80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1352 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1352  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  100 
 
 		 506 aa  976    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1645  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  50 
 
 		 662 aa  285  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0719412 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0674  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  52.87 
 
 		 434 aa  193  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.795427  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32220  hypothetical protein  46.7 
 
 		 453 aa  189  9e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1103  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  50 
 
 		 815 aa  182  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.792385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1862  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  50.56 
 
 		 377 aa  178  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318749  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0569  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  52.25 
 
 		 417 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05000  hypothetical protein  51.48 
 
 		 216 aa  160  7e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24670  hypothetical protein  49.07 
 
 		 282 aa  157  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0498  secreted protein  36.79 
 
 		 389 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3989  hypothetical protein  46.67 
 
 		 443 aa  157  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0846215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4063  hypothetical protein  46.67 
 
 		 443 aa  157  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4003  hypothetical protein  46.67 
 
 		 443 aa  157  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785178  normal  0.555092 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1583  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  46.59 
 
 		 275 aa  156  9e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4021  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  53.42 
 
 		 289 aa  155  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0202993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4327  putative lipoprotein LpqU  48.5 
 
 		 252 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.295293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4620  putative lipoprotein LpqU  48.5 
 
 		 252 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.539591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4241  putative lipoprotein LpqU  48.5 
 
 		 252 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2794  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  43.27 
 
 		 466 aa  150  5e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480258  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5874  hypothetical protein  83.33 
 
 		 263 aa  150  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.030306  normal  0.458268 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0669  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  45.86 
 
 		 314 aa  150  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11255  hypothetical protein  46.39 
 
 		 411 aa  150  7e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344588 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1757  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  52.44 
 
 		 251 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000259317 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0850  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  47.62 
 
 		 275 aa  149  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635233  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4772  putative lipoprotein LpqU  46.86 
 
 		 249 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6224  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  52.56 
 
 		 277 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.678228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0362  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  49.7 
 
 		 425 aa  145  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0432  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  49.11 
 
 		 421 aa  144  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288909  hitchhiker  0.00015802 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0065  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  45.85 
 
 		 267 aa  144  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4490  lytic transglycosylase, catalytic  44.85 
 
 		 447 aa  143  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.497479  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2594  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  50.9 
 
 		 298 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2206  lytic transglycosylase, catalytic  43.03 
 
 		 439 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1569  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  47.02 
 
 		 252 aa  139  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  45.51 
 
 		 411 aa  135  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1953  putative lipoprotein LpqU  45.4 
 
 		 249 aa  134  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0514713  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2804  putative lipoprotein LpqU  45.18 
 
 		 242 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5402  putative lipoprotein LpqU  44.58 
 
 		 242 aa  133  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.355441 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5657  putative lipoprotein LpqU  44.58 
 
 		 242 aa  133  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1074  hypothetical protein  39.49 
 
 		 423 aa  132  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1251  hypothetical protein  52.03 
 
 		 546 aa  127  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0922  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  47.53 
 
 		 249 aa  127  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226627  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3717  putative lipoprotein LpqU  43.98 
 
 		 242 aa  127  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.875413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5352  putative lipoprotein LpqU  43.98 
 
 		 212 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11040  lipoprotein lpqU  46.2 
 
 		 243 aa  124  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0349863  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3191  hypothetical protein  43.83 
 
 		 241 aa  122  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2445  peptidase M23B  35.98 
 
 		 844 aa  89  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2302  lytic transglycosylase catalytic  38.61 
 
 		 366 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  34.21 
 
 		 2449 aa  77.4  0.0000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1690  Lytic transglycosylase catalytic  36.48 
 
 		 378 aa  77  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.120979  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28410  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  31.76 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1157  lytic transglycosylase, catalytic  33.77 
 
 		 400 aa  73.2  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.798233  normal  0.63367 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1666  Lytic transglycosylase catalytic  33.58 
 
 		 906 aa  71.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1103  NLP/P60 protein  32.28 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.107402  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  35 
 
 		 308 aa  70.1  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6778  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  33.94 
 
 		 429 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  32.42 
 
 		 346 aa  63.2  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3208  lytic transglycosylase, catalytic  32.5 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  33.06 
 
 		 2272 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  33.33 
 
 		 2179 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8469  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  26.34 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3054  NLP/P60 protein  27.88 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0610428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2504  Peptidase M23  35.21 
 
 		 290 aa  57  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.241623  normal  0.0435896 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  28.04 
 
 		 390 aa  56.6  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2682  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  35.34 
 
 		 423 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.342063 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  40.51 
 
 		 541 aa  53.9  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0858  hypothetical protein  36.94 
 
 		 331 aa  53.5  0.000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  36.84 
 
 		 682 aa  53.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13211  transglycosylase SLT domain-containing protein  38.83 
 
 		 355 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.26412 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1797  hypothetical protein  29.11 
 
 		 334 aa  52  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.52212  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  27.62 
 
 		 352 aa  50.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8718  hypothetical protein  43.06 
 
 		 352 aa  50.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0869  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  33.78 
 
 		 416 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.627939  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1267  lytic transglycosylase catalytic  35.42 
 
 		 176 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.570038  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  31.36 
 
 		 308 aa  48.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3420  hypothetical protein  45.07 
 
 		 559 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3483  hypothetical protein  45.07 
 
 		 559 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0351251 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3431  hypothetical protein  45.07 
 
 		 559 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574576  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1119  G5 domain protein  30.65 
 
 		 1859 aa  46.6  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.983019  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  32.66 
 
 		 302 aa  43.5  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3478  lytic transglycosylase  38.57 
 
 		 175 aa  43.5  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61144  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>