49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2351 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2351  hypothetical protein  100 
 
 		 669 aa  1318    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0873  Methyl-accepting chemotaxis protein  37.08 
 
 		 701 aa  360  5e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1646  hypothetical protein  43.58 
 
 		 623 aa  318  3e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327516  normal  0.459319 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1371  hypothetical protein  55.02 
 
 		 794 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.248761 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0288  hypothetical protein  51.82 
 
 		 781 aa  272  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.950335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1884  hypothetical protein  31.26 
 
 		 811 aa  180  7e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.505665  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3596  phage tape measure protein  48.35 
 
 		 632 aa  145  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0625908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  55.73 
 
 		 1096 aa  135  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1761  phage tape measure protein  35.02 
 
 		 921 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.337369 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1990  tail component of prophage protein  36.68 
 
 		 915 aa  96.7  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6230  hypothetical protein  43.48 
 
 		 1248 aa  94.4  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5056  hypothetical protein  39.46 
 
 		 1353 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7016  hypothetical protein  42.06 
 
 		 1203 aa  90.5  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4067  hypothetical protein  41.48 
 
 		 1263 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3873  Prophage tail length tape measure  38.36 
 
 		 1190 aa  84.3  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.598655  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3535  Lytic transglycosylase catalytic  36.88 
 
 		 1160 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1467  tail length tape measure protein  43.88 
 
 		 857 aa  77.8  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2104  lambda family phage tail tape measure protein  43.88 
 
 		 853 aa  77.8  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000689811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00745  hypothetical protein  43.17 
 
 		 853 aa  77  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10049  tail component  43.17 
 
 		 853 aa  77  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4241  hypothetical protein  42.86 
 
 		 139 aa  73.9  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1633  putative prophage tail length tape measure protein  38.21 
 
 		 849 aa  72.4  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3396  lambda family phage tail tape measure protein  35.71 
 
 		 908 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799108  hitchhiker  0.00000000000741098 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2953  prophage LambdaSo, tail length tape meausure protein  33.33 
 
 		 914 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1195  putative prophage tail length tape measure protein  39.23 
 
 		 859 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2768  putative prophage tail length tape measure protein  39.23 
 
 		 859 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2200  prophage tail length tape measure protein, putative  35.88 
 
 		 1167 aa  69.3  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.897137 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1872  putative prophage tail length tape measure protein  39.23 
 
 		 881 aa  69.7  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179958 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3194  putative prophage tail length tape measure protein  39.23 
 
 		 881 aa  69.7  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180556 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0885  minor tail protein H  69.09 
 
 		 870 aa  68.2  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1587  Lytic transglycosylase catalytic  51.56 
 
 		 1285 aa  66.6  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1231  hypothetical protein  36.79 
 
 		 647 aa  62.8  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2989  hypothetical protein  52.54 
 
 		 1268 aa  63.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.977913  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0522  phage tail tape measure protein, TP901 family  50 
 
 		 1628 aa  62  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.389644  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3992  hypothetical protein  26.27 
 
 		 738 aa  62  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1449  TP901 family phage tail tape measure protein  32.59 
 
 		 1120 aa  61.6  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2477  hypothetical protein  25.11 
 
 		 732 aa  61.6  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0372  hypothetical protein  40 
 
 		 968 aa  61.6  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.311574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5758  hypothetical protein  34.78 
 
 		 1192 aa  61.2  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2736  hypothetical protein  26.8 
 
 		 756 aa  60.5  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0293  hypothetical protein  33.09 
 
 		 1164 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4292  hypothetical protein  33.01 
 
 		 1032 aa  57.8  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.599017  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4046  tail tape measure protein  34.08 
 
 		 1222 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374256  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2603  hypothetical protein  32.54 
 
 		 1032 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2583  phage tail tape measure protein, lambda family  33.65 
 
 		 1122 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.887267 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1175  phage tail tape measure protein, TP901 family  38.55 
 
 		 1343 aa  52  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0452  pore-forming tail tip protein  25.76 
 
 		 1023 aa  48.5  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.102086  normal  0.725254 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5700  hypothetical protein  31.55 
 
 		 457 aa  45.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1349  lambda family phage tail tape measure protein  27.23 
 
 		 853 aa  44.7  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.179371 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>