More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3846 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3846  lytic murein transglycosylase  100 
 
 		 416 aa  837    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.977376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2811  lytic murein transglycosylase  61.17 
 
 		 405 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.119364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1644  lytic murein transglycosylase  58.65 
 
 		 407 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4006  putative membrane-bound lytic transglycosylase precursor protein, putative signal peptide  60.58 
 
 		 406 aa  462  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.883363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2304  lytic murein transglycosylase  59.47 
 
 		 407 aa  461  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0222996  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2790  lytic murein transglycosylase  59.52 
 
 		 409 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0861684  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2958  lytic murein transglycosylase  58.51 
 
 		 408 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.141235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2502  lytic murein transglycosylase  58.47 
 
 		 408 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0535188  normal  0.354927 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4047  lytic murein transglycosylase  46.41 
 
 		 423 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4844  lytic murein transglycosylase  45.59 
 
 		 429 aa  309  8e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  46.17 
 
 		 417 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  46.28 
 
 		 419 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  44.83 
 
 		 438 aa  298  9e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  45.05 
 
 		 438 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  40.91 
 
 		 455 aa  297  2e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  43.08 
 
 		 413 aa  296  3e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  44.53 
 
 		 438 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  42.82 
 
 		 413 aa  296  6e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  44.53 
 
 		 438 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  44.53 
 
 		 438 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  42.93 
 
 		 418 aa  293  5e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  44.44 
 
 		 421 aa  292  9e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  42.38 
 
 		 445 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  42.69 
 
 		 448 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  41.54 
 
 		 445 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  43.22 
 
 		 448 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  38.61 
 
 		 409 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  42.57 
 
 		 415 aa  288  9e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  41.02 
 
 		 427 aa  288  9e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  43.34 
 
 		 440 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  42.06 
 
 		 417 aa  287  2.9999999999999996e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  41.49 
 
 		 424 aa  279  9e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0357  lytic murein transglycosylase  43.27 
 
 		 514 aa  276  3e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4208  transglycolase  39.79 
 
 		 398 aa  274  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  39.27 
 
 		 398 aa  272  9e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  39.85 
 
 		 404 aa  268  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0968  lytic murein transglycosylase  41.16 
 
 		 461 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164156  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3356  lytic murein transglycosylase  43.16 
 
 		 430 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  39.61 
 
 		 422 aa  267  2.9999999999999995e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6960  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative signal peptide  40.51 
 
 		 464 aa  265  8e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0775  lytic murein transglycosylase  40.25 
 
 		 451 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  41.51 
 
 		 418 aa  263  4e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4521  lytic murein transglycosylase  40.35 
 
 		 464 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1952  transglycolase  39.9 
 
 		 491 aa  262  1e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.135275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1132  lytic murein transglycosylase  41.25 
 
 		 481 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3612  lytic murein transglycosylase  37.29 
 
 		 407 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  39.25 
 
 		 411 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4363  lytic murein transglycosylase  39.75 
 
 		 469 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.831397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2957  lytic murein transglycosylase  42.15 
 
 		 470 aa  258  2e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.344089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2246  lytic murein transglycosylase  39.36 
 
 		 490 aa  258  2e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.27518 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0286  lytic murein transglycosylase  38.56 
 
 		 474 aa  257  3e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  39.35 
 
 		 401 aa  256  4e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  43.27 
 
 		 438 aa  256  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0388  lytic murein transglycosylase  38.29 
 
 		 443 aa  256  5e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.143881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2740  lytic murein transglycosylase  39.55 
 
 		 407 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.788715  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2708  lytic murein transglycosylase  37.29 
 
 		 405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.384305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3314  lytic murein transglycosylase  37.57 
 
 		 407 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0662  lytic murein transglycosylase  38.44 
 
 		 433 aa  253  4.0000000000000004e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00608172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  37.82 
 
 		 398 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0691  membrane-bound lytic murein transglycosylase  38.3 
 
 		 434 aa  251  2e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000567211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  37.97 
 
 		 462 aa  250  4e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0167  lytic murein transglycosylase  40 
 
 		 445 aa  250  4e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000010193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  38.58 
 
 		 398 aa  249  6e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  37.97 
 
 		 413 aa  249  8e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1972  lytic murein transglycosylase  41.95 
 
 		 486 aa  248  1e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000382948  normal  0.768189 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0333  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  34.95 
 
 		 418 aa  247  2e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4273  lytic murein transglycosylase  37.47 
 
 		 412 aa  248  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0064  putative transglycosylase  36.43 
 
 		 412 aa  248  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4736  lytic murein transglycosylase  38.32 
 
 		 398 aa  247  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  39.64 
 
 		 454 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  38.54 
 
 		 430 aa  245  9e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  38.15 
 
 		 398 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  38.26 
 
 		 377 aa  243  5e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  38.79 
 
 		 400 aa  242  9e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0041  lytic murein transglycosylase  39.29 
 
 		 398 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.765237  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3727  lytic murein transglycosylase  36.76 
 
 		 405 aa  241  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3470  lytic murein transglycosylase  41.75 
 
 		 400 aa  241  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4881  lytic murein transglycosylase  37.44 
 
 		 442 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2868  lytic murein transglycosylase  37.98 
 
 		 425 aa  240  4e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0871  lytic murein transglycosylase  40.48 
 
 		 429 aa  239  5e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  37.86 
 
 		 434 aa  239  9e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  37.89 
 
 		 720 aa  239  9e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0070  transglycosylase, putative  35.94 
 
 		 408 aa  238  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.18416  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3645  lytic murein transglycosylase  39.74 
 
 		 419 aa  238  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0107772  normal  0.911576 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  36.52 
 
 		 438 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  36.39 
 
 		 411 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  39.52 
 
 		 409 aa  238  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  39.95 
 
 		 457 aa  237  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  35.92 
 
 		 428 aa  237  3e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  36.52 
 
 		 436 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  36.11 
 
 		 396 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  36.27 
 
 		 438 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3272  lytic murein transglycosylase  41.64 
 
 		 393 aa  235  9e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  37.04 
 
 		 395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  43.12 
 
 		 392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3596  lytic murein transglycosylase  41.64 
 
 		 393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.662665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2522  lytic murein transglycosylase  37.15 
 
 		 406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  36.2 
 
 		 439 aa  234  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1233  lytic murein transglycosylase  37.62 
 
 		 405 aa  234  3e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0329877 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  40.05 
 
 		 474 aa  233  5e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>