63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11040 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11040  lipoprotein lpqU  100 
 
 		 243 aa  484  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0349863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1953  putative lipoprotein LpqU  71.49 
 
 		 249 aa  352  4e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0514713  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4772  putative lipoprotein LpqU  71.89 
 
 		 249 aa  335  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5402  putative lipoprotein LpqU  70.18 
 
 		 242 aa  324  9e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.355441 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5657  putative lipoprotein LpqU  70.18 
 
 		 242 aa  324  9e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4241  putative lipoprotein LpqU  71.97 
 
 		 252 aa  318  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4620  putative lipoprotein LpqU  71.97 
 
 		 252 aa  318  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.539591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4327  putative lipoprotein LpqU  71.97 
 
 		 252 aa  318  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.295293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3717  putative lipoprotein LpqU  68.78 
 
 		 242 aa  318  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.875413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5352  putative lipoprotein LpqU  71.7 
 
 		 212 aa  296  3e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2804  putative lipoprotein LpqU  71.62 
 
 		 242 aa  288  4e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1569  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  54.55 
 
 		 252 aa  237  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3191  hypothetical protein  51.58 
 
 		 241 aa  209  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24670  hypothetical protein  45.3 
 
 		 282 aa  179  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1583  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  48.31 
 
 		 275 aa  150  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0362  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  42.91 
 
 		 425 aa  149  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0498  secreted protein  47.13 
 
 		 389 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2594  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  47.47 
 
 		 298 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4021  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  46.04 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0202993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2794  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  50.87 
 
 		 466 aa  145  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480258  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0669  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  48.81 
 
 		 314 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1103  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  49.11 
 
 		 815 aa  142  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.792385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1352  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  46.2 
 
 		 506 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32220  hypothetical protein  46.24 
 
 		 453 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0432  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  45.85 
 
 		 421 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288909  hitchhiker  0.00015802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1645  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  46.71 
 
 		 662 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0719412 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1862  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  43.48 
 
 		 377 aa  135  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318749  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1757  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  49.44 
 
 		 251 aa  132  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000259317 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0065  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  51.12 
 
 		 267 aa  132  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6224  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  44.44 
 
 		 277 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.678228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05000  hypothetical protein  47.95 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0850  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  43.11 
 
 		 275 aa  126  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635233  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0674  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  42.11 
 
 		 434 aa  126  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.795427  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0922  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  43.98 
 
 		 249 aa  121  8e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226627  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0569  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  45.35 
 
 		 417 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4063  hypothetical protein  41.28 
 
 		 443 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4003  hypothetical protein  41.28 
 
 		 443 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785178  normal  0.555092 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3989  hypothetical protein  41.28 
 
 		 443 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0846215  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11255  hypothetical protein  43.6 
 
 		 411 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344588 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2206  lytic transglycosylase, catalytic  44.25 
 
 		 439 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4490  lytic transglycosylase, catalytic  44.25 
 
 		 447 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.497479  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1251  hypothetical protein  44.3 
 
 		 546 aa  106  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28410  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  32.66 
 
 		 378 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1074  hypothetical protein  39.34 
 
 		 423 aa  97.1  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  40 
 
 		 411 aa  90.1  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1690  Lytic transglycosylase catalytic  34.03 
 
 		 378 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.120979  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6778  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  30.51 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2445  peptidase M23B  34.29 
 
 		 844 aa  60.1  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5874  hypothetical protein  42.86 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.030306  normal  0.458268 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  33.92 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2302  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 366 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1103  NLP/P60 protein  27.87 
 
 		 349 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.107402  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  33.78 
 
 		 392 aa  50.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  31.47 
 
 		 308 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3208  lytic transglycosylase, catalytic  32.86 
 
 		 387 aa  49.3  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1157  lytic transglycosylase, catalytic  30.37 
 
 		 400 aa  48.9  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.798233  normal  0.63367 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1797  hypothetical protein  37.89 
 
 		 334 aa  46.2  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.52212  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8718  hypothetical protein  40.85 
 
 		 352 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0858  hypothetical protein  36.84 
 
 		 331 aa  44.7  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13211  transglycosylase SLT domain-containing protein  35.48 
 
 		 355 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.26412 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1681  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  29.13 
 
 		 354 aa  43.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.86934  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  31.33 
 
 		 302 aa  42.4  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1448  Lytic transglycosylase catalytic  39.74 
 
 		 362 aa  42  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0207836  normal  0.0364487 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>