More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1925 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1925  peptidase  100 
 
 
283 aa  564  1e-160  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1170  peptidase M23B  56.18 
 
 
294 aa  311  6.999999999999999e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00174403 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  55.47 
 
 
306 aa  307  1.0000000000000001e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  54.87 
 
 
312 aa  302  3.0000000000000004e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  42.35 
 
 
285 aa  202  7e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  39.93 
 
 
293 aa  192  5e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  38.13 
 
 
285 aa  192  8e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  39.93 
 
 
286 aa  185  8e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1721  peptidase M23B  42.54 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216708  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  37.66 
 
 
313 aa  132  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0123  Peptidase M23  36.3 
 
 
336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.246102 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1024  peptidase M23B  34.31 
 
 
275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0940  Peptidase M23  37.75 
 
 
291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252904  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1066  peptidase M23B  34.31 
 
 
275 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0830638  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4198  peptidase M23B  35.15 
 
 
275 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663221  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1026  M24/M37 family peptidase  34.31 
 
 
275 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  42.41 
 
 
336 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  32.27 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2495  Peptidase M23  36.03 
 
 
331 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2265  Peptidase M23  39.46 
 
 
299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.617569  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  37.44 
 
 
282 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1364  Peptidase M23  35.97 
 
 
263 aa  119  7e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000583534  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2485  peptidase M23B  33.86 
 
 
316 aa  118  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.927906 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4593  peptidase M23B  31.62 
 
 
273 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  36.95 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2496  peptidase M23B  35.81 
 
 
296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0441433  normal  0.0477862 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1342  peptidase M23B  34.21 
 
 
296 aa  115  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.339231 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2470  Peptidase M23  35.6 
 
 
332 aa  115  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  36.4 
 
 
290 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1445  peptidase, M23/M37 family  35.07 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.813249  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1258  peptidase M23B  31.35 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  33.33 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  36.04 
 
 
285 aa  112  7.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0304  hypothetical protein  36.04 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  32.59 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3491  peptidase M23B  30.9 
 
 
280 aa  110  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.172269  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0622  peptidase M23B  50.41 
 
 
280 aa  110  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2044  Peptidase M23  34.43 
 
 
272 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4779  peptidase M23B  33.9 
 
 
289 aa  107  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00362  peptidase  37.76 
 
 
279 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0922306  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3146  peptidase M23B  38.67 
 
 
299 aa  105  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  42.96 
 
 
375 aa  105  9e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3617  Peptidase M23  32.74 
 
 
322 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  42.19 
 
 
299 aa  104  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  39.24 
 
 
456 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1051  peptidase M23B  38.62 
 
 
282 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  42.75 
 
 
314 aa  102  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  40.88 
 
 
453 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  37.59 
 
 
395 aa  101  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  38.22 
 
 
459 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  30.66 
 
 
266 aa  101  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0912  Peptidase M23  51.46 
 
 
276 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.677753 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  37.11 
 
 
454 aa  99  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  40.58 
 
 
457 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  40.88 
 
 
455 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  35.67 
 
 
450 aa  98.2  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  38.24 
 
 
308 aa  97.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  28.73 
 
 
363 aa  96.7  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  30 
 
 
273 aa  97.1  3e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  33.07 
 
 
321 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  33.07 
 
 
319 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  35.56 
 
 
305 aa  96.3  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1767  peptidase M23B  35.71 
 
 
280 aa  96.3  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287118  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  36.71 
 
 
455 aa  96.3  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0169  peptidase M23B  38.81 
 
 
284 aa  96.3  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  28.57 
 
 
244 aa  95.9  6e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1516  peptidase M23B  37.32 
 
 
367 aa  95.9  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1296  M24/M37 family peptidase  47.15 
 
 
276 aa  95.5  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.492814  decreased coverage  0.0068339 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2141  peptidase M23B  43.65 
 
 
649 aa  95.5  9e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.506727 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  42.74 
 
 
238 aa  95.5  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  39.1 
 
 
404 aa  94.7  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  36.62 
 
 
247 aa  95.1  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1891  peptidase M23B  38.71 
 
 
314 aa  94.7  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2737  Peptidase M23  44.96 
 
 
281 aa  94.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.225501  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2436  peptidase M23B  36.92 
 
 
278 aa  94.7  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  32.68 
 
 
318 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  39.53 
 
 
524 aa  94  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3107  peptidase M23B  39.23 
 
 
303 aa  94.4  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1776  Peptidase M23  38.66 
 
 
434 aa  94.4  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2288  peptidase M23B  40.77 
 
 
141 aa  94.7  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  hitchhiker  0.000223736 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  37.82 
 
 
301 aa  94  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  43.36 
 
 
414 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0367  tagE protein  38.76 
 
 
302 aa  93.2  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  40 
 
 
325 aa  92.8  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2615  M24/M37 family peptidase  33.7 
 
 
288 aa  92.4  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144035  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  46.3 
 
 
269 aa  92.4  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  37.69 
 
 
317 aa  92.4  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  35.25 
 
 
285 aa  92  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  33.13 
 
 
255 aa  91.3  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  42.28 
 
 
303 aa  91.7  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  38.35 
 
 
411 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  41.41 
 
 
490 aa  92  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  38.35 
 
 
370 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  39.86 
 
 
321 aa  90.9  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  38.58 
 
 
230 aa  90.9  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000639661  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  37.78 
 
 
274 aa  90.9  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  36.96 
 
 
268 aa  90.9  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  37.8 
 
 
301 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  40.46 
 
 
316 aa  90.9  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  38.84 
 
 
471 aa  90.5  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>