More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3052 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3052  Peptidase M23  100 
 
 
329 aa  676    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2907  Peptidase M23  80.91 
 
 
330 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5110  M24/M37 family peptidase  59.7 
 
 
327 aa  420  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4841  M24/M37 family peptidase  60 
 
 
333 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.024057  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4683  M24/M37 family peptidase  59.7 
 
 
333 aa  419  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4699  M24/M37 family peptidase  59.7 
 
 
327 aa  419  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0776348  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0123  peptidase, M23/M37 family  59.7 
 
 
327 aa  418  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0859179  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5115  peptidase, M23/M37 family  60 
 
 
327 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000714252  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5117  peptidase, M23/M37 family  60.3 
 
 
327 aa  421  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00753294  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5206  M23/37 family peptidase  60 
 
 
327 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5077  peptidase, M23/M37 family  60 
 
 
327 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4797  peptidase M23B  59.7 
 
 
327 aa  420  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0231137  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3569  peptidase M23B  61.56 
 
 
328 aa  414  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1360  Peptidase M23  45.73 
 
 
348 aa  271  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.119813  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2717  Peptidase M23  42.36 
 
 
272 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000153286  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0884  Peptidase M23  42.74 
 
 
345 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00022367  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2227  peptidase M23B  44.2 
 
 
172 aa  96.3  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0813  peptidase M23B  39.75 
 
 
548 aa  92.8  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31424  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0489  peptidase M23B  44.53 
 
 
194 aa  91.3  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171109  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2214  peptidase M23B  40 
 
 
198 aa  86.3  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.250038 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2445  peptidase M23B  32.96 
 
 
844 aa  86.3  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1921  metallopeptidase peptidase  41.61 
 
 
196 aa  84.3  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318807 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  28.01 
 
 
352 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2289  peptidase M23B  37.1 
 
 
457 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000911471  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0146  Peptidase M23  40.94 
 
 
230 aa  80.1  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01987  peptidase  39.68 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3409  Peptidase M23  38.89 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01485  peptidase  35.86 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3804  peptidase M23B  38.64 
 
 
199 aa  73.6  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.019155 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02339  M23 peptidase domain protein  36.23 
 
 
238 aa  71.2  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.213861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6234  Peptidase M23  38.14 
 
 
446 aa  70.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3011  Peptidase M23  35.34 
 
 
223 aa  68.9  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0127254 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  26.57 
 
 
1048 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3990  peptidase M23B  35.04 
 
 
181 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3584  peptidase M23B  34.68 
 
 
174 aa  63.5  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0435  Peptidase M23  32.84 
 
 
178 aa  63.5  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73200  hypothetical protein  39 
 
 
169 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  29.14 
 
 
442 aa  62.4  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0732  M24/M37 family peptidase  39 
 
 
353 aa  62  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.056304  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  32.84 
 
 
316 aa  62  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  38.3 
 
 
441 aa  61.6  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  35.29 
 
 
441 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1590  Peptidase M23  32.84 
 
 
390 aa  60.8  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2504  Peptidase M23  25.82 
 
 
290 aa  60.5  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.241623  normal  0.0435896 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  33.98 
 
 
465 aa  60.5  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  30.77 
 
 
312 aa  60.1  0.00000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  32.52 
 
 
480 aa  60.1  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4508  Peptidase M23  32.61 
 
 
392 aa  60.1  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.487012 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1555  Peptidase M23  30.22 
 
 
469 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3617  peptidase M23B  31.52 
 
 
457 aa  57.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0923859  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1579  Peptidase M23  30.22 
 
 
469 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2761  peptidase M23  32.64 
 
 
529 aa  58.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.758494  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3955  peptidase M23B  31.52 
 
 
457 aa  57.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.053083  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  33.9 
 
 
460 aa  58.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  40.22 
 
 
305 aa  57.8  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  30.83 
 
 
533 aa  57.4  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0616  peptidase M23B  32.23 
 
 
319 aa  57.8  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137898  hitchhiker  0.00000225062 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  35.14 
 
 
727 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  35.14 
 
 
727 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  34 
 
 
524 aa  56.6  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  34.45 
 
 
421 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  34.29 
 
 
751 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  34.45 
 
 
421 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  31.61 
 
 
651 aa  56.2  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  36.08 
 
 
389 aa  55.8  0.0000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  35.04 
 
 
457 aa  55.8  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  34.34 
 
 
431 aa  55.8  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  37.14 
 
 
490 aa  55.8  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  36.17 
 
 
465 aa  55.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  37.04 
 
 
314 aa  55.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  31.78 
 
 
523 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  34.34 
 
 
441 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3351  peptidase M23B  26.78 
 
 
687 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0955739  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  37.11 
 
 
513 aa  55.8  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  30.08 
 
 
472 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0940  Peptidase M23  28.03 
 
 
291 aa  54.7  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252904  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1145  Peptidase M23  27.8 
 
 
390 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0737  Peptidase M23  27.06 
 
 
580 aa  54.7  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.200765  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  33.61 
 
 
824 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1343  peptidase M23B  26.42 
 
 
271 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  29.27 
 
 
475 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  29.27 
 
 
473 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_004310  BR1861  M24/M37 family peptidase  30.97 
 
 
651 aa  54.3  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00185296  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0565  Peptidase M23  33.33 
 
 
475 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  33.06 
 
 
754 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  36 
 
 
420 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1795  M24/M37 family peptidase  30.97 
 
 
651 aa  54.3  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000763008  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  32.62 
 
 
491 aa  54.3  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  36 
 
 
400 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3111  peptidase M23B  32.91 
 
 
225 aa  54.3  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.324565  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  33.33 
 
 
425 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  35.04 
 
 
455 aa  54.3  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  33 
 
 
388 aa  54.3  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  37 
 
 
386 aa  53.5  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  29.27 
 
 
473 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  34.96 
 
 
402 aa  53.9  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  37.61 
 
 
464 aa  53.9  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  33.33 
 
 
425 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  33.33 
 
 
238 aa  53.5  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  29.27 
 
 
475 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>