More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2524 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_2524  peptidase M23B  100 
 
 		 287 aa  587  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2531  peptidase M23B  97.91 
 
 		 312 aa  579  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1820  Peptidase M23  97.56 
 
 		 312 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0518424  normal  0.297584 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2646  peptidase M23B  96.86 
 
 		 287 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2285  peptidase M23B  87.64 
 
 		 313 aa  508  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00385492  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2423  peptidase M23B  88.24 
 
 		 306 aa  501  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2290  peptidase M23B  90.15 
 
 		 306 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0178936  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2214  peptidase M23B  90.42 
 
 		 301 aa  495  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.558528 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2180  M24/M37 family peptidase  88.43 
 
 		 311 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2783  peptidase M23B  70.97 
 
 		 286 aa  422  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1560  M24/M37 family peptidase  69.04 
 
 		 282 aa  421  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.275823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2378  peptidase M23B  73.16 
 
 		 282 aa  417  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.235139  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1474  peptidase M23B  73.96 
 
 		 287 aa  419  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00227423  normal  0.920527 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1812  peptidase M23B  74.81 
 
 		 282 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0863419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1767  peptidase M23B  74.16 
 
 		 280 aa  411  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287118  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1575  peptidase M23B  70.77 
 
 		 302 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.745708  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3376  peptidase M23B  54.65 
 
 		 269 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2615  M24/M37 family peptidase  52.23 
 
 		 288 aa  273  3e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144035  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2436  peptidase M23B  47.92 
 
 		 278 aa  261  8e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1296  M24/M37 family peptidase  47.37 
 
 		 276 aa  261  1e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.492814  decreased coverage  0.0068339 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01913  metalloendopeptidase-like membrane protein  48.57 
 
 		 305 aa  251  1e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0631175  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0622  peptidase M23B  45.17 
 
 		 280 aa  237  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00362  peptidase  43.88 
 
 		 279 aa  223  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0922306  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2737  Peptidase M23  43.15 
 
 		 281 aa  215  5.9999999999999996e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.225501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  42.92 
 
 		 285 aa  214  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0304  hypothetical protein  42.92 
 
 		 272 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3146  peptidase M23B  42.46 
 
 		 299 aa  192  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3107  peptidase M23B  40.32 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0169  peptidase M23B  35.69 
 
 		 284 aa  166  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0630  peptidase M23B  39.44 
 
 		 312 aa  163  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0558086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1224  peptidase M23B  40.44 
 
 		 232 aa  162  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0694814 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  36.45 
 
 		 300 aa  136  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  36.45 
 
 		 300 aa  136  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1051  peptidase M23B  33.48 
 
 		 282 aa  130  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2044  Peptidase M23  34.9 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  37.22 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  37.93 
 
 		 274 aa  125  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4198  peptidase M23B  35.91 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663221  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1026  M24/M37 family peptidase  34.81 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1024  peptidase M23B  34.81 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1066  peptidase M23B  34.81 
 
 		 275 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0830638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2485  peptidase M23B  37.3 
 
 		 316 aa  119  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927906 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  35.2 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  35.47 
 
 		 328 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  37.16 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  30.77 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2496  peptidase M23B  35.39 
 
 		 296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0441433  normal  0.0477862 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1445  peptidase, M23/M37 family  34.64 
 
 		 274 aa  116  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.813249  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1364  Peptidase M23  35.39 
 
 		 263 aa  116  5e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000583534  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  34.64 
 
 		 282 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3617  Peptidase M23  35.56 
 
 		 322 aa  115  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4593  peptidase M23B  34.44 
 
 		 273 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1258  peptidase M23B  34.08 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3491  peptidase M23B  34.64 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.172269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  40.4 
 
 		 285 aa  114  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  35.16 
 
 		 313 aa  112  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0940  Peptidase M23  31.46 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252904  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  30.85 
 
 		 273 aa  109  5e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  30.35 
 
 		 244 aa  109  6e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  30.85 
 
 		 266 aa  108  8.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  30.61 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  32 
 
 		 336 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1342  peptidase M23B  36.36 
 
 		 296 aa  106  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.339231 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4779  peptidase M23B  31.98 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2288  peptidase M23B  43.09 
 
 		 141 aa  106  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  hitchhiker  0.000223736 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  35.2 
 
 		 285 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  29.38 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  35.75 
 
 		 312 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  35 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  34.15 
 
 		 318 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  34.15 
 
 		 321 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  34.15 
 
 		 319 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  30.1 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0123  Peptidase M23  32.22 
 
 		 336 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.246102 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  34.07 
 
 		 306 aa  97.4  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  38.4 
 
 		 395 aa  97.4  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  34.68 
 
 		 309 aa  97.1  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  31.63 
 
 		 277 aa  96.7  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1656  peptidase M23B  40.91 
 
 		 433 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000516182  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00995  hypothetical protein  31.38 
 
 		 333 aa  95.1  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2702  Peptidase M23  40.91 
 
 		 433 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000811311  hitchhiker  0.0000822209 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1678  peptidase M23B  40.91 
 
 		 433 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411923  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1641  peptidase M23B  40.91 
 
 		 433 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000435092  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  32.46 
 
 		 286 aa  94  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2455  peptidase M23B  39.42 
 
 		 418 aa  94.4  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186992  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2448  peptidase M23B  40.6 
 
 		 431 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.093884  hitchhiker  0.000000000665253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2518  peptidase M23B  40.6 
 
 		 431 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0290484  unclonable  0.0000200771 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2610  peptidase M23B  40.6 
 
 		 431 aa  94  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.326466  hitchhiker  0.000000038042 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2842  M24/M37 family peptidase  40.6 
 
 		 434 aa  93.2  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1533  peptidase M23B  39.85 
 
 		 431 aa  92.8  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00239746  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1590  peptidase M23B  39.1 
 
 		 424 aa  90.5  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0596835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004404  membrane protein  33.33 
 
 		 333 aa  90.5  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  33.33 
 
 		 308 aa  89.7  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  33.1 
 
 		 305 aa  89.4  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  37.41 
 
 		 320 aa  89.4  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  38.64 
 
 		 375 aa  87.4  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2504  peptidase M23B  38.64 
 
 		 423 aa  87.4  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331029  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  32.39 
 
 		 305 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  32.39 
 
 		 305 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1170  peptidase M23B  33.88 
 
 		 294 aa  87.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174403 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>