More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4593 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4593  peptidase M23B  100 
 
 
273 aa  557  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1445  peptidase, M23/M37 family  83.58 
 
 
274 aa  475  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.813249  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1258  peptidase M23B  83.94 
 
 
274 aa  472  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1026  M24/M37 family peptidase  85.77 
 
 
275 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1024  peptidase M23B  85.38 
 
 
275 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4198  peptidase M23B  84.98 
 
 
275 aa  441  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663221  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1066  peptidase M23B  85.38 
 
 
275 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0830638  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  71.99 
 
 
282 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  72.34 
 
 
282 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3491  peptidase M23B  74.03 
 
 
280 aa  394  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.172269  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  69.96 
 
 
274 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  48.26 
 
 
271 aa  242  6e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2044  Peptidase M23  45.23 
 
 
272 aa  226  3e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  44.67 
 
 
277 aa  223  4e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2485  peptidase M23B  46.34 
 
 
316 aa  219  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.927906 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1364  Peptidase M23  45.12 
 
 
263 aa  216  4e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000583534  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  44.31 
 
 
290 aa  216  4e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2496  peptidase M23B  45.12 
 
 
296 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0441433  normal  0.0477862 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1342  peptidase M23B  45.34 
 
 
296 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.339231 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4779  peptidase M23B  46.3 
 
 
289 aa  211  7e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3617  Peptidase M23  44.72 
 
 
322 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  35.4 
 
 
300 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  35.4 
 
 
300 aa  176  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  38.08 
 
 
313 aa  161  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2288  peptidase M23B  55.4 
 
 
141 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  hitchhiker  0.000223736 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0123  Peptidase M23  39.35 
 
 
336 aa  157  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.246102 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2265  Peptidase M23  44.31 
 
 
299 aa  152  5e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.617569  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  40.78 
 
 
336 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0622  peptidase M23B  40.1 
 
 
280 aa  141  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1296  M24/M37 family peptidase  40.33 
 
 
276 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.492814  decreased coverage  0.0068339 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0940  Peptidase M23  37.78 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252904  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1721  peptidase M23B  34.42 
 
 
317 aa  139  7e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216708  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1051  peptidase M23B  40.11 
 
 
282 aa  138  7.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2436  peptidase M23B  38.33 
 
 
278 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  35.04 
 
 
285 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0304  hypothetical protein  35.04 
 
 
272 aa  135  8e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  35.21 
 
 
306 aa  134  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00362  peptidase  37.5 
 
 
279 aa  133  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0922306  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2737  Peptidase M23  38.22 
 
 
281 aa  132  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.225501  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  35.33 
 
 
268 aa  130  3e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  30.8 
 
 
328 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  30.08 
 
 
321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  31.52 
 
 
293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1224  peptidase M23B  35.94 
 
 
232 aa  126  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0694814 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  40.76 
 
 
285 aa  125  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  30.04 
 
 
318 aa  125  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1170  peptidase M23B  35.32 
 
 
294 aa  125  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00174403 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  36.15 
 
 
312 aa  125  9e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  33.04 
 
 
286 aa  124  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1812  peptidase M23B  36.11 
 
 
282 aa  124  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0863419  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  36.21 
 
 
273 aa  124  2e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3146  peptidase M23B  41.1 
 
 
299 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  29.22 
 
 
319 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  35.63 
 
 
266 aa  122  5e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  36.21 
 
 
244 aa  122  7e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2783  peptidase M23B  33 
 
 
286 aa  120  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392125  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2615  M24/M37 family peptidase  34.46 
 
 
288 aa  119  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144035  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1925  peptidase  31.62 
 
 
283 aa  118  7.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1767  peptidase M23B  34.66 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287118  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1474  peptidase M23B  35 
 
 
287 aa  116  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00227423  normal  0.920527 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2378  peptidase M23B  30.55 
 
 
282 aa  117  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.235139  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2285  peptidase M23B  35.56 
 
 
313 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00385492  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  36.81 
 
 
285 aa  115  5e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2290  peptidase M23B  35.56 
 
 
306 aa  115  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0178936  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2524  peptidase M23B  34.44 
 
 
287 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  32.58 
 
 
269 aa  115  7.999999999999999e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  31.11 
 
 
285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01913  metalloendopeptidase-like membrane protein  32 
 
 
305 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0631175  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2214  peptidase M23B  35.56 
 
 
301 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.558528 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3376  peptidase M23B  32.22 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2423  peptidase M23B  35 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2646  peptidase M23B  33.89 
 
 
287 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2531  peptidase M23B  34.44 
 
 
312 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  35.96 
 
 
255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1820  Peptidase M23  33.89 
 
 
312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0518424  normal  0.297584 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3107  peptidase M23B  32.29 
 
 
303 aa  112  9e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2180  M24/M37 family peptidase  34.44 
 
 
311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0169  peptidase M23B  31.87 
 
 
284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1575  peptidase M23B  34.09 
 
 
302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.745708  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0630  peptidase M23B  34.46 
 
 
312 aa  110  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0558086 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1641  Peptidase M23  29.63 
 
 
286 aa  109  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0361826  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  37.66 
 
 
375 aa  106  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  44.7 
 
 
450 aa  106  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1560  M24/M37 family peptidase  28.57 
 
 
282 aa  105  7e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.275823  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  35.33 
 
 
303 aa  105  8e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  40.58 
 
 
316 aa  103  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  37.74 
 
 
321 aa  103  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  41.01 
 
 
377 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  40.94 
 
 
411 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  40 
 
 
305 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  39.31 
 
 
305 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  39.31 
 
 
305 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  32.99 
 
 
301 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  41.13 
 
 
301 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  39.04 
 
 
300 aa  99.8  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  38.62 
 
 
305 aa  99.4  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  40 
 
 
445 aa  99.4  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  36.9 
 
 
300 aa  99  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  36.84 
 
 
395 aa  99  8e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  33.94 
 
 
309 aa  98.2  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>