More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2717 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2717  Peptidase M23  100 
 
 
272 aa  558  1e-158  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000153286  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0123  peptidase, M23/M37 family  33.59 
 
 
327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0859179  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3569  peptidase M23B  31.82 
 
 
328 aa  113  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5117  peptidase, M23/M37 family  33.21 
 
 
327 aa  112  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00753294  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2907  Peptidase M23  43.45 
 
 
330 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4797  peptidase M23B  31.82 
 
 
327 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0231137  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4699  M24/M37 family peptidase  43.92 
 
 
327 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0776348  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4683  M24/M37 family peptidase  43.24 
 
 
333 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1360  Peptidase M23  44.59 
 
 
348 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.119813  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5110  M24/M37 family peptidase  43.24 
 
 
327 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4841  M24/M37 family peptidase  43.24 
 
 
333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.024057  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5206  M23/37 family peptidase  43.24 
 
 
327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5115  peptidase, M23/M37 family  43.24 
 
 
327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000714252  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5077  peptidase, M23/M37 family  43.24 
 
 
327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2227  peptidase M23B  44.22 
 
 
172 aa  109  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3052  Peptidase M23  43.57 
 
 
329 aa  105  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4508  Peptidase M23  41.38 
 
 
392 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.487012 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0146  Peptidase M23  52.1 
 
 
230 aa  103  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01485  peptidase  34.21 
 
 
377 aa  102  9e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3804  peptidase M23B  41.89 
 
 
199 aa  95.5  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.019155 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2214  peptidase M23B  42.45 
 
 
198 aa  94  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.250038 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0884  Peptidase M23  40 
 
 
345 aa  92.4  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00022367  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1921  metallopeptidase peptidase  45.69 
 
 
196 aa  91.7  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6234  Peptidase M23  40.15 
 
 
446 aa  90.1  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2289  peptidase M23B  40.4 
 
 
457 aa  89.7  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000911471  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0489  peptidase M23B  44.44 
 
 
194 aa  87.4  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171109  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3409  Peptidase M23  44.83 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0435  Peptidase M23  35.42 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4760  peptidase M23B  26.06 
 
 
295 aa  79.3  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  36.64 
 
 
442 aa  79  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3584  peptidase M23B  37.9 
 
 
174 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  36.64 
 
 
446 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  42.45 
 
 
751 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  36.64 
 
 
447 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  36.64 
 
 
447 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3990  peptidase M23B  34.62 
 
 
181 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3011  Peptidase M23  36.29 
 
 
223 aa  73.2  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0127254 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02339  M23 peptidase domain protein  38.4 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.213861  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01987  peptidase  40.52 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  33.54 
 
 
491 aa  72.8  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  36.15 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  38.68 
 
 
754 aa  70.5  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0813  peptidase M23B  36.94 
 
 
548 aa  70.1  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31424  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  39.42 
 
 
695 aa  69.3  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  36.72 
 
 
453 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  34.85 
 
 
443 aa  68.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  35.66 
 
 
475 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  39.42 
 
 
651 aa  67.8  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4756  peptidase M23B  38.68 
 
 
333 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0919319  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0227  peptidase M23B  34.19 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0890169  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  35.04 
 
 
404 aa  68.2  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1006  Peptidase M23  39.05 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  36.89 
 
 
431 aa  67  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  42.06 
 
 
727 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  42.06 
 
 
727 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0464  peptidase M23B  41.75 
 
 
484 aa  66.6  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  38.61 
 
 
402 aa  66.6  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  39.58 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2993  peptidase M23B  35.51 
 
 
645 aa  66.6  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  36.89 
 
 
441 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1861  M24/M37 family peptidase  37.93 
 
 
651 aa  66.2  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00185296  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1795  M24/M37 family peptidase  37.93 
 
 
651 aa  66.6  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000763008  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2498  peptidase M23B  36.62 
 
 
646 aa  65.9  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.13296 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  38.46 
 
 
665 aa  66.2  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  32.52 
 
 
304 aa  66.2  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  39.42 
 
 
470 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  36.07 
 
 
695 aa  65.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  30.11 
 
 
273 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  36.64 
 
 
445 aa  65.1  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  34.43 
 
 
676 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  31.77 
 
 
336 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  35.66 
 
 
466 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73200  hypothetical protein  37.82 
 
 
169 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1343  peptidase M23B  31.78 
 
 
271 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3111  peptidase M23B  35.64 
 
 
225 aa  63.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.324565  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  30.16 
 
 
266 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  38.18 
 
 
238 aa  64.3  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  30.92 
 
 
379 aa  64.3  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  34.68 
 
 
324 aa  64.3  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  34.88 
 
 
466 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  34.88 
 
 
491 aa  63.5  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3812  Peptidase M23  40 
 
 
640 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1351  Peptidase M23  40.78 
 
 
467 aa  63.9  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.749113  hitchhiker  0.00315116 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  35.4 
 
 
680 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3437  Peptidase M23  35.46 
 
 
296 aa  63.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.112257  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3815  peptidase M23B  39.25 
 
 
237 aa  63.9  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  36.28 
 
 
681 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  39.29 
 
 
269 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3520  Peptidase M23  39.05 
 
 
640 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259567  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  30.11 
 
 
244 aa  63.5  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  36.89 
 
 
287 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  36.28 
 
 
692 aa  63.2  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  34.65 
 
 
490 aa  63.2  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0256  M23 peptidase domain-containing protein  36.54 
 
 
646 aa  63.2  0.000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0199  peptidase M23B  34.38 
 
 
246 aa  62.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3949  hypothetical protein  39.05 
 
 
648 aa  62.8  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2441  Peptidase M23  32.45 
 
 
735 aa  62.8  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00201295  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1186  Peptidase M23  28.99 
 
 
274 aa  62.8  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.247646  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  35.16 
 
 
454 aa  62.4  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  27.62 
 
 
300 aa  62.4  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>