115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4772 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4772  putative lipoprotein LpqU  100 
 
 		 249 aa  507  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1953  putative lipoprotein LpqU  91.97 
 
 		 249 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0514713  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4241  putative lipoprotein LpqU  74.6 
 
 		 252 aa  340  1e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4327  putative lipoprotein LpqU  74.6 
 
 		 252 aa  340  1e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.295293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4620  putative lipoprotein LpqU  74.6 
 
 		 252 aa  340  1e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.539591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3717  putative lipoprotein LpqU  67.47 
 
 		 242 aa  332  2e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.875413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5657  putative lipoprotein LpqU  70.94 
 
 		 242 aa  332  3e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5402  putative lipoprotein LpqU  70.94 
 
 		 242 aa  332  3e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.355441 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11040  lipoprotein lpqU  70.92 
 
 		 243 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0349863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5352  putative lipoprotein LpqU  69.72 
 
 		 212 aa  303  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2804  putative lipoprotein LpqU  71.05 
 
 		 242 aa  297  1e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1569  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  49.19 
 
 		 252 aa  219  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3191  hypothetical protein  50.22 
 
 		 241 aa  214  9e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24670  hypothetical protein  47.59 
 
 		 282 aa  169  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0362  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  44.7 
 
 		 425 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0432  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  44.86 
 
 		 421 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288909  hitchhiker  0.00015802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4021  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  44.34 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0202993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1352  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  46.86 
 
 		 506 aa  145  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1583  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  46.74 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0498  secreted protein  44.89 
 
 		 389 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0669  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  44.51 
 
 		 314 aa  139  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2794  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  47.46 
 
 		 466 aa  138  8.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480258  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1645  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  45.14 
 
 		 662 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0719412 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0674  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  42.78 
 
 		 434 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.795427  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2594  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  44.44 
 
 		 298 aa  133  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1862  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  44.94 
 
 		 377 aa  133  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318749  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1103  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  45.14 
 
 		 815 aa  132  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.792385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1757  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  43.46 
 
 		 251 aa  132  6e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000259317 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0569  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  45.81 
 
 		 417 aa  128  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32220  hypothetical protein  46.63 
 
 		 453 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0065  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  47.03 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0922  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  43.1 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226627  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3989  hypothetical protein  42.46 
 
 		 443 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0846215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4063  hypothetical protein  42.46 
 
 		 443 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4003  hypothetical protein  42.46 
 
 		 443 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785178  normal  0.555092 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6224  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  44.92 
 
 		 277 aa  125  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.678228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11255  hypothetical protein  42.46 
 
 		 411 aa  123  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344588 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2206  lytic transglycosylase, catalytic  44.38 
 
 		 439 aa  122  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0850  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  42.2 
 
 		 275 aa  122  7e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635233  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4490  lytic transglycosylase, catalytic  42.7 
 
 		 447 aa  116  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.497479  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05000  hypothetical protein  43.26 
 
 		 216 aa  115  6e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1074  hypothetical protein  41.71 
 
 		 423 aa  108  9.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1251  hypothetical protein  42.58 
 
 		 546 aa  107  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28410  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  32.26 
 
 		 378 aa  96.3  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  36.84 
 
 		 411 aa  80.1  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5874  hypothetical protein  49.35 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.030306  normal  0.458268 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1690  Lytic transglycosylase catalytic  31.37 
 
 		 378 aa  74.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.120979  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6778  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  31.35 
 
 		 429 aa  69.3  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2445  peptidase M23B  32.39 
 
 		 844 aa  67  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2302  lytic transglycosylase catalytic  32.34 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  34.27 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1157  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.798233  normal  0.63367 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1103  NLP/P60 protein  31.32 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.107402  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  30.41 
 
 		 308 aa  58.9  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  34.38 
 
 		 392 aa  55.8  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1666  Lytic transglycosylase catalytic  43.84 
 
 		 906 aa  52  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  35.77 
 
 		 434 aa  52  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  38.95 
 
 		 346 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8718  hypothetical protein  46.27 
 
 		 352 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  34.51 
 
 		 352 aa  49.3  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1448  Lytic transglycosylase catalytic  45 
 
 		 362 aa  49.3  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0207836  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  37.5 
 
 		 454 aa  48.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  36.67 
 
 		 541 aa  48.1  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3208  lytic transglycosylase, catalytic  30.82 
 
 		 387 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1558  lytic murein transglycosylase B  32.48 
 
 		 372 aa  47.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000667171  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0724  lytic murein transglycosylase B  29.41 
 
 		 362 aa  46.2  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2551  NLP/P60 protein  32.48 
 
 		 331 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  32.4 
 
 		 327 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13211  transglycosylase SLT domain-containing protein  39.74 
 
 		 355 aa  45.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.26412 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1802  Lytic transglycosylase catalytic  44.16 
 
 		 384 aa  46.2  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187771  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2437  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  42.5 
 
 		 363 aa  45.8  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1797  hypothetical protein  41.77 
 
 		 334 aa  45.8  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.52212  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1010  lytic murein transglycosylase B  34.56 
 
 		 327 aa  45.8  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1681  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  36.36 
 
 		 354 aa  45.8  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.86934  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1838  hypothetical protein  31.78 
 
 		 338 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3339  Zn-finger, DksA/TraR C4 type  29.52 
 
 		 341 aa  45.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000917071  normal  0.0196691 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1835  hypothetical protein  31.78 
 
 		 338 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2163  lytic murein transglycosylase, putative  30.84 
 
 		 267 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281139  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0858  hypothetical protein  39.24 
 
 		 331 aa  44.3  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0836  lytic murein transglycosylase, putative  30.84 
 
 		 267 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0459329  normal  0.93917 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0825  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  31.78 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.4948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3151  lytic murein transglycosylase B  29.79 
 
 		 332 aa  44.3  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000109427  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3033  murein hydrolase B  30.4 
 
 		 359 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.986861  hitchhiker  0.00384978 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3017  murein hydrolase B  30.4 
 
 		 359 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0248786  hitchhiker  0.00000130232 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2951  murein hydrolase B  30.4 
 
 		 359 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2504  Peptidase M23  39.02 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.241623  normal  0.0435896 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1158  hypothetical protein  27.45 
 
 		 273 aa  43.9  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.441792  normal  0.170039 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3431  hypothetical protein  36.59 
 
 		 559 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574576  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4395  putative transglycolase  33.33 
 
 		 271 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443848 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2119  lytic murein transglycosylase  32.65 
 
 		 361 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0387524  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3420  hypothetical protein  36.59 
 
 		 559 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2993  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  39.19 
 
 		 336 aa  43.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.307709  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3035  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  39.19 
 
 		 336 aa  43.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.833055  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3483  hypothetical protein  36.59 
 
 		 559 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0351251 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1864  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  29.71 
 
 		 370 aa  43.1  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.498098 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3140  murein hydrolase B  30.4 
 
 		 359 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011218 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  29.87 
 
 		 302 aa  43.1  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3573  lytic murein transglycosylase  29.03 
 
 		 381 aa  42.7  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  decreased coverage  0.00457991 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4680  lytic murein transglycosylase B  38.81 
 
 		 336 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2008  lytic murein transglycosylase  39.34 
 
 		 362 aa  43.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000275571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>