32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1884 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1884  hypothetical protein  100 
 
 		 811 aa  1639    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.505665  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2351  hypothetical protein  30.91 
 
 		 669 aa  177  7e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0873  Methyl-accepting chemotaxis protein  38.08 
 
 		 701 aa  169  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1371  hypothetical protein  35.52 
 
 		 794 aa  161  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.248761 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0288  hypothetical protein  34.36 
 
 		 781 aa  147  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.950335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1646  hypothetical protein  39.25 
 
 		 623 aa  142  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327516  normal  0.459319 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2477  hypothetical protein  38.35 
 
 		 732 aa  107  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1517  putative phage HK97 tail length tape measure-related protein  45.16 
 
 		 924 aa  87.8  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.813512  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3992  hypothetical protein  31.94 
 
 		 738 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3367  prophage tail length tape measure  47.06 
 
 		 970 aa  74.7  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.759316 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1716  putative phage HK97 tail length tape measure-related protein  45.28 
 
 		 924 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.309525  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3876  phage tape measure protein  50.54 
 
 		 1380 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.147169 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2177  hypothetical protein  54.79 
 
 		 620 aa  68.2  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.502286 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1638  putative tail component of prophage CP-933K  41.1 
 
 		 936 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.663672  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3717  hypothetical protein  30.43 
 
 		 1127 aa  63.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.417403 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1688  hypothetical protein  37.69 
 
 		 1354 aa  61.6  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1056  hypothetical protein  37.69 
 
 		 1366 aa  61.2  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.414557  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2736  hypothetical protein  26.78 
 
 		 756 aa  60.1  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3052  putative membrane protein, phage K related  29.14 
 
 		 574 aa  57  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00556585  hitchhiker  0.0000266051 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3197  phage tape measure protein  38.1 
 
 		 1318 aa  53.9  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3494  hypothetical protein  26.8 
 
 		 852 aa  53.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0571399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1875  putative membrane protein, phage K related  34.27 
 
 		 600 aa  53.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855752  hitchhiker  0.000000000791061 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  48 
 
 		 1096 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2451  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1088 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1640  M23/M37 peptidase domain-containing protein  45 
 
 		 2757 aa  52.4  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2414  hypothetical protein  31.01 
 
 		 957 aa  50.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1281  hypothetical protein  27.22 
 
 		 824 aa  48.5  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0994  phage tail tape measure protein, TP901 family  53.33 
 
 		 1173 aa  48.1  0.0006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2403  hypothetical protein  30.56 
 
 		 564 aa  47.8  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3535  Lytic transglycosylase catalytic  26.89 
 
 		 1160 aa  45.8  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3328  hypothetical protein  32.14 
 
 		 1632 aa  46.2  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.053568 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6230  hypothetical protein  32.35 
 
 		 1248 aa  45.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>