More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0809 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_0809  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 
669 aa  1359    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.344534 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1168  lytic transglycosylase, catalytic  90.13 
 
 
669 aa  1237    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129127 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2251  putative bacteriophage protein  43.36 
 
 
632 aa  317  4e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2403  hypothetical protein  39.67 
 
 
564 aa  177  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1814  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  46.12 
 
 
677 aa  177  7e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4158  hypothetical protein  33.33 
 
 
566 aa  145  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3642  hypothetical protein  29.61 
 
 
597 aa  128  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1044  lytic transglycosylase, catalytic  51.26 
 
 
367 aa  108  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.093004  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  50 
 
 
241 aa  103  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  43.33 
 
 
260 aa  103  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  41.26 
 
 
258 aa  103  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  42.97 
 
 
196 aa  102  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  43.33 
 
 
260 aa  102  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 
251 aa  98.6  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  36.31 
 
 
282 aa  97.4  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1985  hypothetical protein  27.2 
 
 
711 aa  97.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3084  Lytic transglycosylase catalytic  28 
 
 
623 aa  97.1  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  47.01 
 
 
199 aa  93.2  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  48.25 
 
 
368 aa  91.3  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3643  hypothetical protein  26.36 
 
 
642 aa  90.9  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  42.02 
 
 
198 aa  90.5  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  46.85 
 
 
327 aa  87.4  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  41.98 
 
 
194 aa  87.4  8e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  44.19 
 
 
206 aa  87  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0026  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  39.33 
 
 
495 aa  86.7  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.250795  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  41.82 
 
 
197 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  42.74 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  39.67 
 
 
189 aa  84.3  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  43.24 
 
 
212 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  37.7 
 
 
261 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  37.7 
 
 
261 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  37.7 
 
 
261 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  44.44 
 
 
208 aa  83.2  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  37.7 
 
 
261 aa  82.4  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  42.15 
 
 
278 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  34.25 
 
 
204 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1293  hypothetical protein  24.27 
 
 
629 aa  81.6  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0077  Lytic transglycosylase catalytic  34.46 
 
 
322 aa  81.6  0.00000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  42.73 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  44.12 
 
 
217 aa  81.3  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  37.12 
 
 
238 aa  80.9  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  34.25 
 
 
204 aa  80.9  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  42.73 
 
 
218 aa  80.9  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  42.99 
 
 
203 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  36.89 
 
 
261 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  38.66 
 
 
174 aa  80.5  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  44.95 
 
 
201 aa  80.5  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  36.89 
 
 
261 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  41.32 
 
 
271 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  36.89 
 
 
259 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  36.89 
 
 
261 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  34.57 
 
 
216 aa  78.6  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  38.66 
 
 
198 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  39.72 
 
 
244 aa  78.6  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  36.89 
 
 
261 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  41.51 
 
 
188 aa  78.6  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  40.37 
 
 
261 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  41.96 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  47.06 
 
 
318 aa  77  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  37.82 
 
 
202 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1380  Lytic transglycosylase catalytic  42.73 
 
 
234 aa  76.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033505 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  38.66 
 
 
203 aa  77  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 
733 aa  77  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  37.86 
 
 
209 aa  76.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  39.09 
 
 
224 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  42.59 
 
 
195 aa  76.3  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  37.86 
 
 
209 aa  76.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  35.29 
 
 
233 aa  76.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  41.18 
 
 
291 aa  75.5  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2342  lytic transglycosylase, catalytic  40.78 
 
 
272 aa  75.5  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  37.19 
 
 
206 aa  75.9  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  36.44 
 
 
247 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1262  hypothetical protein  23.92 
 
 
629 aa  74.7  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  38.73 
 
 
209 aa  74.7  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1025  hypothetical protein  23.92 
 
 
629 aa  74.7  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  41.44 
 
 
209 aa  74.7  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1379  peptidoglycan-binding LysM  43.22 
 
 
556 aa  74.3  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  39.5 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  44.14 
 
 
370 aa  74.3  0.000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0798  lytic transglycosylase catalytic  38 
 
 
351 aa  73.9  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.44501  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  41.67 
 
 
226 aa  73.9  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  33.57 
 
 
196 aa  73.6  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  35.48 
 
 
362 aa  73.2  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4351  lytic transglycosylase catalytic  32.14 
 
 
194 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.744622  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  36.6 
 
 
442 aa  73.6  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  34.09 
 
 
191 aa  72.8  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  40.3 
 
 
596 aa  72.8  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3834  Lytic transglycosylase catalytic  33.13 
 
 
405 aa  72.8  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4463  Lytic transglycosylase catalytic  39.32 
 
 
498 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.689594  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  38.06 
 
 
661 aa  72.8  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1522  Lytic transglycosylase catalytic  43.22 
 
 
561 aa  72.8  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00867161  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  35.83 
 
 
280 aa  72.8  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1087  lytic transglycosylase, catalytic  43.08 
 
 
650 aa  72.8  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.106498  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  42.99 
 
 
198 aa  72  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  41.9 
 
 
438 aa  72  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1911  soluble lytic murein transglycosylase  40.74 
 
 
296 aa  71.6  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0241391  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  37.01 
 
 
285 aa  71.2  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0561  lytic transglycosylase, catalytic  40.74 
 
 
296 aa  71.6  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0965  Lytic transglycosylase catalytic  43.08 
 
 
570 aa  71.2  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0306  lytic transglycosylase, catalytic  40.74 
 
 
293 aa  71.2  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>