207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2445 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2445  peptidase M23B  100 
 
 		 844 aa  1649    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  34.71 
 
 		 346 aa  128  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2504  Peptidase M23  31.98 
 
 		 290 aa  114  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.241623  normal  0.0435896 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1690  Lytic transglycosylase catalytic  51.18 
 
 		 378 aa  107  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.120979  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3208  lytic transglycosylase, catalytic  51.52 
 
 		 387 aa  101  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1103  NLP/P60 protein  40 
 
 		 349 aa  98.2  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.107402  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5110  M24/M37 family peptidase  34.11 
 
 		 327 aa  97.4  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5117  peptidase, M23/M37 family  34.88 
 
 		 327 aa  97.4  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00753294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4797  peptidase M23B  33.72 
 
 		 327 aa  96.7  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0231137  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0123  peptidase, M23/M37 family  34.88 
 
 		 327 aa  96.7  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0859179  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4841  M24/M37 family peptidase  33.72 
 
 		 333 aa  95.9  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.024057  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4683  M24/M37 family peptidase  33.72 
 
 		 333 aa  95.9  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5206  M23/37 family peptidase  33.72 
 
 		 327 aa  95.9  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5077  peptidase, M23/M37 family  33.72 
 
 		 327 aa  95.9  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5115  peptidase, M23/M37 family  33.72 
 
 		 327 aa  95.9  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000714252  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4699  M24/M37 family peptidase  33.72 
 
 		 327 aa  95.5  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0776348  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  45.86 
 
 		 308 aa  95.1  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  28.57 
 
 		 352 aa  94.7  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1666  Lytic transglycosylase catalytic  32.68 
 
 		 906 aa  94.7  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3054  NLP/P60 protein  42.14 
 
 		 381 aa  93.2  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0610428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3569  peptidase M23B  32.56 
 
 		 328 aa  92.8  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6778  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  43.41 
 
 		 429 aa  92.4  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2302  lytic transglycosylase catalytic  49.18 
 
 		 366 aa  92.8  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2907  Peptidase M23  32.21 
 
 		 330 aa  92  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0674  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  35.52 
 
 		 434 aa  92  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.795427  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8469  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  37.58 
 
 		 362 aa  91.7  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1074  hypothetical protein  39.72 
 
 		 423 aa  90.1  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  34.74 
 
 		 390 aa  86.3  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0489  peptidase M23B  46.43 
 
 		 194 aa  86.7  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1103  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  35.96 
 
 		 815 aa  85.9  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.792385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1352  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  35.98 
 
 		 506 aa  85.9  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8718  hypothetical protein  41.98 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3989  hypothetical protein  36.31 
 
 		 443 aa  85.1  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0846215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4063  hypothetical protein  36.31 
 
 		 443 aa  85.1  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4003  hypothetical protein  36.31 
 
 		 443 aa  85.1  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785178  normal  0.555092 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0498  secreted protein  33.98 
 
 		 389 aa  85.1  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2206  lytic transglycosylase, catalytic  38.37 
 
 		 439 aa  84.7  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1360  Peptidase M23  40.62 
 
 		 348 aa  84.7  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.119813  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1921  metallopeptidase peptidase  43.05 
 
 		 196 aa  83.2  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318807 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1448  Lytic transglycosylase catalytic  42.68 
 
 		 362 aa  83.2  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0207836  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05000  hypothetical protein  36.69 
 
 		 216 aa  82.8  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4490  lytic transglycosylase, catalytic  36.9 
 
 		 447 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.497479  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2214  peptidase M23B  44.37 
 
 		 198 aa  82  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.250038 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2227  peptidase M23B  46.15 
 
 		 172 aa  81.6  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32220  hypothetical protein  36.11 
 
 		 453 aa  80.9  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1157  lytic transglycosylase, catalytic  41.43 
 
 		 400 aa  80.5  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.798233  normal  0.63367 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3052  Peptidase M23  41.03 
 
