More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2189 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2189  M23/M37 peptidase domain-containing protein  100 
 
 
316 aa  645    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0261  M23 peptidase domain protein  34.63 
 
 
314 aa  125  1e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0566048  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  28.24 
 
 
321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  30.25 
 
 
318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  27.84 
 
 
319 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2470  Peptidase M23  33.51 
 
 
332 aa  109  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2495  Peptidase M23  36.41 
 
 
331 aa  106  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  42.14 
 
 
285 aa  106  5e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  45.38 
 
 
503 aa  106  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  44.62 
 
 
474 aa  105  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  43.85 
 
 
475 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  44.62 
 
 
480 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  43.85 
 
 
475 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2044  Peptidase M23  29.78 
 
 
272 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  40.28 
 
 
285 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  43.85 
 
 
473 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  43.85 
 
 
473 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  42.34 
 
 
475 aa  103  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1077  Peptidase M23  44.19 
 
 
507 aa  102  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.391765  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1516  peptidase M23B  40.54 
 
 
367 aa  102  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  43.85 
 
 
472 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  29.46 
 
 
285 aa  102  8e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  39.74 
 
 
268 aa  102  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  40.31 
 
 
328 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  29.03 
 
 
313 aa  99.8  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01827  predicted peptidase  41.86 
 
 
419 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000774309  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  41.86 
 
 
440 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000497391  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  41.86 
 
 
440 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  41.86 
 
 
440 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01815  hypothetical protein  41.86 
 
 
440 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  41.86 
 
 
440 aa  99.8  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000381632  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  41.86 
 
 
440 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  41.86 
 
 
440 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  41.86 
 
 
440 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000737786  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  36.25 
 
 
395 aa  99.4  7e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  26.75 
 
 
282 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  38.06 
 
 
460 aa  97.8  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  40.77 
 
 
468 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  47.87 
 
 
309 aa  97.8  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  40.77 
 
 
447 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  46.81 
 
 
305 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  47.87 
 
 
305 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1828  hypothetical protein  42.74 
 
 
440 aa  96.7  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000168261  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  46.81 
 
 
305 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  36.26 
 
 
273 aa  96.7  5e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  46.81 
 
 
305 aa  96.3  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  35.93 
 
 
374 aa  96.3  6e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1269  M24/M37 family peptidase  36.61 
 
 
419 aa  96.3  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.711589  hitchhiker  0.00022496 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  38.79 
 
 
372 aa  96.3  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1358  hypothetical protein  40.31 
 
 
439 aa  95.9  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00370523 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1234  hypothetical protein  40.31 
 
 
439 aa  95.9  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00307381  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1296  M24/M37 family peptidase  33 
 
 
276 aa  95.9  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.492814  decreased coverage  0.0068339 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2104  hypothetical protein  40.31 
 
 
439 aa  95.9  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.391602  normal  0.665324 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2044  hypothetical protein  40.31 
 
 
439 aa  95.9  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.713076  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  33.33 
 
 
306 aa  95.5  9e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  38.46 
 
 
517 aa  95.5  9e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2112  hypothetical protein  41.03 
 
 
441 aa  95.9  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000011239  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2049  hypothetical protein  40.31 
 
 
439 aa  95.9  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245619  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  39.44 
 
 
459 aa  95.5  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  39.33 
 
 
312 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  37.21 
 
 
244 aa  95.5  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01913  metalloendopeptidase-like membrane protein  40.82 
 
 
305 aa  95.1  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0631175  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  43.44 
 
 
430 aa  95.5  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  39.1 
 
 
243 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2504  peptidase M23B  43.09 
 
 
423 aa  94.7  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331029  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1767  peptidase M23B  31.45 
 
 
280 aa  94.4  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287118  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  46.88 
 
 
282 aa  94.7  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  28.07 
 
 
274 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  26.75 
 
 
282 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2425  hypothetical protein  38.76 
 
 
439 aa  94.4  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000232327  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1627  M24/M37 family peptidase  39.26 
 
 
386 aa  94  3e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  36.36 
 
 
446 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  41 
 
 
271 aa  93.6  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  39.29 
 
 
460 aa  93.6  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  37.4 
 
 
353 aa  93.6  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2448  peptidase M23B  44.92 
 
 
431 aa  93.6  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.093884  hitchhiker  0.000000000665253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2518  peptidase M23B  44.92 
 
 
431 aa  93.6  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0290484  unclonable  0.0000200771 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  32.16 
 
 
286 aa  93.6  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1533  peptidase M23B  45.76 
 
 
431 aa  93.2  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00239746  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2610  peptidase M23B  44.92 
 
 
431 aa  93.2  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.326466  hitchhiker  0.000000038042 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  34.55 
 
 
447 aa  92.8  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  34.55 
 
 
447 aa  92.8  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1224  peptidase M23B  34.53 
 
 
232 aa  92.8  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0694814 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1656  peptidase M23B  44.92 
 
 
433 aa  92.8  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000516182  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1678  peptidase M23B  44.92 
 
 
433 aa  92.8  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411923  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1641  peptidase M23B  44.92 
 
 
433 aa  92.8  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000435092  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2702  Peptidase M23  44.92 
 
 
433 aa  92.8  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000811311  hitchhiker  0.0000822209 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2842  M24/M37 family peptidase  44.07 
 
 
434 aa  92.4  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  37.98 
 
 
429 aa  92.4  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  42 
 
 
379 aa  92  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  38.35 
 
 
498 aa  92  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0732  M24/M37 family peptidase  39.57 
 
 
353 aa  91.7  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.056304  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1258  peptidase M23B  38.78 
 
 
274 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  40.2 
 
 
216 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4593  peptidase M23B  27.23 
 
 
273 aa  92  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  35.48 
 
 
293 aa  91.7  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  40.17 
 
 
440 aa  92  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  38.28 
 
 
433 aa  91.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  37.21 
 
 
266 aa  92  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  41 
 
 
340 aa  91.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>