More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2378 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2378  peptidase M23B  100 
 
 		 282 aa  578  1e-164  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.235139  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1575  peptidase M23B  75.36 
 
 		 302 aa  432  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.745708  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2285  peptidase M23B  70.82 
 
 		 313 aa  425  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00385492  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2423  peptidase M23B  74.26 
 
 		 306 aa  424  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2180  M24/M37 family peptidase  73.9 
 
 		 311 aa  422  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2531  peptidase M23B  73.53 
 
 		 312 aa  417  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2524  peptidase M23B  73.16 
 
 		 287 aa  417  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2646  peptidase M23B  72.43 
 
 		 287 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1820  Peptidase M23  72.79 
 
 		 312 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0518424  normal  0.297584 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2214  peptidase M23B  75 
 
 		 301 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.558528 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2290  peptidase M23B  74.71 
 
 		 306 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0178936  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1474  peptidase M23B  69.63 
 
 		 287 aa  396  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00227423  normal  0.920527 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2783  peptidase M23B  69.81 
 
 		 286 aa  394  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1812  peptidase M23B  70.93 
 
 		 282 aa  391  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0863419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1767  peptidase M23B  68.75 
 
 		 280 aa  384  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287118  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1560  M24/M37 family peptidase  63.1 
 
 		 282 aa  365  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.275823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2436  peptidase M23B  50.76 
 
 		 278 aa  278  8e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3376  peptidase M23B  50.56 
 
 		 269 aa  276  3e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2615  M24/M37 family peptidase  49.63 
 
 		 288 aa  268  7e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144035  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1296  M24/M37 family peptidase  46.64 
 
 		 276 aa  249  3e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.492814  decreased coverage  0.0068339 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0622  peptidase M23B  45.7 
 
 		 280 aa  240  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01913  metalloendopeptidase-like membrane protein  45.6 
 
 		 305 aa  233  4.0000000000000004e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0631175  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00362  peptidase  43.46 
 
 		 279 aa  221  8e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0922306  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  43.75 
 
 		 285 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0304  hypothetical protein  43.75 
 
 		 272 aa  210  2e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2737  Peptidase M23  43.09 
 
 		 281 aa  208  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.225501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3146  peptidase M23B  42.86 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3107  peptidase M23B  41.3 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0169  peptidase M23B  38.06 
 
 		 284 aa  172  5e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0630  peptidase M23B  39.34 
 
 		 312 aa  169  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0558086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1224  peptidase M23B  41.33 
 
 		 232 aa  168  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0694814 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1051  peptidase M23B  34.53 
 
 		 282 aa  145  6e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  40.56 
 
 		 274 aa  135  9e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  37.7 
 
 		 300 aa  134  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  38.8 
 
 		 300 aa  134  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  36.02 
 
 		 271 aa  134  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  31.68 
 
 		 268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2485  peptidase M23B  39.46 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927906 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  34.95 
 
 		 282 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3491  peptidase M23B  35.75 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.172269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2044  Peptidase M23  33.85 
 
 		 272 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1024  peptidase M23B  35.52 
 
 		 275 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  36.46 
 
 		 290 aa  122  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  35.2 
 
 		 282 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1026  M24/M37 family peptidase  35.59 
 
 		 275 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4198  peptidase M23B  33.89 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1066  peptidase M23B  35.2 
 
 		 275 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0830638  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1445  peptidase, M23/M37 family  36.81 
 
 		 274 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.813249  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2496  peptidase M23B  35.2 
 
 		 296 aa  119  7e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0441433  normal  0.0477862 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1364  Peptidase M23  35.2 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000583534  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  41.72 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4593  peptidase M23B  33.66 
 
 		 273 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1258  peptidase M23B  35.16 
 
 		 274 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  34.83 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  36.32 
 
 		 312 aa  113  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3617  Peptidase M23  45.08 
 
 		 322 aa  112  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  34.76 
 
 		 313 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  33.72 
 
 		 328 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2288  peptidase M23B  44.72 
 
 		 141 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  hitchhiker  0.000223736 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  37.36 
 
 		 306 aa  109  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  30.1 
 
 		 255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  29.61 
 
 		 285 aa  109  5e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  33.75 
 
 		 336 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  31.25 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  30.77 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0940  Peptidase M23  36.48 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252904  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  31.39 
 
 		 285 aa  105  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4779  peptidase M23B  34.05 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  30.77 
 
 		 266 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1721  peptidase M23B  39.1 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  38.46 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  38.46 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  38.46 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1342  peptidase M23B  44.07 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.339231 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2455  peptidase M23B  27.46 
 
 		 418 aa  102  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186992  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  37.11 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  38.4 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  29.02 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0123  Peptidase M23  30.8 
 
 		 336 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.246102 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1641  peptidase M23B  31.86 
 
 		 433 aa  99.4  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000435092  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1656  peptidase M23B  31.86 
 
 		 433 aa  99.4  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000516182  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2702  Peptidase M23  31.86 
 
 		 433 aa  99.4  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000811311  hitchhiker  0.0000822209 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1678  peptidase M23B  31.86 
 
 		 433 aa  99.4  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411923  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  39.46 
 
 		 309 aa  99  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2448  peptidase M23B  31.28 
 
 		 431 aa  99.4  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.093884  hitchhiker  0.000000000665253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2518  peptidase M23B  31.28 
 
 		 431 aa  99.4  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0290484  unclonable  0.0000200771 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2610  peptidase M23B  31.28 
 
 		 431 aa  98.6  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.326466  hitchhiker  0.000000038042 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1533  peptidase M23B  30.36 
 
 		 431 aa  98.2  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00239746  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2265  Peptidase M23  30.73 
 
 		 299 aa  97.4  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.617569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  30 
 
 		 286 aa  96.7  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1269  M24/M37 family peptidase  29.18 
 
 		 419 aa  95.9  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.711589  hitchhiker  0.00022496 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2842  M24/M37 family peptidase  30.84 
 
 		 434 aa  95.5  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001428  cell wall endopeptidase family M23/M37  29.65 
 
 		 404 aa  95.5  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0015397  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2504  peptidase M23B  29.77 
 
 		 423 aa  94  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331029  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1170  peptidase M23B  33.7 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174403 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1590  peptidase M23B  29.46 
 
 		 424 aa  93.6  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0596835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  35.77 
 
 		 305 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  35.77 
 
 		 305 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  34.78 
 
 		 305 aa  93.2  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3011  peptidase M23B  40.14 
 
 		 482 aa  92  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.698295 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>