 		 329 aa  78.6  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24670  hypothetical protein  36.14 
 
 		 282 aa  79  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1645  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  32.98 
 
 		 662 aa  77.4  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0719412 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0569  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  33.72 
 
 		 417 aa  77  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2794  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  39.29 
 
 		 466 aa  77.4  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480258  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1681  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  37.07 
 
 		 354 aa  74.7  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.86934  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13211  transglycosylase SLT domain-containing protein  41.03 
 
 		 355 aa  73.9  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.26412 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1862  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  34.86 
 
 		 377 aa  73.9  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318749  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11255  hypothetical protein  33.33 
 
 		 411 aa  73.9  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344588 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1797  hypothetical protein  39.67 
 
 		 334 aa  73.2  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.52212  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  36.24 
 
 		 541 aa  72.4  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4241  putative lipoprotein LpqU  34.71 
 
 		 252 aa  72.4  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4327  putative lipoprotein LpqU  34.71 
 
 		 252 aa  72.4  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.295293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4620  putative lipoprotein LpqU  34.71 
 
 		 252 aa  72.4  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.539591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3191  hypothetical protein  31.61 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0362  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  34.27 
 
 		 425 aa  72  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0858  hypothetical protein  40 
 
 		 331 aa  70.9  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6234  Peptidase M23  34.94 
 
 		 446 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  30.43 
 
 		 392 aa  68.6  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0432  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  33.57 
 
 		 421 aa  68.9  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288909  hitchhiker  0.00015802 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1569  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  33.71 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1583  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  33.92 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0146  Peptidase M23  40.62 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1757  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  35.76 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000259317 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2594  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  34.01 
 
 		 298 aa  67.4  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0669  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  34.73 
 
 		 314 aa  67.4  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1953  putative lipoprotein LpqU  33.52 
 
 		 249 aa  67  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0514713  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  38.85 
 
 		 308 aa  66.6  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0884  Peptidase M23  34.57 
 
 		 345 aa  66.2  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00022367  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4508  Peptidase M23  35.29 
 
 		 392 aa  66.6  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.487012 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2551  NLP/P60 protein  38.17 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5657  putative lipoprotein LpqU  32.75 
 
 		 242 aa  65.5  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3717  putative lipoprotein LpqU  32.75 
 
 		 242 aa  65.5  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.875413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4772  putative lipoprotein LpqU  32.95 
 
 		 249 aa  65.5  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5402  putative lipoprotein LpqU  32.75 
 
 		 242 aa  65.5  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.355441 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2804  putative lipoprotein LpqU  33.73 
 
 		 242 aa  65.5  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5352  putative lipoprotein LpqU  32.75 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3431  hypothetical protein  39.64 
 
 		 559 aa  63.9  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574576  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0850  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  31.36 
 
 		 275 aa  63.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635233  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3420  hypothetical protein  38.74 
 
 		 559 aa  62  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2682  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  39.64 
 
 		 423 aa  62.4  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.342063 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3483  hypothetical protein  38.74 
 
 		 559 aa  62  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0351251 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3592  peptidase M23B  37.82 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  37.4 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0922  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  32.68 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226627  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2289  peptidase M23B  38.35 
 
 		 457 aa  60.5  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000911471  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2717  Peptidase M23  39.31 
 
 		 272 aa  59.7  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000153286  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3111  peptidase M23B  41.94 
 
 		 225 aa  59.7  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.324565  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  38.17 
 
 		 302 aa  60.1  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0065  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  42.53 
 
 		 267 aa  60.1  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4376  lytic transglycosylase, catalytic  36.94 
 
 		 313 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.31469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  33.14 
 
 		 411 aa  59.7  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0869  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  42.86 
 
 		 416 aa  58.9  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.627939  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11040  lipoprotein lpqU  34.29 
 
 		 243 aa  58.9  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0349863  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>