20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2414 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2414  hypothetical protein  100 
 
 
957 aa  1919    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1880  hypothetical protein  47.67 
 
 
698 aa  67.4  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.384763 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0634  hypothetical protein  45.45 
 
 
691 aa  67  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.486011  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1640  M23/M37 peptidase domain-containing protein  40.74 
 
 
2757 aa  65.1  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0251  hypothetical protein  24.09 
 
 
783 aa  64.3  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1471  hypothetical protein  59.18 
 
 
668 aa  63.5  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1615  hypothetical protein  61.22 
 
 
671 aa  63.5  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.545679 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3717  hypothetical protein  33.53 
 
 
1127 aa  59.3  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.417403 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3052  putative membrane protein, phage K related  32.82 
 
 
574 aa  54.3  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00556585  hitchhiker  0.0000266051 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2994  hypothetical protein  58.14 
 
 
717 aa  52.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1741  hypothetical protein  36.9 
 
 
486 aa  52.8  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.391392  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2403  hypothetical protein  35.64 
 
 
564 aa  51.2  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1884  hypothetical protein  31.01 
 
 
811 aa  50.8  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.505665  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2089  hypothetical protein  31.93 
 
 
735 aa  49.7  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1875  putative membrane protein, phage K related  35.64 
 
 
600 aa  49.7  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855752  hitchhiker  0.000000000791061 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1311  hypothetical protein  31.93 
 
 
735 aa  49.7  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2451  hypothetical protein  31.63 
 
 
1088 aa  49.3  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1321  hypothetical protein  33.1 
 
 
983 aa  47  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2417  phage tail tape measure protein lambda  31.76 
 
 
1063 aa  45.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.570693  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3962  hypothetical protein  57.5 
 
 
671 aa  45.1  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.443491 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>