80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_13211 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_13211  transglycosylase SLT domain-containing protein  100 
 
 		 355 aa  722    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.26412 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1797  hypothetical protein  71.79 
 
 		 334 aa  412  1e-114  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.52212  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0858  hypothetical protein  63.86 
 
 		 331 aa  399  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3431  hypothetical protein  45.7 
 
 		 559 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574576  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3483  hypothetical protein  45.31 
 
 		 559 aa  229  7e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0351251 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3420  hypothetical protein  45.31 
 
 		 559 aa  229  7e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4376  lytic transglycosylase, catalytic  42.86 
 
 		 313 aa  202  7e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.31469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2290  lytic transglycosylase, catalytic  42.46 
 
 		 253 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8718  hypothetical protein  36.03 
 
 		 352 aa  142  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2302  lytic transglycosylase catalytic  45.87 
 
 		 366 aa  91.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6778  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  41.03 
 
 		 429 aa  85.9  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1690  Lytic transglycosylase catalytic  42.99 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.120979  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1666  Lytic transglycosylase catalytic  40.16 
 
 		 906 aa  82  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1157  lytic transglycosylase, catalytic  40.52 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.798233  normal  0.63367 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2445  peptidase M23B  39.06 
 
 		 844 aa  74.3  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3054  NLP/P60 protein  37.31 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0610428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2551  NLP/P60 protein  32.41 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  38.39 
 
 		 346 aa  72.8  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  42.99 
 
 		 308 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  40 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3208  lytic transglycosylase, catalytic  49.56 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2504  Peptidase M23  39.84 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.241623  normal  0.0435896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8469  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  36.23 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1103  NLP/P60 protein  40.83 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.107402  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  32.17 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1448  Lytic transglycosylase catalytic  43.56 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0207836  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  33.87 
 
 		 327 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  33.62 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4003  hypothetical protein  31.37 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785178  normal  0.555092 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4063  hypothetical protein  31.37 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3989  hypothetical protein  31.37 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0846215  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  29.93 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1802  Lytic transglycosylase catalytic  43.14 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187771  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1681  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  35.78 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.86934  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  25.57 
 
 		 1048 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2206  lytic transglycosylase, catalytic  41.67 
 
 		 439 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2804  putative lipoprotein LpqU  40.66 
 
 		 242 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4490  lytic transglycosylase, catalytic  41.67 
 
 		 447 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.497479  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24670  hypothetical protein  37.25 
 
 		 282 aa  53.5  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3717  putative lipoprotein LpqU  43.42 
 
 		 242 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.875413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1645  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  31.33 
 
 		 662 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0719412 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2594  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  40 
 
 		 298 aa  52.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1074  hypothetical protein  30.43 
 
 		 423 aa  52.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1251  hypothetical protein  34.19 
 
 		 546 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1352  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  30.82 
 
 		 506 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5402  putative lipoprotein LpqU  38.46 
 
 		 242 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.355441 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5874  hypothetical protein  48.57 
 
 		 263 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.030306  normal  0.458268 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5657  putative lipoprotein LpqU  38.46 
 
 		 242 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0669  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  37.39 
 
 		 314 aa  50.4  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3220  lytic transglycosylase, catalytic  39 
 
 		 212 aa  49.7  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05000  hypothetical protein  35.11 
 
 		 216 aa  48.9  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  36.27 
 
 		 245 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0850  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  38.71 
 
 		 275 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635233  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  32.31 
 
 		 541 aa  48.1  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0674  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  40.23 
 
 		 434 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.795427  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0809  lytic transglycosylase, catalytic  37.63 
 
 		 669 aa  48.5  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.344534 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1583  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  40.23 
 
 		 275 aa  48.1  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4327  putative lipoprotein LpqU  33.65 
 
 		 252 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.295293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4241  putative lipoprotein LpqU  33.65 
 
 		 252 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4620  putative lipoprotein LpqU  33.65 
 
 		 252 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.539591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1862  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  34.95 
 
 		 377 aa  47.4  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318749  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1168  lytic transglycosylase, catalytic  36.26 
 
 		 669 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129127 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32220  hypothetical protein  38.46 
 
 		 453 aa  47  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11255  hypothetical protein  30.77 
 
 		 411 aa  47  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344588 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5352  putative lipoprotein LpqU  42.11 
 
 		 212 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0380  Lytic transglycosylase catalytic  40.48 
 
 		 555 aa  46.2  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4772  putative lipoprotein LpqU  39.74 
 
 		 249 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0569  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  29.25 
 
 		 417 aa  46.2  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  42.25 
 
 		 318 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1103  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  27.33 
 
 		 815 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.792385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1953  putative lipoprotein LpqU  39.74 
 
 		 249 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0514713  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1267  lytic transglycosylase catalytic  58.7 
 
 		 176 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.570038  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2794  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  28.3 
 
 		 466 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480258  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1757  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  38.64 
 
 		 251 aa  43.9  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000259317 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4021  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  41.86 
 
 		 289 aa  43.9  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0202993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3478  lytic transglycosylase  56.25 
 
 		 175 aa  43.5  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0498  secreted protein  26.06 
 
 		 389 aa  43.1  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  43.66 
 
 		 325 aa  42.7  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  35.29 
 
 		 260 aa  42.7  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  34.21 
 
 		 260 aa  42.7  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>