 
 
431 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.326466  hitchhiker  0.000000038042 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1533  peptidase M23B  46.39 
 
 
431 aa  93.6  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00239746  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  30.49 
 
 
450 aa  93.6  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1474  peptidase M23B  30.73 
 
 
287 aa  92.8  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00227423  normal  0.920527 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  41.54 
 
 
392 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1269  M24/M37 family peptidase  45.36 
 
 
419 aa  92  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.711589  hitchhiker  0.00022496 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  38.1 
 
 
301 aa  90.9  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  43.59 
 
 
300 aa  90.5  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  42.74 
 
 
391 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2180  M24/M37 family peptidase  28.52 
 
 
311 aa  89.7  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  34.01 
 
 
475 aa  89.7  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  34.23 
 
 
309 aa  89.4  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  37.69 
 
 
442 aa  89.4  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1767  peptidase M23B  29.61 
 
 
280 aa  89  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287118  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  36.31 
 
 
315 aa  89  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  38.82 
 
 
442 aa  88.2  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3146  peptidase M23B  32.43 
 
 
299 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  40.83 
 
 
402 aa  88.6  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1560  M24/M37 family peptidase  32.04 
 
 
282 aa  88.6  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.275823  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>