More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00362 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00362  peptidase  100 
 
 
279 aa  556  1e-157  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0922306  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2737  Peptidase M23  86.99 
 
 
281 aa  414  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.225501  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  74.49 
 
 
285 aa  379  1e-104  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0304  hypothetical protein  69.37 
 
 
272 aa  379  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3376  peptidase M23B  49.79 
 
 
269 aa  242  5e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1560  M24/M37 family peptidase  47.95 
 
 
282 aa  239  5e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.275823  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1474  peptidase M23B  45.97 
 
 
287 aa  236  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00227423  normal  0.920527 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2285  peptidase M23B  45.6 
 
 
313 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00385492  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2423  peptidase M23B  43.4 
 
 
306 aa  235  8e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2214  peptidase M23B  45.53 
 
 
301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.558528 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1575  peptidase M23B  46.33 
 
 
302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.745708  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1296  M24/M37 family peptidase  47.13 
 
 
276 aa  233  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.492814  decreased coverage  0.0068339 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2180  M24/M37 family peptidase  46.31 
 
 
311 aa  233  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2783  peptidase M23B  43.15 
 
 
286 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392125  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1812  peptidase M23B  43.2 
 
 
282 aa  232  5e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0863419  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2436  peptidase M23B  47.11 
 
 
278 aa  232  7.000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2290  peptidase M23B  44.72 
 
 
306 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0178936  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2646  peptidase M23B  41.48 
 
 
287 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2531  peptidase M23B  42.22 
 
 
312 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2524  peptidase M23B  43.88 
 
 
287 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2378  peptidase M23B  42.57 
 
 
282 aa  223  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.235139  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1820  Peptidase M23  41.45 
 
 
312 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0518424  normal  0.297584 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1767  peptidase M23B  43.57 
 
 
280 aa  221  9e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287118  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0622  peptidase M23B  46.78 
 
 
280 aa  217  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2615  M24/M37 family peptidase  43.88 
 
 
288 aa  209  6e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144035  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3146  peptidase M23B  44.9 
 
 
299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01913  metalloendopeptidase-like membrane protein  40.7 
 
 
305 aa  186  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0631175  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3107  peptidase M23B  44.86 
 
 
303 aa  176  4e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1224  peptidase M23B  43.98 
 
 
232 aa  156  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0694814 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  39.71 
 
 
271 aa  155  7e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  42.08 
 
 
274 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0169  peptidase M23B  40.42 
 
 
284 aa  150  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  41.62 
 
 
282 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0630  peptidase M23B  39.26 
 
 
312 aa  149  5e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0558086 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1051  peptidase M23B  42.21 
 
 
282 aa  149  6e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  40.61 
 
 
282 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1445  peptidase, M23/M37 family  41.53 
 
 
274 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.813249  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0940  Peptidase M23  37.44 
 
 
291 aa  144  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252904  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1026  M24/M37 family peptidase  39.67 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1258  peptidase M23B  40.44 
 
 
274 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3491  peptidase M23B  42.08 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.172269  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  37.78 
 
 
266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  41.03 
 
 
328 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1066  peptidase M23B  39.67 
 
 
275 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0830638  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  37.04 
 
 
255 aa  138  7.999999999999999e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1024  peptidase M23B  39.13 
 
 
275 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3617  Peptidase M23  41.92 
 
 
322 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  37.78 
 
 
273 aa  137  2e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  36.67 
 
 
244 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4198  peptidase M23B  38.59 
 
 
275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663221  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  34.05 
 
 
268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4593  peptidase M23B  37.5 
 
 
273 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2044  Peptidase M23  38.5 
 
 
272 aa  132  5e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  37.31 
 
 
300 aa  129  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1364  Peptidase M23  43.39 
 
 
263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000583534  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2485  peptidase M23B  41.8 
 
 
316 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.927906 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  35.53 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  36.27 
 
 
300 aa  127  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2496  peptidase M23B  42 
 
 
296 aa  127  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0441433  normal  0.0477862 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  40.61 
 
 
290 aa  126  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  31.56 
 
 
313 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  41.01 
 
 
336 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  39.7 
 
 
293 aa  123  3e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  38.02 
 
 
319 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  37.5 
 
 
318 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 
269 aa  122  7e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  42.86 
 
 
321 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0123  Peptidase M23  40.98 
 
 
336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.246102 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1342  peptidase M23B  38.81 
 
 
296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.339231 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  42.11 
 
 
285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2288  peptidase M23B  53.28 
 
 
141 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  hitchhiker  0.000223736 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1721  peptidase M23B  39.08 
 
 
317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216708  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  36.49 
 
 
285 aa  115  6e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  40.43 
 
 
312 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  43.37 
 
 
277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  39.87 
 
 
286 aa  113  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4779  peptidase M23B  37.5 
 
 
289 aa  112  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2265  Peptidase M23  36.63 
 
 
299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.617569  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  36.7 
 
 
306 aa  109  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1925  peptidase  37.76 
 
 
283 aa  107  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  41.04 
 
 
395 aa  107  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1170  peptidase M23B  35.64 
 
 
294 aa  107  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00174403 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2495  Peptidase M23  42.95 
 
 
331 aa  107  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  37.89 
 
 
301 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  30.11 
 
 
301 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  36.73 
 
 
265 aa  99.4  5e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  37.5 
 
 
305 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  37.5 
 
 
305 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  37.5 
 
 
305 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1641  Peptidase M23  34.18 
 
 
286 aa  96.3  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0361826  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  39.2 
 
 
501 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2270  peptidase M23  38.46 
 
 
494 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.561142 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  35.26 
 
 
309 aa  95.5  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2470  Peptidase M23  40.51 
 
 
332 aa  95.5  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  44.03 
 
 
321 aa  94.7  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7396  Peptidase M23  39.2 
 
 
537 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128641  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2141  peptidase M23B  41.18 
 
 
649 aa  94.4  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.506727 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  41.33 
 
 
320 aa  93.6  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1181  Peptidase M23  42.77 
 
 
241 aa  93.6  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000634852 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  43.85 
 
 
302 aa  92.8  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>