More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6234 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6234  Peptidase M23  100 
 
 		 446 aa  896    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4508  Peptidase M23  35 
 
 		 392 aa  227  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.487012 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01485  peptidase  33.6 
 
 		 377 aa  226  9e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0146  Peptidase M23  45.64 
 
 		 230 aa  117  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3409  Peptidase M23  48.59 
 
 		 183 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2227  peptidase M23B  46.62 
 
 		 172 aa  109  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01987  peptidase  45.39 
 
 		 204 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3584  peptidase M23B  43.22 
 
 		 174 aa  95.9  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2214  peptidase M23B  40.5 
 
 		 198 aa  94.4  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.250038 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1921  metallopeptidase peptidase  42.61 
 
 		 196 aa  93.2  9e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318807 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0489  peptidase M23B  42.98 
 
 		 194 aa  91.3  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2717  Peptidase M23  40.15 
 
 		 272 aa  89.7  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000153286  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3804  peptidase M23B  35.66 
 
 		 199 aa  88.2  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.019155 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  39.16 
 
 		 325 aa  88.2  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4797  peptidase M23B  38.2 
 
 		 327 aa  87.8  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0231137  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3569  peptidase M23B  36.27 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4699  M24/M37 family peptidase  42.22 
 
 		 327 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0776348  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0123  peptidase, M23/M37 family  42.22 
 
 		 327 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0859179  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5110  M24/M37 family peptidase  36.52 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02339  M23 peptidase domain protein  38.98 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.213861  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4841  M24/M37 family peptidase  41.48 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.024057  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4683  M24/M37 family peptidase  36.52 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5206  M23/37 family peptidase  41.48 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5077  peptidase, M23/M37 family  41.48 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5115  peptidase, M23/M37 family  41.48 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000714252  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5117  peptidase, M23/M37 family  41.48 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00753294  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1360  Peptidase M23  41.46 
 
 		 348 aa  82  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.119813  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  36.6 
 
 		 447 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  36.6 
 
 		 447 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  38.21 
 
 		 238 aa  81.6  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  39.61 
 
 		 445 aa  81.3  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  37.01 
 
 		 446 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  41.38 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  42.62 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0616  peptidase M23B  36.43 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137898  hitchhiker  0.00000225062 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1486  cell wall endopeptidase, family M23/M37  39.64 
 
 		 421 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  48.89 
 
 		 465 aa  79  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3858  cell wall endopeptidase, family M23/M37  39.64 
 
 		 424 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000135417  hitchhiker  0.00000000000537806 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3011  Peptidase M23  37.29 
 
 		 223 aa  78.6  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0127254 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  34.13 
 
 		 442 aa  78.2  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  37.19 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0197  peptidase M23B  39.81 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00125912  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0203  peptidase M23B  39.81 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  36.67 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  39.52 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1389  M24/M37 family peptidase  32.6 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000798303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1500  M23/37 family peptidase  32.6 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000118576  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  37.5 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  35.83 
 
 		 386 aa  76.6  0.0000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  37.88 
 
 		 363 aa  76.3  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  35 
 
 		 286 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  37.29 
 
 		 386 aa  76.3  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  37.5 
 
 		 269 aa  76.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0435  Peptidase M23  38.79 
 
 		 178 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  36.99 
 
 		 491 aa  75.9  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1534  peptidase, M23/M37 family  32.6 
 
 		 204 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3811  peptidase, M23/M37 family  31.03 
 
 		 204 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000746797  unclonable  9.38185e-26 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  37.31 
 
 		 320 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2568  putative membrane associated peptidase  42.99 
 
 		 436 aa  75.9  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102631  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  42.15 
 
 		 372 aa  75.9  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  31.43 
 
 		 268 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  40.91 
 
 		 388 aa  75.9  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3592  peptidase M23B  42.42 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  35.93 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  33.52 
 
 		 429 aa  74.7  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1354  peptidase M23B  38.74 
 
 		 424 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000810467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1339  M24/M37 family peptidase  38.74 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000501622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1314  cell wall endopeptidase  38.74 
 
 		 423 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000373067  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1313  cell wall endopeptidase  38.74 
 
 		 423 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000309784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1523  peptidase, M23/M37 family  38.74 
 
 		 423 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.25649e-59 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1449  M23/37 family peptidase  38.74 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000128519  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 590 aa  74.3  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2504  Peptidase M23  39.26 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.241623  normal  0.0435896 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0192  Peptidase M23  35.37 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1554  M24/M37 family peptidase  38.74 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000152765  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1604  M24/M37 family peptidase  35 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000000454274  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1362  cell wall endopeptidase  35 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.83171e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1361  cell wall endopeptidase  35 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000286273  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4428  Peptidase M23  33.33 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1640  peptidase, M23/M37 family  35 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000676143  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1592  peptidase, M23/M37 family  38.74 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000620859  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  31.67 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4752  Peptidase M23  36.79 
 
 		 458 aa  73.9  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.817263  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  37.69 
 
 		 482 aa  73.9  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  33.73 
 
 		 353 aa  73.6  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  35 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  48.86 
 
 		 457 aa  73.6  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  37.01 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  33.58 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3518  Peptidase M23  38.1 
 
 		 406 aa  73.2  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  37.5 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  34.15 
 
 		 433 aa  73.2  0.000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2621  M24/M37 family peptidase  39.32 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1152  peptidase M23B  38.74 
 
 		 414 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000291008  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  35.71 
 
 		 446 aa  72.4  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  50.56 
 
 		 460 aa  73.2  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  30.74 
 
 		 290 aa  72.4  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2938  M24/M37 family peptidase  37.98 
 
 		 350 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  40.2 
 
 		 360 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  28.9 
 
 		 425 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>