More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4779 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4779  peptidase M23B  100 
 
 
289 aa  569  1e-161  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1342  peptidase M23B  67.3 
 
 
296 aa  339  2e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.339231 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1364  Peptidase M23  68.7 
 
 
263 aa  332  3e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000583534  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3617  Peptidase M23  66.03 
 
 
322 aa  332  5e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2496  peptidase M23B  68.32 
 
 
296 aa  330  2e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0441433  normal  0.0477862 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2485  peptidase M23B  62.45 
 
 
316 aa  308  5e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.927906 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  59.23 
 
 
290 aa  280  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1258  peptidase M23B  48.26 
 
 
274 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4198  peptidase M23B  46.88 
 
 
275 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663221  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1445  peptidase, M23/M37 family  47.88 
 
 
274 aa  222  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.813249  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4593  peptidase M23B  46.3 
 
 
273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1024  peptidase M23B  46.72 
 
 
275 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3491  peptidase M23B  48.65 
 
 
280 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.172269  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1066  peptidase M23B  46.12 
 
 
275 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0830638  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1026  M24/M37 family peptidase  45.74 
 
 
275 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  46.5 
 
 
282 aa  215  7e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  46.15 
 
 
282 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2288  peptidase M23B  76.22 
 
 
141 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  hitchhiker  0.000223736 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  47.49 
 
 
274 aa  209  5e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  44.7 
 
 
271 aa  206  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  44.31 
 
 
277 aa  196  3e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  42.36 
 
 
300 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2044  Peptidase M23  44.44 
 
 
272 aa  176  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  37.41 
 
 
300 aa  176  4e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  42.61 
 
 
313 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1721  peptidase M23B  39.3 
 
 
317 aa  156  4e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216708  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1051  peptidase M23B  41.28 
 
 
282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0123  Peptidase M23  42.53 
 
 
336 aa  138  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.246102 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  42.61 
 
 
336 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2265  Peptidase M23  42.94 
 
 
299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.617569  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  41.49 
 
 
285 aa  123  3e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0304  hypothetical protein  41.49 
 
 
272 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2783  peptidase M23B  36.36 
 
 
286 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392125  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0940  Peptidase M23  36.36 
 
 
291 aa  120  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252904  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1812  peptidase M23B  36.56 
 
 
282 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0863419  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0622  peptidase M23B  42.6 
 
 
280 aa  117  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  32.59 
 
 
285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2436  peptidase M23B  38.14 
 
 
278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1296  M24/M37 family peptidase  39.25 
 
 
276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.492814  decreased coverage  0.0068339 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1474  peptidase M23B  34.76 
 
 
287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00227423  normal  0.920527 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  35.04 
 
 
293 aa  113  5e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00362  peptidase  37.5 
 
 
279 aa  112  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0922306  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  38.51 
 
 
285 aa  112  6e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2737  Peptidase M23  40.5 
 
 
281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.225501  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  34.39 
 
 
286 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  35.44 
 
 
312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  36.36 
 
 
255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1224  peptidase M23B  36.16 
 
 
232 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0694814 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1767  peptidase M23B  33.33 
 
 
280 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287118  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2531  peptidase M23B  32.79 
 
 
312 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  34.29 
 
 
268 aa  107  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1925  peptidase  33.08 
 
 
283 aa  107  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  36.78 
 
 
318 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1820  Peptidase M23  31.98 
 
 
312 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0518424  normal  0.297584 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01913  metalloendopeptidase-like membrane protein  39.2 
 
 
305 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0631175  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  36.57 
 
 
321 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2524  peptidase M23B  31.98 
 
 
287 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  33.51 
 
 
306 aa  106  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  36.78 
 
 
319 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2285  peptidase M23B  35.14 
 
 
313 aa  106  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00385492  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2646  peptidase M23B  31.98 
 
 
287 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1170  peptidase M23B  33.68 
 
 
294 aa  106  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00174403 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0169  peptidase M23B  32.61 
 
 
284 aa  105  7e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2378  peptidase M23B  34.05 
 
 
282 aa  105  9e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.235139  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3376  peptidase M23B  35.87 
 
 
269 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  30.7 
 
 
266 aa  103  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2214  peptidase M23B  32.8 
 
 
301 aa  103  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.558528 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2290  peptidase M23B  32.8 
 
 
306 aa  103  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0178936  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3146  peptidase M23B  37.79 
 
 
299 aa  102  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  28.44 
 
 
285 aa  102  8e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2423  peptidase M23B  32.26 
 
 
306 aa  102  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1575  peptidase M23B  35.11 
 
 
302 aa  101  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.745708  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2180  M24/M37 family peptidase  34.05 
 
 
311 aa  101  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  31.87 
 
 
269 aa  100  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2615  M24/M37 family peptidase  39.57 
 
 
288 aa  100  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144035  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1641  Peptidase M23  30.47 
 
 
286 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0361826  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0630  peptidase M23B  37.57 
 
 
312 aa  100  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0558086 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1560  M24/M37 family peptidase  33.87 
 
 
282 aa  100  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.275823  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  34.66 
 
 
273 aa  99.8  4e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  41.94 
 
 
244 aa  98.2  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3107  peptidase M23B  36.46 
 
 
303 aa  97.4  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  33.33 
 
 
328 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  45.9 
 
 
394 aa  92.8  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  40 
 
 
304 aa  90.5  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  39.55 
 
 
332 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  40.32 
 
 
469 aa  87.8  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  37.96 
 
 
303 aa  87.8  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  40.98 
 
 
302 aa  85.5  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  38.52 
 
 
320 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  37.4 
 
 
470 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  38.36 
 
 
363 aa  84.3  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  42.97 
 
 
328 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  36.5 
 
 
475 aa  84  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  40.5 
 
 
316 aa  84.3  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  40.65 
 
 
332 aa  84.3  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  42.02 
 
 
413 aa  84.3  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  37.6 
 
 
491 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  51.14 
 
 
377 aa  83.6  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  40.98 
 
 
238 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  34.1 
 
 
327 aa  82.8  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>