More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1684 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  100 
 
 
277 aa  561  1.0000000000000001e-159  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  48.16 
 
 
274 aa  226  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3491  peptidase M23B  48.37 
 
 
280 aa  225  6e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.172269  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4593  peptidase M23B  44.67 
 
 
273 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1026  M24/M37 family peptidase  45.87 
 
 
275 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1066  peptidase M23B  45.87 
 
 
275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0830638  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1024  peptidase M23B  45.87 
 
 
275 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4198  peptidase M23B  45.45 
 
 
275 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663221  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1445  peptidase, M23/M37 family  45.68 
 
 
274 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.813249  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1258  peptidase M23B  46.09 
 
 
274 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  46.99 
 
 
282 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  46.99 
 
 
282 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  48 
 
 
290 aa  205  6e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2044  Peptidase M23  47.52 
 
 
272 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  44.7 
 
 
271 aa  203  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3617  Peptidase M23  46.03 
 
 
322 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2485  peptidase M23B  44.85 
 
 
316 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.927906 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1342  peptidase M23B  45.24 
 
 
296 aa  200  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.339231 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1364  Peptidase M23  43.31 
 
 
263 aa  190  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000583534  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2496  peptidase M23B  42.91 
 
 
296 aa  189  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0441433  normal  0.0477862 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4779  peptidase M23B  43.11 
 
 
289 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  36.13 
 
 
300 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  36.48 
 
 
300 aa  163  3e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0940  Peptidase M23  44.66 
 
 
291 aa  158  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252904  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0123  Peptidase M23  42.01 
 
 
336 aa  155  8e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.246102 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2288  peptidase M23B  57.48 
 
 
141 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  hitchhiker  0.000223736 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  39.11 
 
 
313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  46.24 
 
 
336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1051  peptidase M23B  38.86 
 
 
282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  35.14 
 
 
293 aa  135  5e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1224  peptidase M23B  40.18 
 
 
232 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0694814 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2265  Peptidase M23  36.36 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.617569  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0622  peptidase M23B  41.11 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  35.68 
 
 
286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  36.87 
 
 
269 aa  130  3e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  42.86 
 
 
318 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1721  peptidase M23B  36.53 
 
 
317 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216708  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  42.86 
 
 
321 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  42.86 
 
 
319 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  38.15 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  39.05 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  34.18 
 
 
285 aa  126  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  37.87 
 
 
244 aa  125  7e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  34.76 
 
 
285 aa  124  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1296  M24/M37 family peptidase  36.56 
 
 
276 aa  124  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.492814  decreased coverage  0.0068339 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  36.69 
 
 
268 aa  122  6e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  35.98 
 
 
328 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01913  metalloendopeptidase-like membrane protein  39.77 
 
 
305 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0631175  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2436  peptidase M23B  38.46 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00362  peptidase  43.37 
 
 
279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0922306  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  28.45 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  35.84 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2378  peptidase M23B  34.83 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.235139  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1641  Peptidase M23  29.43 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0361826  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2737  Peptidase M23  39.67 
 
 
281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.225501  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1925  peptidase  32.59 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  40.99 
 
 
285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  39.88 
 
 
402 aa  109  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  47.86 
 
 
303 aa  109  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1812  peptidase M23B  32.71 
 
 
282 aa  109  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0863419  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0304  hypothetical protein  40.99 
 
 
272 aa  109  6e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  47.5 
 
 
300 aa  108  8.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2783  peptidase M23B  32.71 
 
 
286 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392125  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  33.78 
 
 
498 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  41.67 
 
 
470 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3146  peptidase M23B  41.67 
 
 
299 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  35.03 
 
 
376 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1474  peptidase M23B  33.64 
 
 
287 aa  107  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00227423  normal  0.920527 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  52.04 
 
 
448 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  51.02 
 
 
445 aa  106  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  28.98 
 
 
312 aa  106  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1575  peptidase M23B  33.5 
 
 
302 aa  105  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.745708  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  39.88 
 
 
379 aa  105  9e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  40.28 
 
 
475 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3376  peptidase M23B  37.36 
 
 
269 aa  104  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  40.28 
 
 
491 aa  104  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  44.92 
 
 
468 aa  104  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  45.53 
 
 
429 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  43.97 
 
 
404 aa  103  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  46.55 
 
 
301 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  45.76 
 
 
466 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  44.92 
 
 
491 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  44.92 
 
 
482 aa  103  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  42.21 
 
 
375 aa  103  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  44.92 
 
 
468 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  47.24 
 
 
460 aa  103  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  44.92 
 
 
468 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  44.92 
 
 
468 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  44.92 
 
 
468 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  44.92 
 
 
512 aa  103  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2141  peptidase M23B  48.78 
 
 
649 aa  103  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.506727 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  43.09 
 
 
462 aa  102  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  44.07 
 
 
466 aa  102  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  46.09 
 
 
372 aa  102  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  41.21 
 
 
309 aa  102  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  45.53 
 
 
353 aa  102  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  53.06 
 
 
411 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  39.58 
 
 
475 aa  101  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1516  peptidase M23B  32.86 
 
 
367 aa  101  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  47.24 
 
 
413 aa  101  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>