21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2403 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2403  hypothetical protein  100 
 
 		 564 aa  1126    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1814  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  64.78 
 
 		 677 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2251  putative bacteriophage protein  44.75 
 
 		 632 aa  193  6e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0809  lytic transglycosylase, catalytic  37.93 
 
 		 669 aa  177  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.344534 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1168  lytic transglycosylase, catalytic  37.16 
 
 		 669 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129127 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1875  putative membrane protein, phage K related  30.37 
 
 		 600 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855752  hitchhiker  0.000000000791061 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3052  putative membrane protein, phage K related  46.45 
 
 		 574 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00556585  hitchhiker  0.0000266051 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4158  hypothetical protein  29.39 
 
 		 566 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3642  hypothetical protein  25.32 
 
 		 597 aa  120  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3084  Lytic transglycosylase catalytic  31.35 
 
 		 623 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1321  hypothetical protein  43.07 
 
 		 983 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3643  hypothetical protein  29.41 
 
 		 642 aa  105  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1985  hypothetical protein  24.94 
 
 		 711 aa  80.9  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1293  hypothetical protein  27.88 
 
 		 629 aa  73.9  0.000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1025  hypothetical protein  27.3 
 
 		 629 aa  73.9  0.000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1262  hypothetical protein  27.3 
 
 		 629 aa  73.9  0.000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2451  hypothetical protein  30.84 
 
 		 1088 aa  57  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2414  hypothetical protein  35.64 
 
 		 957 aa  50.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1884  hypothetical protein  31.45 
 
 		 811 aa  49.3  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.505665  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1640  M23/M37 peptidase domain-containing protein  29.86 
 
 		 2757 aa  45.4  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2411  hypothetical protein  32.14 
 
 		 517 aa  44.7  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.422595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>