More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0676 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  100 
 
 		 482 aa  964    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2141  peptidase M23B  41.73 
 
 		 649 aa  112  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.506727 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  43.8 
 
 		 399 aa  109  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  43.8 
 
 		 399 aa  109  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  50.49 
 
 		 379 aa  108  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  44.35 
 
 		 324 aa  107  7e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  44.55 
 
 		 286 aa  105  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  45.3 
 
 		 404 aa  104  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  44 
 
 		 517 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  40.31 
 
 		 569 aa  102  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  41.38 
 
 		 325 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  42.06 
 
 		 503 aa  102  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  41.27 
 
 		 480 aa  100  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  41.27 
 
 		 475 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  39.5 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  42.86 
 
 		 474 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1721  peptidase M23B  41.73 
 
 		 317 aa  100  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216708  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  38.66 
 
 		 325 aa  100  5e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  42.06 
 
 		 475 aa  100  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  42.06 
 
 		 470 aa  100  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  42.52 
 
 		 288 aa  100  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  43.09 
 
 		 411 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  40.17 
 
 		 320 aa  100  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  47.96 
 
 		 321 aa  100  8e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  40 
 
 		 312 aa  99.4  1e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  38.85 
 
 		 268 aa  99.8  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  40.34 
 
 		 524 aa  99.4  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  45.1 
 
 		 293 aa  99.4  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  46 
 
 		 290 aa  99.4  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  38.93 
 
 		 318 aa  99.4  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  46.43 
 
 		 314 aa  99  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  41.27 
 
 		 468 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  39.53 
 
 		 533 aa  98.2  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  46.96 
 
 		 372 aa  98.2  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  39.68 
 
 		 473 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  39.68 
 
 		 475 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  39.68 
 
 		 472 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  39.68 
 
 		 473 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  40.58 
 
 		 421 aa  97.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  40.58 
 
 		 400 aa  97.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  40.58 
 
 		 421 aa  97.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  46.73 
 
 		 231 aa  97.4  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  38.1 
 
 		 244 aa  97.1  6e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  36.84 
 
 		 273 aa  97.1  6e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  39.69 
 
 		 313 aa  97.1  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  41.3 
 
 		 457 aa  97.4  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  40.94 
 
 		 414 aa  97.1  7e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  38.93 
 
 		 447 aa  97.1  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  38.93 
 
 		 447 aa  97.1  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  45.24 
 
 		 377 aa  97.1  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  43.65 
 
 		 446 aa  97.1  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  38.71 
 
 		 490 aa  97.1  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  40.48 
 
 		 447 aa  97.1  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  39.39 
 
 		 665 aa  96.7  8e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  40.58 
 
 		 420 aa  96.7  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  45.45 
 
 		 306 aa  96.7  9e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  41.73 
 
 		 412 aa  96.7  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  38.17 
 
 		 262 aa  96.3  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  38.17 
 
 		 402 aa  96.3  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  41.73 
 
 		 425 aa  96.3  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  42.98 
 
 		 423 aa  96.3  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  40.17 
 
 		 375 aa  95.9  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  41.73 
 
 		 425 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  41.32 
 
 		 299 aa  95.1  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  36.69 
 
 		 285 aa  95.1  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  37.5 
 
 		 471 aa  95.1  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1119  peptidase M23B  43.75 
 
 		 669 aa  95.5  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  45.45 
 
 		 266 aa  95.5  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  42.15 
 
 		 299 aa  95.1  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1777  M24/M37 family peptidase  41.6 
 
 		 347 aa  95.9  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193193  normal  0.0207649 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  38.17 
 
 		 313 aa  95.1  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  38.1 
 
 		 277 aa  95.5  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  39.06 
 
 		 305 aa  95.1  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  38.89 
 
 		 384 aa  95.1  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  37.98 
 
 		 295 aa  94.7  3e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  40.5 
 
 		 317 aa  94.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  41.46 
 
 		 615 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  38.71 
 
 		 472 aa  95.1  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  39.2 
 
 		 375 aa  94.7  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  41.6 
 
 		 695 aa  94.7  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  40.48 
 
 		 454 aa  94  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4531  Peptidase M23  39.71 
 
 		 137 aa  94  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.45926 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  39.69 
 
 		 319 aa  94  5e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  41.22 
 
 		 415 aa  94  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  43.14 
 
 		 402 aa  94  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  42.15 
 
 		 465 aa  94  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  35.82 
 
 		 388 aa  93.6  6e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  35.46 
 
 		 300 aa  94  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3257  peptidase M23  38.06 
 
 		 450 aa  94  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000116683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  34.76 
 
 		 345 aa  94  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  38.71 
 
 		 412 aa  93.6  7e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  44.8 
 
 		 270 aa  93.6  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  36.72 
 
 		 471 aa  93.6  7e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  40.91 
 
 		 375 aa  93.6  7e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  40.52 
 
 		 377 aa  93.2  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  38.52 
 
 		 310 aa  93.2  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  38.4 
 
 		 455 aa  93.2  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  38.71 
 
 		 373 aa  93.2  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  39.68 
 
 		 455 aa  93.2  9e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  36.57 
 
 		 304 aa  93.2  9e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>