103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5352 on replicon NC_009339
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3717  putative lipoprotein LpqU  98.58 
 
 		 242 aa  424  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.875413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5352  putative lipoprotein LpqU  100 
 
 		 212 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5657  putative lipoprotein LpqU  95.28 
 
 		 242 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5402  putative lipoprotein LpqU  95.28 
 
 		 242 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.355441 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2804  putative lipoprotein LpqU  94.31 
 
 		 242 aa  380  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1953  putative lipoprotein LpqU  71.56 
 
 		 249 aa  308  4e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0514713  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4772  putative lipoprotein LpqU  71.36 
 
 		 249 aa  294  6e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4241  putative lipoprotein LpqU  70.56 
 
 		 252 aa  287  9e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4327  putative lipoprotein LpqU  70.56 
 
 		 252 aa  287  9e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.295293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4620  putative lipoprotein LpqU  70.56 
 
 		 252 aa  287  9e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.539591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11040  lipoprotein lpqU  74.35 
 
 		 243 aa  278  3e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0349863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1569  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  57.21 
 
 		 252 aa  231  5e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3191  hypothetical protein  55.98 
 
 		 241 aa  223  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24670  hypothetical protein  45.02 
 
 		 282 aa  167  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2794  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  47.28 
 
 		 466 aa  142  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480258  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1103  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  47.43 
 
 		 815 aa  143  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.792385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1583  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  44.94 
 
 		 275 aa  142  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0432  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  44.17 
 
 		 421 aa  141  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288909  hitchhiker  0.00015802 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2594  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  46.59 
 
 		 298 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4021  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  42.93 
 
 		 289 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0202993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0498  secreted protein  44.38 
 
 		 389 aa  138  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0362  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  44.06 
 
 		 425 aa  138  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6224  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  41.74 
 
 		 277 aa  135  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.678228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1757  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  46.89 
 
 		 251 aa  132  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000259317 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0669  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  44.12 
 
 		 314 aa  132  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1352  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  43.98 
 
 		 506 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0065  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  42.11 
 
 		 267 aa  126  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1862  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  42.39 
 
 		 377 aa  125  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318749  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0674  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  41.38 
 
 		 434 aa  125  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.795427  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1645  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  43.98 
 
 		 662 aa  123  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0719412 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05000  hypothetical protein  44.19 
 
 		 216 aa  122  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0922  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  42.35 
 
 		 249 aa  121  9e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226627  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32220  hypothetical protein  44.25 
 
 		 453 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11255  hypothetical protein  44.51 
 
 		 411 aa  119  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344588 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0569  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  39.8 
 
 		 417 aa  115  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3989  hypothetical protein  39.53 
 
 		 443 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0846215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4063  hypothetical protein  39.53 
 
 		 443 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4003  hypothetical protein  39.53 
 
 		 443 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785178  normal  0.555092 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0850  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  38.92 
 
 		 275 aa  112  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635233  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1251  hypothetical protein  43.45 
 
 		 546 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2206  lytic transglycosylase, catalytic  41.28 
 
 		 439 aa  108  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4490  lytic transglycosylase, catalytic  40.7 
 
 		 447 aa  105  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.497479  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1074  hypothetical protein  40.27 
 
 		 423 aa  102  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28410  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  30.81 
 
 		 378 aa  88.6  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  38.99 
 
 		 411 aa  85.9  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5874  hypothetical protein  48.05 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.030306  normal  0.458268 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1690  Lytic transglycosylase catalytic  34.46 
 
 		 378 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.120979  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2445  peptidase M23B  33.33 
 
 		 844 aa  66.6  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6778  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  32.18 
 
 		 429 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  38.66 
 
 		 434 aa  59.3  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2302  lytic transglycosylase catalytic  34.07 
 
 		 366 aa  59.3  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  32.37 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1666  Lytic transglycosylase catalytic  43.84 
 
 		 906 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  37.23 
 
 		 308 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1103  NLP/P60 protein  31.36 
 
 		 349 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.107402  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  42.27 
 
 		 346 aa  53.1  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2958  lytic murein transglycosylase  48.48 
 
 		 408 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.141235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3208  lytic transglycosylase, catalytic  41.49 
 
 		 387 aa  52.8  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2811  lytic murein transglycosylase  45.45 
 
 		 405 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.119364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2502  lytic murein transglycosylase  45.45 
 
 		 408 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0535188  normal  0.354927 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  32.5 
 
 		 392 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0167  lytic murein transglycosylase  33.6 
 
 		 445 aa  50.1  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000010193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1644  lytic murein transglycosylase  46.97 
 
 		 407 aa  50.1  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2304  lytic murein transglycosylase  46.97 
 
 		 407 aa  49.7  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0222996  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2790  lytic murein transglycosylase  46.97 
 
 		 409 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0861684  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1448  Lytic transglycosylase catalytic  46.25 
 
 		 362 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0207836  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1157  lytic transglycosylase, catalytic  30.37 
 
 		 400 aa  49.3  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.798233  normal  0.63367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4006  putative membrane-bound lytic transglycosylase precursor protein, putative signal peptide  45.45 
 
 		 406 aa  48.9  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.883363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  36.61 
 
 		 454 aa  48.5  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4395  putative transglycolase  30.47 
 
 		 271 aa  48.5  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443848 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1802  Lytic transglycosylase catalytic  42.27 
 
 		 384 aa  48.5  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187771  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13211  transglycosylase SLT domain-containing protein  38.46 
 
 		 355 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.26412 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1797  hypothetical protein  38.95 
 
 		 334 aa  47  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.52212  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3846  lytic murein transglycosylase  45.31 
 
 		 416 aa  47  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.977376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2504  Peptidase M23  37.04 
 
 		 290 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.241623  normal  0.0435896 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3478  lytic transglycosylase  33.98 
 
 		 175 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2993  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  36.11 
 
 		 336 aa  46.2  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.307709  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3035  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  36.11 
 
 		 336 aa  46.2  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.833055  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8718  hypothetical protein  37.66 
 
 		 352 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0858  hypothetical protein  37.89 
 
 		 331 aa  45.8  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1267  lytic transglycosylase catalytic  33.65 
 
 		 176 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.570038  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0825  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  31.25 
 
 		 247 aa  45.1  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.4948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  33.03 
 
 		 352 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2008  lytic murein transglycosylase  36 
 
 		 362 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000275571  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2396  lytic murein transglycosylase  36 
 
 		 362 aa  44.3  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0276595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2119  lytic murein transglycosylase  37.33 
 
 		 361 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0387524  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0662  lytic murein transglycosylase  45.83 
 
 		 433 aa  44.3  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00608172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0389  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  37.18 
 
 		 299 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0691  membrane-bound lytic murein transglycosylase  37.31 
 
 		 434 aa  43.1  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000567211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1158  hypothetical protein  28.72 
 
 		 273 aa  43.1  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.441792  normal  0.170039 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  34.23 
 
 		 427 aa  43.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  44.64 
 
 		 541 aa  43.1  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1681  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  35.8 
 
 		 354 aa  42.7  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.86934  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3449  lytic murein transglycosylase  42.42 
 
 		 442 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.139295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  33.02 
 
 		 455 aa  42.4  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2163  lytic murein transglycosylase, putative  35.53 
 
 		 267 aa  42.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281139  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0836  lytic murein transglycosylase, putative  35.53 
 
 		 267 aa  42.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0459329  normal  0.93917 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3675  lytic murein transglycosylase  29.32 
 
 		 271 aa  42.4  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0608775 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  30.77 
 
 		 445 aa  42  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4680  lytic murein transglycosylase B  37.31 
 
 		 336 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>